More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0296 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  100 
 
 		 493 aa  996    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  70.64 
 
 		 487 aa  651    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  67.65 
 
 		 500 aa  635    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  66.46 
 
 		 493 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  66.46 
 
 		 493 aa  622  1e-177  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  66.26 
 
 		 658 aa  619  1e-176  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  67.9 
 
 		 525 aa  615  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.03 
 
 		 495 aa  603  1.0000000000000001e-171  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  47.65 
 
 		 491 aa  405  1.0000000000000001e-112  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  43.56 
 
 		 498 aa  332  7.000000000000001e-90  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  43.33 
 
 		 493 aa  310  4e-83  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  41.43 
 
 		 487 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  41.43 
 
 		 487 aa  296  6e-79  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  41.2 
 
 		 487 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.04 
 
 		 486 aa  292  8e-78  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  37.95 
 
 		 488 aa  285  2.0000000000000002e-75  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  39.31 
 
 		 484 aa  281  2e-74  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  39.33 
 
 		 482 aa  262  8e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  40.75 
 
 		 486 aa  258  2e-67  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.88 
 
 		 492 aa  256  9e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  34.3 
 
 		 528 aa  187  4e-46  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  32.95 
 
 		 534 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  32.95 
 
 		 534 aa  186  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  30.19 
 
 		 555 aa  181  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  33.46 
 
 		 523 aa  180  4e-44  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  32.56 
 
 		 529 aa  180  5.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  33.07 
 
 		 542 aa  175  9.999999999999999e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  33.92 
 
 		 530 aa  174  3.9999999999999995e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  29.96 
 
 		 552 aa  162  1e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.12 
 
 		 534 aa  154  5e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  28.43 
 
 		 609 aa  144  4e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30.22 
 
 		 591 aa  140  3.9999999999999997e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.28 
 
 		 589 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.89 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.52 
 
 		 569 aa  132  1.0000000000000001e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.66 
 
 		 599 aa  130  5.0000000000000004e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  27.41 
 
 		 587 aa  130  6e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.82 
 
 		 596 aa  125  1e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.02 
 
 		 476 aa  125  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  27.44 
 
 		 925 aa  123  7e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.04 
 
 		 598 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.73 
 
 		 457 aa  121  3.9999999999999996e-26  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  26.89 
 
 		 596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  25.83 
 
 		 598 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.51 
 
 		 588 aa  117  3e-25  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.51 
 
 		 489 aa  118  3e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.16 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  27.98 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  26.68 
 
 		 596 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.72 
 
 		 597 aa  117  5e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.21 
 
 		 596 aa  117  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.48 
 
 		 498 aa  117  6e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.9 
 
 		 491 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.16 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  26.16 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.93 
 
 		 596 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.74 
 
 		 596 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.88 
 
 		 493 aa  114  3e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  29.61 
 
 		 510 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.33 
 
 		 597 aa  114  4.0000000000000004e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  27.23 
 
 		 925 aa  113  6e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1624  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.23 
 
 		 524 aa  114  6e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.19 
 
 		 522 aa  114  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  25.8 
 
 		 605 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.81 
 
 		 503 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25 
 
 		 608 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.64 
 
 		 650 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 519 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  26.85 
 
 		 589 aa  111  3e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  26.94 
 
 		 606 aa  111  3e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26 
 
 		 601 aa  111  3e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.48 
 
 		 593 aa  111  3e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.48 
 
 		 593 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.48 
 
 		 593 aa  111  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  27.45 
 
 		 598 aa  109  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  29.18 
 
 		 603 aa  109  1e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.23 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  25.58 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.23 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.04 
 
 		 563 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.76 
 
 		 529 aa  107  5e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.8 
 
 		 593 aa  107  5e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8556  tricarballylate dehydrogenase  27.86 
 
 		 462 aa  107  6e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.819008  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0367  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.08 
 
 		 589 aa  107  6e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.786243 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.9 
 
 		 464 aa  107  6e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.3 
 
 		 637 aa  105  1e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  25.57 
 
 		 591 aa  106  1e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.93 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.31 
 
 		 482 aa  105  2e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.24 
 
 		 584 aa  105  2e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27 
 
 		 582 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.89 
 
 		 519 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.92 
 
 		 502 aa  105  3e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1779  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.9 
 
 		 586 aa  105  3e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2354  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.86 
 
 		 551 aa  104  4e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  25.61 
 
 		 586 aa  103  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  27.2 
 
 		 582 aa  103  6e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>