More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_1533 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007517  Gmet_1533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  100 
 
 
485 aa  988    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.339209 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  38.15 
 
 
491 aa  311  2e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.34 
 
 
489 aa  286  5.999999999999999e-76  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  35.56 
 
 
514 aa  274  3e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.35 
 
 
524 aa  241  2e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.47 
 
 
596 aa  223  6e-57  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0528  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.37 
 
 
550 aa  219  1e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.603019  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0579  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.31 
 
 
533 aa  216  9.999999999999999e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000350178  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.3 
 
 
557 aa  211  3e-53  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2757  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.14 
 
 
530 aa  207  2e-52  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5790  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  33.02 
 
 
523 aa  206  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545575  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  33.86 
 
 
603 aa  205  2e-51  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0532  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.8 
 
 
553 aa  197  3e-49  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.642079  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2695  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.47 
 
 
549 aa  174  2.9999999999999996e-42  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  29.16 
 
 
560 aa  167  4e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.9 
 
 
502 aa  167  5e-40  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.6 
 
 
509 aa  160  4e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.6 
 
 
509 aa  160  4e-38  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  30.37 
 
 
515 aa  157  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  30.06 
 
 
515 aa  157  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  29.64 
 
 
515 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  30.74 
 
 
598 aa  154  2.9999999999999998e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  30.1 
 
 
599 aa  154  2.9999999999999998e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.89 
 
 
523 aa  154  5e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.97 
 
 
566 aa  154  5e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.83 
 
 
598 aa  152  1e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.35 
 
 
481 aa  152  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.89 
 
 
597 aa  152  2e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.86 
 
 
598 aa  150  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  29.74 
 
 
609 aa  150  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  29.41 
 
 
589 aa  150  6e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  30.65 
 
 
550 aa  149  9e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.89 
 
 
596 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.48 
 
 
523 aa  148  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.02 
 
 
465 aa  147  4.0000000000000006e-34  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  29.8 
 
 
464 aa  145  1e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  29.35 
 
 
511 aa  146  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  29.61 
 
 
596 aa  145  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.61 
 
 
596 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.61 
 
 
596 aa  145  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.09 
 
 
584 aa  142  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2676  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.45 
 
 
557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.0264921 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.21 
 
 
532 aa  142  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.08 
 
 
514 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.08 
 
 
514 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.08 
 
 
514 aa  141  3e-32  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.88 
 
 
554 aa  139  7.999999999999999e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.13 
 
 
457 aa  138  2e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.65 
 
 
593 aa  138  2e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.89 
 
 
593 aa  138  2e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  27.13 
 
 
1005 aa  137  5e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.74 
 
 
597 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.19 
 
 
596 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  28.34 
 
 
589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.19 
 
 
596 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.19 
 
 
596 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.19 
 
 
596 aa  137  6.0000000000000005e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.71 
 
 
593 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.71 
 
 
593 aa  136  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0505  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.8 
 
 
597 aa  136  9e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.46 
 
 
596 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.46 
 
 
557 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1547  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.25 
 
 
530 aa  135  9.999999999999999e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.129043  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.18 
 
 
517 aa  135  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.42 
 
 
517 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.02 
 
 
568 aa  134  3e-30  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  28.34 
 
 
582 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.54 
 
 
591 aa  133  6.999999999999999e-30  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.36 
 
 
542 aa  133  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  27.89 
 
 
596 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.88 
 
 
571 aa  132  1.0000000000000001e-29  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.68 
 
 
519 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.35 
 
 
513 aa  132  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  26.9 
 
 
511 aa  132  2.0000000000000002e-29  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.64 
 
 
510 aa  132  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.27 
 
 
588 aa  131  3e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2704  putative FAD-binding dehydrogenase  26.17 
 
 
582 aa  131  3e-29  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.900801  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.12 
 
 
463 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.94 
 
 
582 aa  130  6e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0293  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.64 
 
 
568 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.500199  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0303  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.64 
 
 
568 aa  129  9.000000000000001e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0142  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.41 
 
 
553 aa  129  1.0000000000000001e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.65 
 
 
569 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  28.07 
 
 
583 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.26 
 
 
601 aa  128  3e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0284  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.35 
 
 
568 aa  127  4.0000000000000003e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.81 
 
 
628 aa  125  1e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.1 
 
 
564 aa  125  2e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2702  putative FAD-binding dehydrogenase  30.31 
 
 
548 aa  124  3e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0996546  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.2 
 
 
557 aa  124  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  27.92 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.83 
 
 
596 aa  124  3e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.97 
 
 
519 aa  124  5e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.12 
 
 
493 aa  123  6e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2533  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.81 
 
 
555 aa  123  7e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  26.62 
 
 
926 aa  123  9e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.46 
 
 
591 aa  122  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5094  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  32.94 
 
 
586 aa  122  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0693824  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4567  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.23 
 
 
566 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.420272  normal  0.0859343 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0895  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.97 
 
 
578 aa  122  1.9999999999999998e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>