224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A2986 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 477 aa  931    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  45.63 
 
 		 468 aa  370  1e-101  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  47.73 
 
 		 457 aa  357  1.9999999999999998e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  44.64 
 
 		 462 aa  356  5.999999999999999e-97  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  42.98 
 
 		 476 aa  350  4e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  43.91 
 
 		 472 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  44.01 
 
 		 468 aa  346  4e-94  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  44.74 
 
 		 465 aa  345  1e-93  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  44.23 
 
 		 467 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  44.01 
 
 		 467 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  44.01 
 
 		 467 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  44.01 
 
 		 467 aa  344  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  43.45 
 
 		 469 aa  343  5e-93  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  43.79 
 
 		 467 aa  342  7e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  43.79 
 
 		 469 aa  342  1e-92  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  42.89 
 
 		 477 aa  340  4e-92  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  43.79 
 
 		 474 aa  340  4e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  43.36 
 
 		 469 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  42.58 
 
 		 479 aa  335  9e-91  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  42.48 
 
 		 469 aa  332  6e-90  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  42.61 
 
 		 479 aa  331  1e-89  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  42.83 
 
 		 479 aa  331  2e-89  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  43.78 
 
 		 469 aa  330  4e-89  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  41.74 
 
 		 471 aa  330  4e-89  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  42.05 
 
 		 469 aa  329  7e-89  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  40.68 
 
 		 486 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  41.38 
 
 		 474 aa  326  6e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  44 
 
 		 432 aa  318  1e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  45.59 
 
 		 441 aa  317  3e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  42.79 
 
 		 470 aa  310  4e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  41.46 
 
 		 434 aa  286  7e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  31.01 
 
 		 508 aa  165  2.0000000000000002e-39  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  30.02 
 
 		 482 aa  154  4e-36  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.61 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  29.77 
 
 		 505 aa  147  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  31.64 
 
 		 493 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  28.02 
 
 		 530 aa  136  8e-31  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  30.67 
 
 		 524 aa  135  9.999999999999999e-31  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.56 
 
 		 485 aa  131  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  30.41 
 
 		 503 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.72 
 
 		 488 aa  118  3e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  27.72 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  27.24 
 
 		 502 aa  103  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.73 
 
 		 534 aa  91.3  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.8 
 
 		 598 aa  90.1  8e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.79 
 
 		 588 aa  89  2e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.78 
 
 		 481 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.64 
 
 		 493 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.8 
 
 		 598 aa  85.1  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.59 
 
 		 589 aa  80.9  0.00000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  28.57 
 
 		 483 aa  78.6  0.0000000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.31 
 
 		 470 aa  77  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.62 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.71 
 
 		 597 aa  75.1  0.000000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.32 
 
 		 1004 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.74 
 
 		 596 aa  73.9  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0688  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.22 
 
 		 454 aa  73.6  0.000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0793917  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.65 
 
 		 460 aa  73.2  0.00000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  23.17 
 
 		 464 aa  72.8  0.00000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.26 
 
 		 589 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  24.74 
 
 		 507 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  23.85 
 
 		 517 aa  67.8  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  25.49 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  25.49 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  25.49 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  25.49 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 596 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.89 
 
 		 596 aa  67  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  25.43 
 
 		 597 aa  67  0.0000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  24.79 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  24.84 
 
 		 596 aa  66.6  0.0000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25 
 
 		 589 aa  66.2  0.000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.62 
 
 		 465 aa  65.1  0.000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.61 
 
 		 519 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  22.73 
 
 		 608 aa  65.1  0.000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.56 
 
 		 578 aa  64.3  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  23.53 
 
 		 926 aa  64.3  0.000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.72 
 
 		 577 aa  63.9  0.000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  23.85 
 
 		 650 aa  63.9  0.000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.8 
 
 		 463 aa  63.9  0.000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  23.52 
 
 		 596 aa  63.5  0.000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4753  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.61 
 
 		 554 aa  63.2  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.254581  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  23.7 
 
 		 584 aa  62.8  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.43 
 
 		 502 aa  62.8  0.00000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  23.62 
 
 		 583 aa  62.4  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  22.97 
 
 		 519 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.07 
 
 		 491 aa  62  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  23.79 
 
 		 596 aa  61.2  0.00000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  22.93 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  30.69 
 
 		 500 aa  61.2  0.00000004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  25.6 
 
 		 631 aa  60.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.33 
 
 		 519 aa  60.5  0.00000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.31 
 
 		 593 aa  60.1  0.00000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.42 
 
 		 517 aa  60.1  0.00000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  24.84 
 
 		 497 aa  60.1  0.00000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2287  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.85 
 
 		 558 aa  59.3  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.558415  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  24.32 
 
 		 627 aa  58.5  0.0000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  23.29 
 
 		 517 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.3 
 
 		 484 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  26.68 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>