26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_3180 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_3180  FMN-binding domain protein  100 
 
 
116 aa  227  4e-59  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.321084  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3251  FMN-binding domain protein  93.27 
 
 
114 aa  187  2.9999999999999997e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.963687  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  70.69 
 
 
134 aa  152  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0796  FMN-binding domain protein  71.55 
 
 
130 aa  151  4e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.67 
 
 
628 aa  70.1  0.00000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  40.86 
 
 
715 aa  65.5  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1780  FMN-binding domain protein  41.12 
 
 
127 aa  63.9  0.0000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  39.08 
 
 
517 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40 
 
 
640 aa  58.5  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  35.96 
 
 
597 aa  57  0.00000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  35.85 
 
 
657 aa  55.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  31.25 
 
 
126 aa  48.9  0.00002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  36.05 
 
 
591 aa  48.9  0.00002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  31.2 
 
 
123 aa  48.1  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  34.78 
 
 
650 aa  47.4  0.00007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  34.55 
 
 
637 aa  45.4  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  34.41 
 
 
702 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  32.76 
 
 
118 aa  45.1  0.0004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  33.62 
 
 
118 aa  44.7  0.0004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  28.57 
 
 
1004 aa  44.7  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  30.7 
 
 
725 aa  43.5  0.0009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  37.84 
 
 
598 aa  43.1  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  34.94 
 
 
603 aa  41.6  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  36.56 
 
 
616 aa  41.6  0.004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  39.34 
 
 
605 aa  40.4  0.009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  28 
 
 
597 aa  40.4  0.009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>