More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acry_2722 on replicon NC_009484
Organism: Acidiphilium cryptum JF-5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  73.32 
 
 		 470 aa  647    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  76.37 
 
 		 462 aa  704    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  72.61 
 
 		 465 aa  673    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 468 aa  951    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  59.14 
 
 		 479 aa  557  1e-157  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  58.57 
 
 		 469 aa  551  1e-156  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  56.74 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  56.96 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  59.91 
 
 		 474 aa  551  1e-155  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  56.74 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  56.74 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  56.74 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  57.7 
 
 		 479 aa  549  1e-155  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  57.48 
 
 		 472 aa  545  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  56.8 
 
 		 477 aa  546  1e-154  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  57.7 
 
 		 479 aa  547  1e-154  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  57.76 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  56.03 
 
 		 476 aa  543  1e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  57.61 
 
 		 469 aa  544  1e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  57.83 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  57.3 
 
 		 469 aa  542  1e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  58.26 
 
 		 468 aa  544  1e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  57.69 
 
 		 486 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  57.33 
 
 		 469 aa  524  1e-147  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  56.83 
 
 		 471 aa  524  1e-147  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  55.05 
 
 		 474 aa  519  1e-146  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  49.56 
 
 		 457 aa  427  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  45.63 
 
 		 477 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  41.91 
 
 		 432 aa  331  1e-89  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  42.13 
 
 		 434 aa  322  9.000000000000001e-87  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  40.17 
 
 		 441 aa  307  3e-82  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  36.06 
 
 		 505 aa  266  5e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  37.45 
 
 		 493 aa  240  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  36.48 
 
 		 524 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.82 
 
 		 488 aa  234  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  36.72 
 
 		 502 aa  228  2e-58  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  33.33 
 
 		 482 aa  226  9e-58  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  37.37 
 
 		 498 aa  224  3e-57  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 508 aa  220  3.9999999999999997e-56  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  35.17 
 
 		 503 aa  217  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30.43 
 
 		 530 aa  203  5e-51  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.54 
 
 		 485 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.59 
 
 		 488 aa  157  3e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.35 
 
 		 597 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.49 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 608 aa  112  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.95 
 
 		 464 aa  111  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.46 
 
 		 534 aa  97.8  4e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 591 aa  96.7  7e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  23.63 
 
 		 493 aa  96.3  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  30.25 
 
 		 577 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  24.58 
 
 		 588 aa  93.6  7e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.05 
 
 		 1005 aa  92.8  1e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.59 
 
 		 589 aa  92.4  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.16 
 
 		 465 aa  92.8  1e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.79 
 
 		 482 aa  90.9  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.08 
 
 		 460 aa  90.5  5e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.8 
 
 		 483 aa  90.9  5e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  30.1 
 
 		 572 aa  90.1  7e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.69 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.82 
 
 		 470 aa  87.4  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.74 
 
 		 589 aa  87  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.09 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.79 
 
 		 481 aa  87  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  29.2 
 
 		 570 aa  86.7  8e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.8 
 
 		 519 aa  86.7  9e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  24.52 
 
 		 925 aa  85.9  0.000000000000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.2 
 
 		 457 aa  85.9  0.000000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  23.96 
 
 		 591 aa  85.5  0.000000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.05 
 
 		 593 aa  85.1  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  24.05 
 
 		 599 aa  85.9  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.34 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  30.19 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  28.01 
 
 		 570 aa  84.7  0.000000000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.62 
 
 		 598 aa  84  0.000000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2529  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.74 
 
 		 560 aa  84  0.000000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.31 
 
 		 637 aa  84  0.000000000000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  25.37 
 
 		 925 aa  84  0.000000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  30.19 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.02 
 
 		 596 aa  83.6  0.000000000000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  24.75 
 
 		 609 aa  83.2  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20240  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.34 
 
 		 584 aa  81.6  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613338  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  24.49 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  26.42 
 
 		 596 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.23 
 
 		 543 aa  81.3  0.00000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  25.11 
 
 		 542 aa  80.9  0.00000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  22.65 
 
 		 519 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.42 
 
 		 589 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  24.8 
 
 		 517 aa  79.7  0.00000000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  24.02 
 
 		 926 aa  79.7  0.0000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  24.2 
 
 		 1004 aa  79.3  0.0000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  26.63 
 
 		 487 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.78 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.78 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.42 
 
 		 597 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  26.21 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.26 
 
 		 598 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.78 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  26.63 
 
 		 487 aa  79  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.78 
 
 		 596 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>