More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3582 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_3582  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
492 aa  970    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1349  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  35.56 
 
 
439 aa  162  1e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.157144  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.78 
 
 
464 aa  112  2.0000000000000002e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.92 
 
 
465 aa  112  2.0000000000000002e-23  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  29.44 
 
 
637 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  29.22 
 
 
503 aa  110  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.64 
 
 
523 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.28 
 
 
591 aa  105  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.06 
 
 
457 aa  104  3e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  28.4 
 
 
505 aa  103  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.16 
 
 
539 aa  103  8e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.69 
 
 
616 aa  102  2e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  25.87 
 
 
599 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.38 
 
 
596 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.94 
 
 
536 aa  100  6e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  30.84 
 
 
524 aa  100  7e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.48 
 
 
598 aa  99  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.53 
 
 
593 aa  98.2  3e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  34.42 
 
 
577 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.46 
 
 
502 aa  97.4  6e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.14 
 
 
593 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.14 
 
 
593 aa  96.7  8e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.06 
 
 
598 aa  96.7  8e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.26 
 
 
609 aa  96.3  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.43 
 
 
509 aa  96.3  1e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  28.2 
 
 
616 aa  95.5  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.08 
 
 
511 aa  95.5  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.74 
 
 
485 aa  94.4  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.96 
 
 
584 aa  94.4  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  27.74 
 
 
482 aa  94  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.85 
 
 
588 aa  94  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.75 
 
 
589 aa  94  6e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  26.28 
 
 
596 aa  93.6  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.06 
 
 
488 aa  93.2  8e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29 
 
 
491 aa  93.2  9e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  32.11 
 
 
570 aa  93.2  9e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.2 
 
 
598 aa  92.8  1e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  27.86 
 
 
465 aa  92.8  1e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2427  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.34 
 
 
599 aa  92  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.250716 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.37 
 
 
591 aa  92  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.37 
 
 
509 aa  91.3  4e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.64 
 
 
589 aa  91.3  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  26.81 
 
 
498 aa  90.9  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  25.6 
 
 
668 aa  90.5  6e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2403  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.07 
 
 
604 aa  90.5  6e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  25.97 
 
 
583 aa  90.1  8e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  25.53 
 
 
597 aa  89.7  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  24.57 
 
 
596 aa  89.4  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.82 
 
 
564 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.74 
 
 
568 aa  87.8  4e-16  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25.16 
 
 
596 aa  87.8  4e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  28.1 
 
 
468 aa  87.4  5e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  26.23 
 
 
493 aa  87.4  6e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  26.36 
 
 
626 aa  87.4  6e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25.47 
 
 
596 aa  86.7  8e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  26.57 
 
 
631 aa  86.7  9e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  23.97 
 
 
608 aa  86.3  0.000000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.46 
 
 
543 aa  85.9  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2292  putative succinate dehydrogenase  29 
 
 
558 aa  86.3  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.32 
 
 
1005 aa  85.5  0.000000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0465  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.07 
 
 
524 aa  85.9  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.79 
 
 
640 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  31.23 
 
 
570 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.73 
 
 
925 aa  84.7  0.000000000000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.03 
 
 
601 aa  85.1  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.95 
 
 
523 aa  84.3  0.000000000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  25.9 
 
 
502 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.94 
 
 
476 aa  84  0.000000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.37 
 
 
523 aa  83.6  0.000000000000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1839  3-oxosteroid 1-dehydrogenase  27.33 
 
 
564 aa  83.6  0.000000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121411  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  26.72 
 
 
508 aa  82.8  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3789  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  28.05 
 
 
533 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  24.12 
 
 
504 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  24.26 
 
 
650 aa  83.2  0.00000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3862  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.05 
 
 
533 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314999  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0571  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.44 
 
 
595 aa  83.2  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3793  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.05 
 
 
533 aa  83.2  0.00000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445361  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2605  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.38 
 
 
562 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.800932  normal  0.0451497 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  25.05 
 
 
507 aa  82  0.00000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3683  putative FAD-binding dehydrogenase  30.81 
 
 
583 aa  81.6  0.00000000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.87 
 
 
481 aa  81.6  0.00000000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6094  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.82 
 
 
589 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00173054  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  23.64 
 
 
926 aa  80.9  0.00000000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  29.46 
 
 
570 aa  80.1  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1792  3-oxosteroid 1-dehydrogenase  24.56 
 
 
563 aa  80.1  0.00000000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157211  normal  0.304525 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  29.46 
 
 
570 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2629  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.12 
 
 
549 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.788807 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6102  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.81 
 
 
581 aa  79.3  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.113124  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5555  putative FAD-binding dehydrogenase  27.75 
 
 
555 aa  79.7  0.0000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3220  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.23 
 
 
560 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  26.53 
 
 
462 aa  79  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  27.11 
 
 
432 aa  78.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2893  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.87 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3120  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.74 
 
 
562 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7441  putative FAD-binding dehydrogenase  25 
 
 
598 aa  77.4  0.0000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590013  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  23.52 
 
 
925 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.1 
 
 
546 aa  76.3  0.000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.52 
 
 
534 aa  76.3  0.000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4718  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.3 
 
 
564 aa  75.5  0.000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.329428 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.59 
 
 
577 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>