45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_21270 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_21270  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  231  3e-60  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1394  FMN-binding domain protein  51.16 
 
 		 165 aa  82.8  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24380  hypothetical protein  48.28 
 
 		 177 aa  77.4  0.00000000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2139  FMN-binding domain protein  41.94 
 
 		 123 aa  74.7  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.33 
 
 		 640 aa  63.5  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1102  FMN-binding domain protein  36.72 
 
 		 126 aa  62  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2682  FMN-binding domain protein  36.75 
 
 		 725 aa  61.2  0.000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000182081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1713  FMN-binding domain protein  43.56 
 
 		 702 aa  58.9  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0796  FMN-binding domain protein  42.39 
 
 		 130 aa  58.2  0.00000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2204  FMN-binding domain protein  34.35 
 
 		 138 aa  58.2  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0574  FMN-binding domain protein  40.54 
 
 		 657 aa  57.8  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2923  FMN-binding domain protein  33.61 
 
 		 118 aa  57.4  0.00000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  32.58 
 
 		 597 aa  56.6  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1030  FMN-binding domain protein  41.3 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1538  FMN-binding domain protein  32.2 
 
 		 118 aa  53.5  0.0000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.628376  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  40.51 
 
 		 598 aa  53.1  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41.57 
 
 		 628 aa  52.4  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3782  FMN-binding domain protein  41.58 
 
 		 715 aa  52.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00440346  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1658  FMN-binding domain protein  40 
 
 		 715 aa  52  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2117  LPXTG-motif cell wall anchor domain protein  35.29 
 
 		 169 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2009  FMN-binding domain protein  36.28 
 
 		 120 aa  50.1  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000039478  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  30.11 
 
 		 1005 aa  49.3  0.00002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0652  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  35.23 
 
 		 580 aa  49.3  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.200112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  37.63 
 
 		 650 aa  48.5  0.00003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0025  FMN-binding domain protein  40.22 
 
 		 517 aa  46.6  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2602  FMN-binding domain protein  35.87 
 
 		 181 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18790  FMN-binding domain protein  33.6 
 
 		 251 aa  46.6  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000782843  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3251  FMN-binding domain protein  34.74 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.963687  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1003  FMN-binding domain-containing protein  32.52 
 
 		 576 aa  45.8  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000126222  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  32.58 
 
 		 1004 aa  45.8  0.0002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2340  FMN-binding domain-containing protein  32.54 
 
 		 120 aa  45.4  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0930241  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  32.43 
 
 		 586 aa  45.1  0.0003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  38.55 
 
 		 623 aa  45.4  0.0003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  32.67 
 
 		 637 aa  44.7  0.0004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  33.96 
 
 		 616 aa  44.7  0.0004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 599 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  33.33 
 
 		 631 aa  43.5  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.12 
 
 		 577 aa  43.5  0.001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  33.71 
 
 		 603 aa  43.5  0.001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3180  FMN-binding domain protein  37.97 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.321084  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1083  electron transport complex, RnfABCDGE type, G subunit  32.95 
 
 		 368 aa  42.4  0.002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0590058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  31.75 
 
 		 591 aa  42  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  28.97 
 
 		 582 aa  40.8  0.007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  32.58 
 
 		 626 aa  40.4  0.008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1419  hypothetical protein  29.82 
 
 		 450 aa  40.4  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>