More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_2274 on replicon NC_009720
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  72.61 
 
 		 468 aa  690    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  76.38 
 
 		 470 aa  679    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 465 aa  950    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  78.28 
 
 		 462 aa  734    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  58.17 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  58.39 
 
 		 467 aa  546  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  58.17 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  58.17 
 
 		 467 aa  545  1e-154  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  57.95 
 
 		 467 aa  544  1e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  57.52 
 
 		 479 aa  541  9.999999999999999e-153  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  56.93 
 
 		 469 aa  538  9.999999999999999e-153  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  55.53 
 
 		 486 aa  536  1e-151  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  55.72 
 
 		 477 aa  535  1e-151  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  55.17 
 
 		 476 aa  535  1e-151  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  56.86 
 
 		 469 aa  532  1e-150  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  57.56 
 
 		 469 aa  534  1e-150  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  56.21 
 
 		 469 aa  533  1e-150  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  56.22 
 
 		 472 aa  530  1e-149  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  56.16 
 
 		 468 aa  530  1e-149  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  55.6 
 
 		 469 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  55.48 
 
 		 479 aa  527  1e-148  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  55.12 
 
 		 469 aa  522  1e-147  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  56.64 
 
 		 474 aa  524  1e-147  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  54.62 
 
 		 479 aa  520  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  55.34 
 
 		 471 aa  515  1.0000000000000001e-145  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  53.85 
 
 		 474 aa  512  1e-144  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  49.89 
 
 		 457 aa  425  1e-118  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  42.35 
 
 		 432 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  44.74 
 
 		 477 aa  332  7.000000000000001e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  42.42 
 
 		 434 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  42.86 
 
 		 441 aa  320  3e-86  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  38.91 
 
 		 524 aa  256  5e-67  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  35.64 
 
 		 505 aa  254  2.0000000000000002e-66  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  36.51 
 
 		 493 aa  237  3e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.32 
 
 		 488 aa  232  9e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  34.04 
 
 		 482 aa  232  1e-59  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  32.39 
 
 		 508 aa  228  3e-58  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  35.74 
 
 		 502 aa  224  3e-57  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  35.92 
 
 		 498 aa  208  2e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30.95 
 
 		 530 aa  196  6e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  33.26 
 
 		 503 aa  196  8.000000000000001e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  30.13 
 
 		 485 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.42 
 
 		 488 aa  150  6e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  29.52 
 
 		 597 aa  142  9.999999999999999e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.32 
 
 		 502 aa  140  7e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.82 
 
 		 608 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.32 
 
 		 534 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.83 
 
 		 493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.87 
 
 		 460 aa  115  1.0000000000000001e-24  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.81 
 
 		 591 aa  114  3e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.97 
 
 		 925 aa  113  9e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.74 
 
 		 457 aa  110  5e-23  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.57 
 
 		 588 aa  110  6e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.2 
 
 		 591 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.21 
 
 		 464 aa  108  1e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.26 
 
 		 465 aa  107  3e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  30.02 
 
 		 596 aa  107  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.85 
 
 		 589 aa  106  7e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.99 
 
 		 598 aa  106  7e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  27.71 
 
 		 925 aa  106  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.78 
 
 		 598 aa  105  2e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.43 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.11 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  29.6 
 
 		 596 aa  104  3e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  27.33 
 
 		 957 aa  104  4e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  30.02 
 
 		 596 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  26.13 
 
 		 635 aa  103  6e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.96 
 
 		 596 aa  103  8e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  27.48 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.71 
 
 		 519 aa  102  2e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  28.93 
 
 		 517 aa  101  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.61 
 
 		 491 aa  101  4e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  27.59 
 
 		 517 aa  100  4e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.6 
 
 		 593 aa  100  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.88 
 
 		 589 aa  100  6e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  29.45 
 
 		 596 aa  99.4  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.97 
 
 		 589 aa  99.8  1e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.16 
 
 		 482 aa  99.4  1e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  27.31 
 
 		 583 aa  99.4  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.59 
 
 		 517 aa  98.6  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29 
 
 		 470 aa  98.6  2e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  24.5 
 
 		 926 aa  97.1  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  24.9 
 
 		 497 aa  95.1  3e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.57 
 
 		 596 aa  93.6  7e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.1 
 
 		 609 aa  93.2  9e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.69 
 
 		 584 aa  92.4  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  24.82 
 
 		 650 aa  92  2e-17  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  25.4 
 
 		 560 aa  92  2e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.22 
 
 		 543 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 637 aa  92  2e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.95 
 
 		 577 aa  91.7  3e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.65 
 
 		 599 aa  91.3  4e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.17 
 
 		 481 aa  89.7  9e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  26.21 
 
 		 631 aa  89.4  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  27.03 
 
 		 519 aa  89.4  1e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3582  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.48 
 
 		 492 aa  89.4  1e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.82 
 
 		 519 aa  88.6  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>