More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_0639 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  78.88 
 
 		 469 aa  754    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  77.92 
 
 		 474 aa  761    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  76.14 
 
 		 486 aa  771    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  990    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  77.71 
 
 		 472 aa  776    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  78.21 
 
 		 469 aa  766    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  81.62 
 
 		 477 aa  801    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  78 
 
 		 479 aa  749    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  78.65 
 
 		 469 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  77.02 
 
 		 467 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  77.02 
 
 		 467 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  77.24 
 
 		 467 aa  757    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  77.25 
 
 		 476 aa  772    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  77.02 
 
 		 467 aa  756    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  79.35 
 
 		 469 aa  776    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  82.05 
 
 		 469 aa  816    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  77.11 
 
 		 479 aa  744    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  76.5 
 
 		 471 aa  761    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  78.28 
 
 		 468 aa  771    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  78.43 
 
 		 469 aa  764    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  76.81 
 
 		 467 aa  755    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  75.64 
 
 		 474 aa  743    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  59.53 
 
 		 462 aa  569  1e-161  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  59.14 
 
 		 468 aa  557  1e-157  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  57.52 
 
 		 465 aa  526  1e-148  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  57.49 
 
 		 470 aa  510  1e-143  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  45.34 
 
 		 457 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  42.92 
 
 		 477 aa  305  2.0000000000000002e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  39.39 
 
 		 432 aa  296  4e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  39.96 
 
 		 434 aa  286  5.999999999999999e-76  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  37.9 
 
 		 441 aa  276  6e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  35.11 
 
 		 505 aa  229  6e-59  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  37.22 
 
 		 524 aa  226  6e-58  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  33.26 
 
 		 482 aa  224  4e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.47 
 
 		 488 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  34.94 
 
 		 493 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  34.48 
 
 		 502 aa  199  1.0000000000000001e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  31.29 
 
 		 508 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 498 aa  189  9e-47  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  29.98 
 
 		 530 aa  183  5.0000000000000004e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  32.59 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.75 
 
 		 488 aa  155  1e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.9 
 
 		 485 aa  144  4e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  28.63 
 
 		 588 aa  117  5e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.05 
 
 		 502 aa  105  2e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.27 
 
 		 493 aa  103  6e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.97 
 
 		 534 aa  102  2e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  26.08 
 
 		 608 aa  97.4  5e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  25.73 
 
 		 597 aa  96.7  9e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.87 
 
 		 470 aa  94  5e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 507 aa  93.2  8e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  22.42 
 
 		 507 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.4 
 
 		 589 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  27.09 
 
 		 596 aa  90.1  8e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.71 
 
 		 598 aa  89.7  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.09 
 
 		 596 aa  88.6  2e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.59 
 
 		 598 aa  89  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.98 
 
 		 519 aa  88.2  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  25.91 
 
 		 510 aa  88.2  3e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 596 aa  87.8  4e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.57 
 
 		 591 aa  87.8  4e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.16 
 
 		 464 aa  87.4  5e-16  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.13 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  24.7 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.31 
 
 		 589 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.96 
 
 		 519 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  25.45 
 
 		 609 aa  86.3  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.51 
 
 		 519 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.14 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.29 
 
 		 517 aa  85.5  0.000000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.38 
 
 		 519 aa  84.7  0.000000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.55 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.69 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  29.23 
 
 		 577 aa  84  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  28.61 
 
 		 570 aa  84  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  27.47 
 
 		 515 aa  83.6  0.000000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 483 aa  83.6  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  28.61 
 
 		 570 aa  83.6  0.000000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.2 
 
 		 476 aa  82  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.36 
 
 		 481 aa  82  0.00000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.65 
 
 		 597 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.8 
 
 		 482 aa  81.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.6 
 
 		 517 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  26.8 
 
 		 515 aa  80.5  0.00000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 515 aa  80.9  0.00000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.98 
 
 		 465 aa  80.1  0.00000000000007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.15 
 
 		 593 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.65 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.1 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.1 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.1 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.1 
 
 		 596 aa  79  0.0000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  28.65 
 
 		 570 aa  78.2  0.0000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  28.21 
 
 		 500 aa  78.2  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.68 
 
 		 460 aa  77.8  0.0000000000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  22.71 
 
 		 926 aa  77.8  0.0000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.25 
 
 		 491 aa  77.4  0.0000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  24.5 
 
 		 517 aa  77  0.0000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  24.89 
 
 		 591 aa  77  0.0000000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.66 
 
 		 925 aa  76.6  0.0000000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>