More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0482 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  100 
 
 
491 aa  1001    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.46 
 
 
489 aa  499  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  38.15 
 
 
485 aa  279  9e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  36.99 
 
 
514 aa  271  2.9999999999999997e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5790  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  34.61 
 
 
523 aa  234  2.0000000000000002e-60  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545575  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0579  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.93 
 
 
533 aa  228  2e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000350178  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.67 
 
 
524 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0528  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.65 
 
 
550 aa  214  2.9999999999999995e-54  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.603019  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.54 
 
 
596 aa  210  4e-53  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2757  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.78 
 
 
530 aa  197  5.000000000000001e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0532  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.1 
 
 
553 aa  195  1e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.642079  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.75 
 
 
557 aa  188  2e-46  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2695  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.49 
 
 
549 aa  183  7e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.16 
 
 
603 aa  178  2e-43  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  30.51 
 
 
584 aa  162  9e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  29.12 
 
 
596 aa  160  5e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  30.14 
 
 
599 aa  157  3e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  30.54 
 
 
511 aa  156  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  29.78 
 
 
1005 aa  155  2e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  30.57 
 
 
1004 aa  153  8e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.99 
 
 
517 aa  151  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  27.93 
 
 
519 aa  150  6e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.27 
 
 
509 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.87 
 
 
513 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.67 
 
 
530 aa  149  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.57 
 
 
598 aa  147  5e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  27.31 
 
 
560 aa  147  6e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.49 
 
 
519 aa  147  6e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  27.8 
 
 
519 aa  146  7.0000000000000006e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.16 
 
 
598 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.61 
 
 
598 aa  145  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.27 
 
 
509 aa  145  1e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.23 
 
 
588 aa  144  4e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.74 
 
 
597 aa  143  9e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.48 
 
 
596 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.45 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  31.83 
 
 
609 aa  142  1.9999999999999998e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.45 
 
 
514 aa  142  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.21 
 
 
596 aa  141  3e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.02 
 
 
514 aa  140  3.9999999999999997e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.95 
 
 
589 aa  138  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  27.99 
 
 
596 aa  138  2e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.84 
 
 
589 aa  137  3.0000000000000003e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  33.43 
 
 
564 aa  138  3.0000000000000003e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.83 
 
 
510 aa  137  4e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  28.38 
 
 
517 aa  136  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  29.1 
 
 
582 aa  136  9e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  28.69 
 
 
596 aa  136  9e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.49 
 
 
569 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  26.73 
 
 
518 aa  135  1.9999999999999998e-30  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.66 
 
 
517 aa  134  3e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  30.82 
 
 
597 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.43 
 
 
568 aa  134  5e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.71 
 
 
517 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.29 
 
 
484 aa  132  1.0000000000000001e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.42 
 
 
591 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.33 
 
 
564 aa  132  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.01 
 
 
523 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.48 
 
 
557 aa  131  3e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.22 
 
 
550 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.85 
 
 
523 aa  131  3e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3540  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.73 
 
 
580 aa  130  4.0000000000000003e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  30.48 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  28.4 
 
 
517 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  29.88 
 
 
515 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20240  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  30.92 
 
 
584 aa  130  6e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613338  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  28.26 
 
 
483 aa  129  8.000000000000001e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  29.26 
 
 
582 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.72 
 
 
457 aa  129  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.51 
 
 
463 aa  127  5e-28  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.18 
 
 
502 aa  126  8.000000000000001e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  29.37 
 
 
515 aa  126  9e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  27.18 
 
 
464 aa  126  1e-27  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.82 
 
 
562 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.79 
 
 
593 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.9 
 
 
578 aa  125  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  29.31 
 
 
597 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.71 
 
 
577 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.91 
 
 
551 aa  124  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  27.33 
 
 
542 aa  124  3e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.91 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.71 
 
 
596 aa  123  7e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.83 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.83 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.71 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.83 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.96 
 
 
465 aa  122  9.999999999999999e-27  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.83 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.85 
 
 
583 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.36 
 
 
564 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.62 
 
 
588 aa  121  3e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.46 
 
 
529 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  28.79 
 
 
510 aa  120  6e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.17 
 
 
554 aa  120  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.01 
 
 
511 aa  118  1.9999999999999998e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.66 
 
 
522 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0986  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.67 
 
 
567 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.32 
 
 
596 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  27.8 
 
 
512 aa  118  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.1 
 
 
578 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>