More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5148 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  82 
 
 		 479 aa  771    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 469 aa  965    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  88.04 
 
 		 469 aa  841    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  77.15 
 
 		 486 aa  761    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  78.16 
 
 		 479 aa  775    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  81.78 
 
 		 472 aa  798    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  85.93 
 
 		 477 aa  839    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  81.45 
 
 		 467 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  81.24 
 
 		 467 aa  787    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  81.45 
 
 		 467 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  81.45 
 
 		 467 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  87.42 
 
 		 469 aa  852    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  77.56 
 
 		 474 aa  749    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  81.45 
 
 		 467 aa  788    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  87.98 
 
 		 468 aa  847    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  85.87 
 
 		 469 aa  831    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  86.9 
 
 		 469 aa  833    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  82.28 
 
 		 474 aa  779    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  85.19 
 
 		 476 aa  814    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  79.44 
 
 		 469 aa  775    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  81.11 
 
 		 479 aa  762    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  78.25 
 
 		 471 aa  759    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  60 
 
 		 462 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  57.73 
 
 		 468 aa  536  1e-151  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  57.86 
 
 		 465 aa  530  1e-149  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  58.06 
 
 		 470 aa  508  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  47.93 
 
 		 457 aa  393  1e-108  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  44.23 
 
 		 477 aa  311  2e-83  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  39.47 
 
 		 432 aa  306  4.0000000000000004e-82  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  40.83 
 
 		 434 aa  297  2e-79  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  37.74 
 
 		 441 aa  283  6.000000000000001e-75  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  36.21 
 
 		 488 aa  234  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  34.58 
 
 		 505 aa  228  2e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  35.82 
 
 		 524 aa  221  3e-56  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  33.89 
 
 		 482 aa  220  5e-56  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  32.36 
 
 		 508 aa  198  2.0000000000000003e-49  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  33.67 
 
 		 502 aa  196  6e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  29.5 
 
 		 530 aa  180  4.999999999999999e-44  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  32.67 
 
 		 493 aa  179  9e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  31.9 
 
 		 498 aa  179  9e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  31.98 
 
 		 503 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  31.97 
 
 		 488 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.73 
 
 		 485 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.64 
 
 		 493 aa  106  1e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.53 
 
 		 588 aa  102  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  26.48 
 
 		 507 aa  100  6e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.25 
 
 		 519 aa  98.6  2e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.01 
 
 		 534 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.54 
 
 		 597 aa  94.4  4e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.7 
 
 		 470 aa  93.6  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  26.17 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.36 
 
 		 482 aa  92  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.35 
 
 		 517 aa  89  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.05 
 
 		 591 aa  88.6  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.03 
 
 		 589 aa  88.6  2e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  26.38 
 
 		 483 aa  88.2  3e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.51 
 
 		 596 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.15 
 
 		 519 aa  87.4  5e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.02 
 
 		 510 aa  86.7  8e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.05 
 
 		 517 aa  86.7  9e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.72 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.76 
 
 		 517 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  21.72 
 
 		 507 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.72 
 
 		 596 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.3 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.86 
 
 		 597 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.26 
 
 		 589 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.58 
 
 		 515 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.68 
 
 		 589 aa  80.9  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.78 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  28.57 
 
 		 578 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.93 
 
 		 460 aa  80.5  0.00000000000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  27.18 
 
 		 515 aa  79.3  0.0000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  28.16 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.37 
 
 		 511 aa  78.6  0.0000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.01 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  28.16 
 
 		 493 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  30.35 
 
 		 577 aa  78.6  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  28.16 
 
 		 658 aa  78.6  0.0000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.16 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  27.01 
 
 		 515 aa  77.8  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.46 
 
 		 519 aa  77.4  0.0000000000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.71 
 
 		 465 aa  77.4  0.0000000000005  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20240  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  27.39 
 
 		 584 aa  77.4  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.613338  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.52 
 
 		 608 aa  77.4  0.0000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2787  twin-arginine translocation pathway signal  26.04 
 
 		 553 aa  77  0.0000000000006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.161431 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  27.44 
 
 		 1005 aa  77  0.0000000000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.62 
 
 		 481 aa  77  0.0000000000007  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.03 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.25 
 
 		 598 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.33 
 
 		 476 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.34 
 
 		 555 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.449651  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  27.27 
 
 		 570 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.7 
 
 		 500 aa  75.5  0.000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.3 
 
 		 598 aa  75.5  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  23.41 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  24.85 
 
 		 517 aa  75.1  0.000000000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  27.85 
 
 		 570 aa  74.7  0.000000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.08 
 
 		 463 aa  73.9  0.000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  28.12 
 
 		 570 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>