More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_3415 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  81.84 
 
 		 469 aa  763    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0750  tricarballylate dehydrogenase  77.71 
 
 		 467 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0900786  normal  0.301353 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3133  tricarballylate dehydrogenase  78.79 
 
 		 476 aa  766    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.615879  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6134  tricarballylate dehydrogenase  81.44 
 
 		 469 aa  774    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  80.59 
 
 		 486 aa  791    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  76.82 
 
 		 479 aa  759    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2502  tricarballylate dehydrogenase  78.82 
 
 		 472 aa  759    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.927489  normal  0.370831 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4210  tricarballylate dehydrogenase  81.13 
 
 		 477 aa  785    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  80.34 
 
 		 474 aa  767    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  100 
 
 		 479 aa  989    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0738  tricarballylate dehydrogenase  77.71 
 
 		 467 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0182155  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  81 
 
 		 469 aa  773    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  80.53 
 
 		 468 aa  764    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0847  tricarballylate dehydrogenase  77.71 
 
 		 467 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.530072  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  82.1 
 
 		 469 aa  781    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0798  tricarballylate dehydrogenase  77.92 
 
 		 467 aa  749    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.808469  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  81.02 
 
 		 469 aa  792    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  97.49 
 
 		 479 aa  936    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  80.34 
 
 		 471 aa  789    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  87.32 
 
 		 474 aa  861    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0811  tricarballylate dehydrogenase  77.71 
 
 		 467 aa  748    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.329314  normal  0.994664 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  80.09 
 
 		 469 aa  776    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2722  tricarballylate dehydrogenase  57.88 
 
 		 468 aa  551  1e-156  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  57.76 
 
 		 462 aa  543  1e-153  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2274  tricarballylate dehydrogenase  56.3 
 
 		 465 aa  515  1.0000000000000001e-145  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.579032  normal  0.274442 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4211  tricarballylate dehydrogenase  57.17 
 
 		 470 aa  496  1e-139  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.287239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1893  tricarballylate dehydrogenase  44.95 
 
 		 457 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.291034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2986  tricarballylate dehydrogenase  42.27 
 
 		 477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0071938  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2323  tricarballylate dehydrogenase  39.04 
 
 		 432 aa  288  2e-76  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2383  tricarballylate dehydrogenase  39.66 
 
 		 434 aa  281  1e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.401613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3175  tricarballylate dehydrogenase  37.61 
 
 		 441 aa  271  2e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2834  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.71 
 
 		 488 aa  230  4e-59  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  35.54 
 
 		 524 aa  216  9e-55  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  33.06 
 
 		 505 aa  205  1e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 482 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06133  conserved hypothetical protein  30.1 
 
 		 530 aa  195  2e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  33.4 
 
 		 503 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  32.86 
 
 		 502 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0283  tricarballylate dehydrogenase  33.07 
 
 		 493 aa  182  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02608  conserved hypothetical protein  30.37 
 
 		 508 aa  179  1e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.262389 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5093  tricarballylate dehydrogenase  32.51 
 
 		 498 aa  174  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00496959 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0200  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.93 
 
 		 488 aa  172  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1003  putative succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  31.06 
 
 		 485 aa  141  3e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.415422  normal  0.433093 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.79 
 
 		 534 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.68 
 
 		 588 aa  101  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.82 
 
 		 591 aa  96.7  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.21 
 
 		 608 aa  94.7  3e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.32 
 
 		 597 aa  93.6  7e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.35 
 
 		 502 aa  93.2  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.25 
 
 		 482 aa  90.9  5e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.44 
 
 		 493 aa  90.9  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  26.94 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  30.29 
 
 		 570 aa  88.6  2e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  27.65 
 
 		 589 aa  88.6  2e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.25 
 
 		 507 aa  88.6  2e-16  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.55 
 
 		 598 aa  88.6  2e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  26.54 
 
 		 925 aa  88.6  2e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.19 
 
 		 470 aa  88.6  2e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  27.09 
 
 		 483 aa  89  2e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  28.3 
 
 		 596 aa  88.2  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  30.29 
 
 		 570 aa  88.2  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  28.97 
 
 		 570 aa  87.4  5e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.62 
 
 		 460 aa  87.4  6e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.3 
 
 		 596 aa  87  7e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.31 
 
 		 598 aa  86.7  8e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  25.56 
 
 		 507 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.31 
 
 		 596 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.19 
 
 		 589 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 597 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.97 
 
 		 593 aa  83.6  0.000000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.09 
 
 		 596 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  25.21 
 
 		 925 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.27 
 
 		 596 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.7 
 
 		 519 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.69 
 
 		 519 aa  80.1  0.00000000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  25.77 
 
 		 515 aa  80.1  0.00000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.2 
 
 		 517 aa  79.7  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.74 
 
 		 491 aa  79.3  0.0000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  25.45 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.03 
 
 		 631 aa  77.8  0.0000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.93 
 
 		 589 aa  76.6  0.0000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.22 
 
 		 519 aa  76.6  0.0000000000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  28.97 
 
 		 570 aa  76.3  0.000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.39 
 
 		 500 aa  76.3  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.44 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  22 
 
 		 511 aa  75.9  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  26.55 
 
 		 510 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  24.85 
 
 		 517 aa  75.5  0.000000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.6 
 
 		 519 aa  75.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.14 
 
 		 542 aa  74.7  0.000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  25.27 
 
 		 957 aa  74.3  0.000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  32.84 
 
 		 482 aa  73.6  0.000000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  23.68 
 
 		 926 aa  73.6  0.000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  24.79 
 
 		 1005 aa  73.2  0.00000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  28.41 
 
 		 493 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.16 
 
 		 465 aa  72.8  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>