More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5093 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  73.86 
 
 
503 aa  716    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 
498 aa  1010    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  78.38 
 
 
502 aa  750    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  44.79 
 
 
505 aa  418  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  46.89 
 
 
488 aa  382  1e-105  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  46.53 
 
 
524 aa  377  1e-103  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  45.57 
 
 
482 aa  372  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  41.62 
 
 
530 aa  351  2e-95  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  43.09 
 
 
493 aa  347  3e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  37.1 
 
 
508 aa  278  2e-73  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  37.03 
 
 
462 aa  253  7e-66  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  37.9 
 
 
468 aa  249  6e-65  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  35.39 
 
 
465 aa  223  8e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  34.79 
 
 
476 aa  220  6e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  34.87 
 
 
477 aa  215  9.999999999999999e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  34.94 
 
 
472 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  34.06 
 
 
479 aa  212  1e-53  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  33.67 
 
 
469 aa  208  2e-52  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  34.2 
 
 
474 aa  206  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  34.69 
 
 
470 aa  204  4e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  32.25 
 
 
467 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  32.25 
 
 
467 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  32.25 
 
 
467 aa  201  3e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  32.05 
 
 
467 aa  200  3.9999999999999996e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  33.27 
 
 
486 aa  199  7e-50  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  32.05 
 
 
467 aa  199  7.999999999999999e-50  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  33.94 
 
 
468 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  34.75 
 
 
471 aa  198  2.0000000000000003e-49  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  33 
 
 
469 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  33.6 
 
 
469 aa  197  5.000000000000001e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  32.92 
 
 
469 aa  196  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  33.6 
 
 
469 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  32.79 
 
 
479 aa  194  2e-48  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  32.99 
 
 
479 aa  194  3e-48  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  32.23 
 
 
474 aa  192  9e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  33.2 
 
 
469 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  32.3 
 
 
485 aa  178  2e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.71 
 
 
488 aa  177  3e-43  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  30.96 
 
 
457 aa  140  7e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  29.6 
 
 
460 aa  119  9e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0232  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.44 
 
 
523 aa  118  1.9999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0397857  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  26.54 
 
 
464 aa  117  6e-25  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.36 
 
 
482 aa  112  1.0000000000000001e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  28.6 
 
 
477 aa  109  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0355  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  29.38 
 
 
471 aa  108  2e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  29.04 
 
 
586 aa  108  3e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  30.06 
 
 
586 aa  107  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  26.8 
 
 
504 aa  107  5e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.27 
 
 
502 aa  107  5e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.29 
 
 
637 aa  106  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  28.65 
 
 
560 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.86 
 
 
493 aa  105  2e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.36 
 
 
597 aa  105  2e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  28.21 
 
 
483 aa  103  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.04 
 
 
470 aa  102  2e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  28.19 
 
 
432 aa  101  3e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.41 
 
 
1005 aa  100  4e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.73 
 
 
608 aa  101  4e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3582  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.73 
 
 
492 aa  100  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.381566 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.63 
 
 
491 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  26.9 
 
 
497 aa  99  2e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3613  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  56.41 
 
 
377 aa  97.4  5e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  26.93 
 
 
582 aa  96.7  8e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.19 
 
 
463 aa  95.9  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.69 
 
 
588 aa  96.3  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.2 
 
 
609 aa  95.1  2e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0462  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.04 
 
 
536 aa  94.7  3e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.25 
 
 
569 aa  95.1  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0465  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.08 
 
 
524 aa  93.6  7e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  26.79 
 
 
635 aa  92.8  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.77 
 
 
491 aa  93.2  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3358  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.95 
 
 
564 aa  92.8  1e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.7 
 
 
491 aa  92.8  1e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.89 
 
 
509 aa  92  2e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.04 
 
 
582 aa  92.4  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  26.14 
 
 
599 aa  92  2e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  26.68 
 
 
582 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  26.68 
 
 
582 aa  92  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  27.63 
 
 
434 aa  91.7  3e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.69 
 
 
509 aa  91.7  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0575  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.1 
 
 
543 aa  91.7  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.00343904  normal  0.0982705 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0224  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.58 
 
 
539 aa  90.9  5e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.31 
 
 
616 aa  90.5  6e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.49 
 
 
589 aa  90.5  6e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.5 
 
 
596 aa  90.1  8e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.71 
 
 
457 aa  89.4  1e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0682  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.77 
 
 
640 aa  89.4  1e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000305666  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.59 
 
 
465 aa  89  2e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.28 
 
 
532 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2796  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.64 
 
 
578 aa  88.6  2e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000175303 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.76 
 
 
584 aa  88.2  3e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.22 
 
 
524 aa  88.6  3e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  24.95 
 
 
1004 aa  88.2  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  29.71 
 
 
500 aa  88.6  3e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.9 
 
 
616 aa  87.4  5e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.16 
 
 
476 aa  87.4  5e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5986  putative fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein  27.58 
 
 
459 aa  87  7e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.253677 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  26.39 
 
 
582 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.09 
 
 
529 aa  86.3  0.000000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  25.05 
 
 
596 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>