More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0302 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1085    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  100 
 
 		 534 aa  1085    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  74.09 
 
 		 523 aa  766    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  98.68 
 
 		 529 aa  1059    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  48.94 
 
 		 528 aa  400  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  49.03 
 
 		 530 aa  395  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  41.17 
 
 		 552 aa  339  8e-92  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  41.43 
 
 		 587 aa  318  2e-85  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  39.65 
 
 		 570 aa  302  1e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  36.87 
 
 		 555 aa  288  2e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.64 
 
 		 491 aa  213  7e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  32.93 
 
 		 488 aa  200  5e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  32.47 
 
 		 500 aa  195  2e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  33.71 
 
 		 498 aa  194  4e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  33.84 
 
 		 484 aa  193  8e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.16 
 
 		 492 aa  190  5.999999999999999e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  32.44 
 
 		 525 aa  188  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  33.14 
 
 		 493 aa  184  3e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  31.84 
 
 		 493 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  31.84 
 
 		 493 aa  176  7e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  31.09 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  29.45 
 
 		 487 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  29.25 
 
 		 487 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  29.25 
 
 		 487 aa  170  7e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  33.2 
 
 		 493 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.94 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.73 
 
 		 486 aa  157  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  30.43 
 
 		 487 aa  151  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  27.72 
 
 		 542 aa  145  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  29.48 
 
 		 482 aa  138  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  27.94 
 
 		 486 aa  127  7e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.39 
 
 		 464 aa  110  7.000000000000001e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.63 
 
 		 529 aa  108  2e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.31 
 
 		 482 aa  108  2e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  27.77 
 
 		 569 aa  106  9e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.33 
 
 		 589 aa  105  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  25.14 
 
 		 589 aa  103  6e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  26.73 
 
 		 586 aa  102  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0850069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.27 
 
 		 569 aa  102  2e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  24.07 
 
 		 588 aa  102  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.38 
 
 		 511 aa  101  3e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.63 
 
 		 601 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.81 
 
 		 593 aa  101  3e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.96 
 
 		 587 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.64 
 
 		 593 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.64 
 
 		 593 aa  101  4e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.46 
 
 		 463 aa  100  5e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  28.52 
 
 		 581 aa  100  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.47 
 
 		 460 aa  97.1  7e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.23 
 
 		 591 aa  95.1  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.45 
 
 		 564 aa  94.7  4e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  27.29 
 
 		 572 aa  93.6  8e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  22.72 
 
 		 519 aa  92.8  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  24.55 
 
 		 505 aa  91.7  3e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  26.72 
 
 		 603 aa  92  3e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.75 
 
 		 519 aa  91.3  4e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.53 
 
 		 465 aa  90.5  6e-17  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.87 
 
 		 570 aa  90.5  7e-17  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.52 
 
 		 484 aa  90.1  9e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.77 
 
 		 522 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.14 
 
 		 523 aa  89.7  1e-16  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.78 
 
 		 523 aa  88.2  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3480  hypothetical protein  25.08 
 
 		 623 aa  88.6  3e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 517 aa  87  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.25 
 
 		 569 aa  87  8e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  25.89 
 
 		 577 aa  87  8e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  24.77 
 
 		 497 aa  86.7  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  25.54 
 
 		 596 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1792  3-oxosteroid 1-dehydrogenase  27.09 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.157211  normal  0.304525 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  25.54 
 
 		 596 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  23.66 
 
 		 510 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  25.22 
 
 		 514 aa  85.9  0.000000000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.86 
 
 		 563 aa  85.9  0.000000000000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.9 
 
 		 509 aa  85.1  0.000000000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.14 
 
 		 598 aa  84.7  0.000000000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  22.93 
 
 		 519 aa  84.3  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.9 
 
 		 509 aa  84.3  0.000000000000006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.63 
 
 		 476 aa  84  0.000000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  25.23 
 
 		 597 aa  83.6  0.000000000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3133  tricarballylate dehydrogenase  24.78 
 
 		 524 aa  83.2  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.262589  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  25.23 
 
 		 596 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  25.18 
 
 		 596 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  23.64 
 
 		 598 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.18 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  25.87 
 
 		 483 aa  82.8  0.00000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.72 
 
 		 550 aa  83.2  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  26.44 
 
 		 560 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.64 
 
 		 925 aa  82  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.56 
 
 		 561 aa  82.4  0.00000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.44 
 
 		 510 aa  81.6  0.00000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  24 
 
 		 591 aa  82  0.00000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.04 
 
 		 564 aa  81.3  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  23.62 
 
 		 596 aa  81.3  0.00000000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.67 
 
 		 560 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2701  putative FAD-binding dehydrogenase  25.8 
 
 		 599 aa  81.3  0.00000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.86 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000009  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.48 
 
 		 557 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2676  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.88 
 
 		 557 aa  79  0.0000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.0264921 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.27 
 
 		 571 aa  79.3  0.0000000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  21.88 
 
 		 517 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>