More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_3721 on replicon NC_009427
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1186    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  57.01 
 
 		 570 aa  535  1e-150  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  40.93 
 
 		 552 aa  358  9.999999999999999e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  42.29 
 
 		 528 aa  342  1e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  41.29 
 
 		 529 aa  338  9.999999999999999e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  41.36 
 
 		 534 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  41.36 
 
 		 534 aa  338  1.9999999999999998e-91  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  43.33 
 
 		 530 aa  335  1e-90  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  40.04 
 
 		 523 aa  317  3e-85  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  39.89 
 
 		 555 aa  307  4.0000000000000004e-82  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.55 
 
 		 491 aa  182  1e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  30.44 
 
 		 484 aa  176  9e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  30.94 
 
 		 488 aa  176  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  30.29 
 
 		 498 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  29.26 
 
 		 500 aa  166  8e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  28.4 
 
 		 658 aa  166  8e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.54 
 
 		 486 aa  166  9e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  28.57 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  28.57 
 
 		 493 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.46 
 
 		 492 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  29.13 
 
 		 525 aa  159  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  29.38 
 
 		 493 aa  157  7e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  30.16 
 
 		 487 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  30.16 
 
 		 487 aa  156  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  28.05 
 
 		 542 aa  150  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  29.1 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  29.62 
 
 		 487 aa  149  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.1 
 
 		 495 aa  147  8.000000000000001e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  28.63 
 
 		 486 aa  133  7.999999999999999e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  27.79 
 
 		 482 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.04 
 
 		 517 aa  117  8.999999999999998e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.56 
 
 		 588 aa  113  1.0000000000000001e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2695  putative succinate dehydrogenase  25.51 
 
 		 570 aa  112  2.0000000000000002e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.47 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.47 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  28.29 
 
 		 493 aa  111  4.0000000000000004e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.12 
 
 		 563 aa  111  5e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.69 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  24.6 
 
 		 517 aa  107  6e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  26.96 
 
 		 569 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  28.52 
 
 		 572 aa  105  2e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.01 
 
 		 517 aa  105  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  23.53 
 
 		 510 aa  105  3e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.34 
 
 		 481 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.65 
 
 		 519 aa  103  6e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.37 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.66 
 
 		 568 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  24.32 
 
 		 519 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.15 
 
 		 591 aa  100  7e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.16 
 
 		 589 aa  98.6  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.51 
 
 		 569 aa  98.2  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3626  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.22 
 
 		 561 aa  97.4  7e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  22.49 
 
 		 589 aa  96.3  1e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6094  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.59 
 
 		 589 aa  96.7  1e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00173054  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  24.39 
 
 		 510 aa  95.5  2e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  25.96 
 
 		 521 aa  94.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.04 
 
 		 560 aa  94  7e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.02 
 
 		 529 aa  91.7  4e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3848  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.46 
 
 		 571 aa  91.3  5e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  28.32 
 
 		 605 aa  90.5  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  23.02 
 
 		 588 aa  90.1  1e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.54 
 
 		 596 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.52 
 
 		 570 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  24.08 
 
 		 497 aa  90.1  1e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.78 
 
 		 550 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  23.1 
 
 		 563 aa  89  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  29.02 
 
 		 457 aa  89.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.39 
 
 		 463 aa  89.4  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  24.78 
 
 		 586 aa  88.2  4e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  27.68 
 
 		 511 aa  87.4  6e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  23.13 
 
 		 582 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  24.18 
 
 		 504 aa  85.9  0.000000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2704  putative FAD-binding dehydrogenase  26.25 
 
 		 582 aa  86.3  0.000000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.900801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  22.16 
 
 		 599 aa  86.3  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.3 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.3 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.3 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.16 
 
 		 564 aa  84.7  0.000000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.3 
 
 		 596 aa  84.7  0.000000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.92 
 
 		 596 aa  84  0.000000000000008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  22.16 
 
 		 507 aa  84  0.000000000000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25 
 
 		 550 aa  83.6  0.000000000000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  28.72 
 
 		 1005 aa  83.6  0.00000000000001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  26.92 
 
 		 597 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.9 
 
 		 557 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.21 
 
 		 523 aa  82.4  0.00000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  24.35 
 
 		 598 aa  81.6  0.00000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7946  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.05 
 
 		 456 aa  82  0.00000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.513749  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.32 
 
 		 550 aa  81.6  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23 
 
 		 597 aa  81.3  0.00000000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.24 
 
 		 569 aa  81.3  0.00000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4011  putative succinate dehydrogenase  25.33 
 
 		 587 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  20.34 
 
 		 608 aa  81.6  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2710  putative succinate dehydrogenase  25.41 
 
 		 568 aa  80.9  0.00000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.228165  normal  0.454137 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  22.94 
 
 		 582 aa  80.5  0.00000000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.17 
 
 		 503 aa  80.5  0.00000000000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01540  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.17 
 
 		 501 aa  79.7  0.0000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  0.0190007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>