More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Elen_2529 on replicon NC_013204
Organism: Eggerthella lenta DSM 2243



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013204  Elen_2529  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
560 aa  1149    Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.88 
 
 
596 aa  151  3e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  27.59 
 
 
598 aa  140  4.999999999999999e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.95 
 
 
534 aa  138  2e-31  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  28.78 
 
 
514 aa  137  5e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.91 
 
 
599 aa  133  6.999999999999999e-30  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.81 
 
 
598 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.95 
 
 
596 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27 
 
 
598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.34 
 
 
476 aa  129  1.0000000000000001e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.53 
 
 
584 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.37 
 
 
517 aa  126  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.73 
 
 
502 aa  125  1e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.94 
 
 
517 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0579  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.47 
 
 
533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.0000350178  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  27.72 
 
 
608 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1157  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.08 
 
 
556 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0532  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.66 
 
 
553 aa  120  4.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.642079  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13870  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27 
 
 
557 aa  120  4.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.83 
 
 
524 aa  119  9.999999999999999e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.57 
 
 
503 aa  119  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.48 
 
 
588 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2787  twin-arginine translocation pathway signal  25.77 
 
 
553 aa  118  3e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1072  flavoprotein  25.44 
 
 
598 aa  118  3e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.208394  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.63 
 
 
589 aa  117  5e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.27 
 
 
609 aa  117  7.999999999999999e-25  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  28.09 
 
 
519 aa  115  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3387  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.34 
 
 
557 aa  114  4.0000000000000004e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.8 
 
 
555 aa  114  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.449651  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.62 
 
 
500 aa  114  6e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.7 
 
 
527 aa  113  7.000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.02 
 
 
465 aa  113  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  27.5 
 
 
517 aa  113  9e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.39 
 
 
481 aa  113  9e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  27.12 
 
 
515 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.72 
 
 
491 aa  111  3e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.4 
 
 
457 aa  110  6e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.23 
 
 
602 aa  110  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.13 
 
 
519 aa  110  8.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.42 
 
 
589 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26990  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.83 
 
 
551 aa  110  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  26.94 
 
 
515 aa  110  1e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.07 
 
 
557 aa  108  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.46 
 
 
515 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.87 
 
 
484 aa  108  2e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2695  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.38 
 
 
549 aa  109  2e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.71 
 
 
519 aa  107  8e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  25.35 
 
 
603 aa  106  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.84 
 
 
489 aa  106  1e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  25.69 
 
 
506 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.44 
 
 
547 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  32.86 
 
 
517 aa  104  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  25.05 
 
 
462 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.34 
 
 
591 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.09 
 
 
523 aa  103  9e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  26.92 
 
 
596 aa  102  1e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.2 
 
 
543 aa  101  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.56 
 
 
463 aa  100  7e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.98 
 
 
491 aa  100  8e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3694  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 
559 aa  99.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0288  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.87 
 
 
557 aa  99.4  1e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.85 
 
 
589 aa  99.8  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  24.09 
 
 
586 aa  99.4  2e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3684  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.98 
 
 
592 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.504489  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3618  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.14 
 
 
560 aa  99  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  23.51 
 
 
606 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.33 
 
 
464 aa  98.2  3e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  26.36 
 
 
494 aa  98.2  3e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.49 
 
 
550 aa  98.2  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.3 
 
 
554 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  26.21 
 
 
504 aa  98.6  3e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.45 
 
 
564 aa  98.6  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  26.14 
 
 
925 aa  98.2  4e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.74 
 
 
509 aa  97.8  5e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.79 
 
 
472 aa  97.4  6e-19  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2354  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.87 
 
 
551 aa  97.4  7e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  24.64 
 
 
605 aa  96.7  9e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  25.48 
 
 
500 aa  97.1  9e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.22 
 
 
596 aa  96.3  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.72 
 
 
498 aa  95.9  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  25.83 
 
 
468 aa  95.1  3e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  26.16 
 
 
542 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.82 
 
 
510 aa  94.7  4e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  25.3 
 
 
506 aa  94.7  4e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  25.79 
 
 
925 aa  94.4  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  30.22 
 
 
515 aa  94.4  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.54 
 
 
566 aa  94  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.55 
 
 
509 aa  93.6  8e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5790  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein, N-terminal:FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 
523 aa  92.8  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.545575  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  23.51 
 
 
586 aa  93.2  1e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.81 
 
 
593 aa  93.2  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  25.22 
 
 
499 aa  92  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  26.88 
 
 
493 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4184  flavocytochrome c  23.9 
 
 
503 aa  92.4  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.159689 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.95 
 
 
483 aa  92.4  2e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.5 
 
 
557 aa  92  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13560  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.1 
 
 
549 aa  91.7  3e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.81 
 
 
583 aa  92  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2698  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.66 
 
 
591 aa  92  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.86 
 
 
572 aa  91.7  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.221964 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>