More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4211 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  76.41 
 
 		 465 aa  700    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  73.57 
 
 		 468 aa  687    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  77.34 
 
 		 462 aa  715    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 470 aa  960    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  57.92 
 
 		 469 aa  545  1e-154  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  57.92 
 
 		 467 aa  543  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  59 
 
 		 469 aa  543  1e-153  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  57.67 
 
 		 479 aa  542  1e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  58.35 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  58.13 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  58.13 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  58.13 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  57.05 
 
 		 476 aa  540  9.999999999999999e-153  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  57.92 
 
 		 469 aa  537  1e-151  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  57.33 
 
 		 469 aa  535  1e-151  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  57.08 
 
 		 486 aa  532  1e-150  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  57.36 
 
 		 472 aa  532  1e-150  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  56.83 
 
 		 477 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  57.87 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  59.04 
 
 		 474 aa  530  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  57.48 
 
 		 468 aa  529  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  56.77 
 
 		 469 aa  523  1e-147  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  57.46 
 
 		 479 aa  524  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  57.24 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  56.25 
 
 		 474 aa  514  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  55.6 
 
 		 471 aa  511  1e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  48.29 
 
 		 457 aa  394  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  40.13 
 
 		 432 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  43.45 
 
 		 477 aa  313  4.999999999999999e-84  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  40.53 
 
 		 434 aa  304  3.0000000000000004e-81  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  39.04 
 
 		 441 aa  297  3e-79  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  35.46 
 
 		 505 aa  252  1e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  37.34 
 
 		 524 aa  237  3e-61  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  36.38 
 
 		 493 aa  231  2e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.24 
 
 		 488 aa  224  2e-57  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  33.2 
 
 		 508 aa  223  8e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  36.07 
 
 		 502 aa  215  9.999999999999999e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  32.56 
 
 		 482 aa  209  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  34.43 
 
 		 498 aa  206  6e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  34.16 
 
 		 503 aa  206  7e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  29.21 
 
 		 530 aa  184  3e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.48 
 
 		 485 aa  166  8e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.85 
 
 		 488 aa  158  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.2 
 
 		 597 aa  124  5e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.98 
 
 		 502 aa  115  2.0000000000000002e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.28 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.58 
 
 		 493 aa  109  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.73 
 
 		 608 aa  108  1e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  28.54 
 
 		 591 aa  103  6e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  27.12 
 
 		 598 aa  103  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.75 
 
 		 588 aa  103  8e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.39 
 
 		 596 aa  103  9e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.71 
 
 		 598 aa  101  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.18 
 
 		 597 aa  100  5e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.24 
 
 		 593 aa  100  5e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.6 
 
 		 491 aa  100  6e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  29.03 
 
 		 483 aa  99.8  9e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  25 
 
 		 925 aa  99  1e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.97 
 
 		 596 aa  99.4  1e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.18 
 
 		 596 aa  99.8  1e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.63 
 
 		 534 aa  98.2  3e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.48 
 
 		 589 aa  98.2  3e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  26.39 
 
 		 515 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  25.98 
 
 		 515 aa  97.1  6e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.65 
 
 		 460 aa  96.3  1e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.41 
 
 		 616 aa  95.9  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27 
 
 		 596 aa  96.3  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.57 
 
 		 584 aa  95.9  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.54 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.54 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.71 
 
 		 465 aa  95.1  2e-18  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.54 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.54 
 
 		 596 aa  95.5  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.75 
 
 		 596 aa  94.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  25.26 
 
 		 925 aa  94.4  4e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  26.23 
 
 		 542 aa  94  6e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.33 
 
 		 481 aa  93.6  8e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.89 
 
 		 470 aa  92  2e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.2 
 
 		 464 aa  92  2e-17  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  25.49 
 
 		 515 aa  91.7  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 589 aa  91.3  3e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.72 
 
 		 503 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.25 
 
 		 609 aa  90.5  5e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  28.15 
 
 		 577 aa  90.1  7e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.75 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.77 
 
 		 637 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.11 
 
 		 589 aa  88.6  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.33 
 
 		 463 aa  88.2  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  26.24 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  26.24 
 
 		 493 aa  86.7  8e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.24 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  26.05 
 
 		 658 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.7 
 
 		 500 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.66 
 
 		 523 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.9 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.82 
 
 		 517 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.31 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  26.72 
 
 		 487 aa  84.3  0.000000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.44 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>