More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_8556 on replicon NC_011892
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  78.28 
 
 		 465 aa  719    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  76.37 
 
 		 468 aa  704    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 462 aa  943    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  77.11 
 
 		 470 aa  674    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  59.53 
 
 		 479 aa  569  1e-161  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  57.83 
 
 		 476 aa  554  1e-156  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  58.26 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  59.48 
 
 		 472 aa  550  1e-155  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  58.26 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  58.48 
 
 		 467 aa  549  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  58.26 
 
 		 467 aa  548  1e-155  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  58.95 
 
 		 469 aa  550  1e-155  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  59.69 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  58.03 
 
 		 486 aa  546  1e-154  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  58.04 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  57.3 
 
 		 477 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  59.21 
 
 		 474 aa  540  9.999999999999999e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  57.58 
 
 		 479 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  58.13 
 
 		 468 aa  538  9.999999999999999e-153  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  58.17 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  57.92 
 
 		 469 aa  536  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  57.52 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  56.28 
 
 		 479 aa  532  1e-150  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  57.73 
 
 		 471 aa  534  1e-150  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  57.36 
 
 		 469 aa  530  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  56.47 
 
 		 474 aa  526  1e-148  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  49.56 
 
 		 457 aa  404  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  43.24 
 
 		 432 aa  337  3.9999999999999995e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  44.64 
 
 		 477 aa  325  1e-87  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  42.16 
 
 		 434 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  42.27 
 
 		 441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  37.92 
 
 		 524 aa  249  5e-65  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  35.15 
 
 		 505 aa  247  3e-64  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  35.11 
 
 		 482 aa  241  2e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.29 
 
 		 488 aa  240  4e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  36.59 
 
 		 498 aa  232  9e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  36.99 
 
 		 493 aa  232  1e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  32.93 
 
 		 508 aa  229  8e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  35.26 
 
 		 502 aa  219  1e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  34.02 
 
 		 503 aa  207  3e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30 
 
 		 530 aa  192  1e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.44 
 
 		 488 aa  167  5e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.01 
 
 		 485 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.37 
 
 		 502 aa  124  5e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  27.33 
 
 		 464 aa  120  7e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.3 
 
 		 597 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.64 
 
 		 588 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.36 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.95 
 
 		 465 aa  113  8.000000000000001e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.57 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.84 
 
 		 608 aa  107  4e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.42 
 
 		 482 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.52 
 
 		 589 aa  103  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30 
 
 		 463 aa  101  3e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.66 
 
 		 460 aa  99.4  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.66 
 
 		 470 aa  99  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.71 
 
 		 491 aa  94.4  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2529  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.05 
 
 		 560 aa  93.2  8e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  25.32 
 
 		 925 aa  92.8  1e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  25.64 
 
 		 925 aa  92.8  1e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.73 
 
 		 534 aa  92.8  1e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  29.01 
 
 		 487 aa  92  2e-17  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  26.5 
 
 		 1004 aa  91.7  2e-17  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  24.24 
 
 		 926 aa  92  2e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.75 
 
 		 596 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  29.25 
 
 		 596 aa  91.7  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.36 
 
 		 596 aa  91.3  3e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  27.8 
 
 		 483 aa  90.9  4e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  29.38 
 
 		 570 aa  90.5  5e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.05 
 
 		 523 aa  90.5  6e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.77 
 
 		 584 aa  90.1  7e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  29.38 
 
 		 570 aa  89.7  9e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  26.86 
 
 		 542 aa  89  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.2 
 
 		 596 aa  89.4  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.18 
 
 		 593 aa  89.7  1e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  29.38 
 
 		 570 aa  89.7  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  29.3 
 
 		 471 aa  89  2e-16  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.82 
 
 		 591 aa  89  2e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.57 
 
 		 517 aa  88.2  3e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  26.82 
 
 		 1005 aa  87.8  4e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.73 
 
 		 589 aa  87.8  4e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0086  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.2 
 
 		 515 aa  87.8  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 596 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.34 
 
 		 481 aa  87.4  5e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 596 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 596 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  28.27 
 
 		 596 aa  87.4  5e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  28.68 
 
 		 577 aa  87  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.25 
 
 		 491 aa  87  6e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.79 
 
 		 597 aa  87  7e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.31 
 
 		 609 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.43 
 
 		 519 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.79 
 
 		 596 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.59 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26 
 
 		 591 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  24.56 
 
 		 650 aa  84.3  0.000000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  28.35 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  27.2 
 
 		 658 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  28.03 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.98 
 
 		 554 aa  83.2  0.000000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>