More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B2502 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  81.97 
 
 		 469 aa  793    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  82.81 
 
 		 469 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  75.42 
 
 		 474 aa  728    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  79.24 
 
 		 467 aa  776    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  75.73 
 
 		 486 aa  756    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  77.71 
 
 		 479 aa  776    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 472 aa  977    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  82 
 
 		 469 aa  793    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  82.57 
 
 		 477 aa  806    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  83.7 
 
 		 476 aa  810    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  81.37 
 
 		 469 aa  791    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  79.45 
 
 		 467 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  81.84 
 
 		 468 aa  793    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  80.57 
 
 		 474 aa  776    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  79.16 
 
 		 479 aa  752    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  79.45 
 
 		 467 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  79.41 
 
 		 469 aa  783    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  78.94 
 
 		 479 aa  751    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  77.44 
 
 		 471 aa  763    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  81.29 
 
 		 469 aa  791    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  79.66 
 
 		 467 aa  779    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  79.45 
 
 		 467 aa  777    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  59.48 
 
 		 462 aa  550  1e-155  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  57.48 
 
 		 468 aa  545  1e-154  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  56.22 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  57.4 
 
 		 470 aa  500  1e-140  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  48.04 
 
 		 457 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  43.91 
 
 		 477 aa  318  1e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  39.91 
 
 		 432 aa  309  5.9999999999999995e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  41.05 
 
 		 434 aa  304  2.0000000000000002e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  38.66 
 
 		 441 aa  296  5e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  36.27 
 
 		 505 aa  238  1e-61  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.06 
 
 		 488 aa  230  3e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  37.14 
 
 		 524 aa  227  3e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  33.19 
 
 		 482 aa  206  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  34.42 
 
 		 502 aa  196  9e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  31.82 
 
 		 508 aa  194  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  33.95 
 
 		 498 aa  192  1e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  31.27 
 
 		 530 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  33.06 
 
 		 493 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.19 
 
 		 488 aa  181  2e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  32.99 
 
 		 503 aa  181  2.9999999999999997e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.31 
 
 		 485 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.18 
 
 		 588 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.29 
 
 		 493 aa  112  2.0000000000000002e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.14 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.06 
 
 		 464 aa  104  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.35 
 
 		 534 aa  101  3e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.62 
 
 		 591 aa  100  6e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.36 
 
 		 589 aa  100  8e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.97 
 
 		 596 aa  98.6  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  27.97 
 
 		 596 aa  97.4  4e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.99 
 
 		 519 aa  97.1  6e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.75 
 
 		 597 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.23 
 
 		 589 aa  94.7  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.77 
 
 		 596 aa  94.7  3e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.16 
 
 		 589 aa  94  5e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.94 
 
 		 470 aa  94  6e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.77 
 
 		 596 aa  92.8  1e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.34 
 
 		 596 aa  90.9  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.4 
 
 		 517 aa  90.5  6e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 517 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  30.29 
 
 		 577 aa  89.4  1e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.53 
 
 		 608 aa  89.4  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.28 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.29 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.29 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.29 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25 
 
 		 465 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  29.84 
 
 		 623 aa  89  2e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.76 
 
 		 597 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.29 
 
 		 596 aa  89  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  27.07 
 
 		 500 aa  89  2e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.54 
 
 		 482 aa  88.2  3e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  26.01 
 
 		 517 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.89 
 
 		 593 aa  87.8  4e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.9 
 
 		 598 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  27.71 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  27.71 
 
 		 493 aa  87.4  5e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  27.71 
 
 		 658 aa  87.4  6e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.31 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  23.31 
 
 		 598 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.01 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1365  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.05 
 
 		 628 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.24 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3220  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.66 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.44 
 
 		 460 aa  82.4  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.2 
 
 		 507 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  26.93 
 
 		 525 aa  82  0.00000000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2704  putative FAD-binding dehydrogenase  28.61 
 
 		 582 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.900801  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.13 
 
 		 510 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.42 
 
 		 583 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.13 
 
 		 591 aa  81.6  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  26.22 
 
 		 507 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  24.47 
 
 		 483 aa  81.3  0.00000000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25.11 
 
 		 596 aa  80.5  0.00000000000006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  24.24 
 
 		 504 aa  80.5  0.00000000000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25 
 
 		 596 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.33 
 
 		 512 aa  80.1  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.25 
 
 		 609 aa  80.1  0.00000000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>