More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_0579 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_0579  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
533 aa  1092    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000350178  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.93 
 
 
491 aa  237  3e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.04 
 
 
524 aa  219  1e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  31.31 
 
 
485 aa  209  8e-53  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.04 
 
 
489 aa  206  1e-51  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.76 
 
 
596 aa  202  9.999999999999999e-51  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  31.46 
 
 
514 aa  187  3e-46  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.12 
 
 
557 aa  182  2e-44  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0528  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.13 
 
 
550 aa  171  3e-41  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.603019  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.43 
 
 
603 aa  162  1e-38  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2695  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.51 
 
 
549 aa  160  5e-38  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2757  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.11 
 
 
530 aa  156  1e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0532  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.35 
 
 
553 aa  146  7.0000000000000006e-34  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.642079  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5790  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  28.63 
 
 
523 aa  144  5e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.35 
 
 
597 aa  130  5.0000000000000004e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.49 
 
 
566 aa  130  7.000000000000001e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.1 
 
 
584 aa  127  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  27.1 
 
 
542 aa  125  2e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.98 
 
 
609 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.44 
 
 
534 aa  119  9.999999999999999e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 
511 aa  116  7.999999999999999e-25  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.95 
 
 
557 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.56 
 
 
517 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  27.26 
 
 
515 aa  113  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  25.91 
 
 
520 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  26.57 
 
 
518 aa  111  4.0000000000000004e-23  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.47 
 
 
517 aa  110  7.000000000000001e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.36 
 
 
566 aa  110  8.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  26.79 
 
 
519 aa  110  8.000000000000001e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.52 
 
 
598 aa  110  9.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.19 
 
 
530 aa  109  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.73 
 
 
519 aa  108  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.29 
 
 
563 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.29 
 
 
563 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.29 
 
 
563 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  26.19 
 
 
512 aa  107  5e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.86 
 
 
588 aa  107  7e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2529  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.79 
 
 
560 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.41 
 
 
502 aa  106  1e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.7 
 
 
515 aa  104  5e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.57 
 
 
510 aa  103  6e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.5 
 
 
570 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.87 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.67 
 
 
511 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 
578 aa  102  2e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.72 
 
 
560 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.1 
 
 
519 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  26.98 
 
 
515 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  24.91 
 
 
521 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.77 
 
 
563 aa  101  4e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.81 
 
 
498 aa  100  5e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.56 
 
 
514 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.56 
 
 
514 aa  100  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  26.98 
 
 
515 aa  100  7e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3521  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28 
 
 
559 aa  99.4  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.49 
 
 
564 aa  99.4  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.56 
 
 
514 aa  99.4  2e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  25.35 
 
 
521 aa  99  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2676  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.16 
 
 
557 aa  98.2  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.0264921 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  27.7 
 
 
586 aa  97.1  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0850069  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.45 
 
 
483 aa  97.4  6e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.08 
 
 
1004 aa  97.4  6e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.59 
 
 
589 aa  97.1  7e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.02 
 
 
557 aa  97.1  7e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.34 
 
 
510 aa  97.1  8e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1543  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 
584 aa  95.5  2e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.603101  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0142  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.65 
 
 
553 aa  95.5  2e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.68 
 
 
551 aa  94.7  3e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.55 
 
 
493 aa  95.1  3e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2401  flavocytochrome c flavin subunit  24.96 
 
 
505 aa  95.1  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.61 
 
 
564 aa  94.4  4e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  26.99 
 
 
504 aa  94.7  4e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.52 
 
 
586 aa  94.4  5e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.13 
 
 
503 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.28 
 
 
500 aa  94.4  5e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  25.05 
 
 
500 aa  94  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  24.43 
 
 
599 aa  94  6e-18  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.8 
 
 
509 aa  93.6  7e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.65 
 
 
554 aa  91.7  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  24.32 
 
 
1005 aa  92  3e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.2 
 
 
509 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  25.36 
 
 
506 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  24.29 
 
 
560 aa  91.3  4e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.58 
 
 
513 aa  90.9  5e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  23.48 
 
 
508 aa  90.5  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.91 
 
 
517 aa  90.5  7e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25.82 
 
 
497 aa  90.1  8e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.18 
 
 
517 aa  90.1  9e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.03 
 
 
582 aa  89.7  1e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.72 
 
 
537 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374366  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  22.16 
 
 
596 aa  89.4  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.79 
 
 
577 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.9 
 
 
598 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2398  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.4 
 
 
535 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  24.96 
 
 
550 aa  88.6  3e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.53 
 
 
562 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.770057 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.61 
 
 
586 aa  87.8  4e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.77 
 
 
561 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  25.21 
 
 
581 aa  87.8  5e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  27.03 
 
 
561 aa  87.4  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>