More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1298 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 
569 aa  1164    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  30.77 
 
 
542 aa  177  6e-43  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.89 
 
 
495 aa  135  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.3 
 
 
486 aa  135  3e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  28.19 
 
 
487 aa  131  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  26.94 
 
 
500 aa  130  9.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  27.72 
 
 
487 aa  125  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  31.46 
 
 
596 aa  124  5e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  27.53 
 
 
487 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  27.53 
 
 
487 aa  123  8e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  31.78 
 
 
596 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  31.78 
 
 
596 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  31.78 
 
 
596 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  31.78 
 
 
596 aa  123  9e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  27.29 
 
 
525 aa  123  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  26.21 
 
 
493 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  31.46 
 
 
596 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  27.16 
 
 
597 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  31.78 
 
 
596 aa  121  3e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  28.08 
 
 
498 aa  121  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  31.46 
 
 
596 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  28.61 
 
 
599 aa  121  3.9999999999999996e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  28.31 
 
 
493 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  28.32 
 
 
658 aa  120  6e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  28.32 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  28.32 
 
 
493 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.22 
 
 
492 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2507  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.53 
 
 
602 aa  116  8.999999999999998e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  30.53 
 
 
597 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  27.59 
 
 
486 aa  114  4.0000000000000004e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2984  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.36 
 
 
607 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  25.05 
 
 
484 aa  113  8.000000000000001e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.44 
 
 
593 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.24 
 
 
588 aa  111  4.0000000000000004e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3521  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.06 
 
 
559 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.88 
 
 
589 aa  111  5e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  29.86 
 
 
504 aa  110  6e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.64 
 
 
589 aa  109  2e-22  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  28.41 
 
 
603 aa  107  4e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  29.81 
 
 
596 aa  108  4e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2780  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  31.02 
 
 
564 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.386374  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  27.04 
 
 
650 aa  107  9e-22  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.32 
 
 
491 aa  106  9e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  27.5 
 
 
586 aa  106  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.62 
 
 
570 aa  106  1e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  31.4 
 
 
586 aa  105  2e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  26.8 
 
 
598 aa  105  2e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  24.72 
 
 
488 aa  105  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  29.27 
 
 
582 aa  105  3e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.86 
 
 
596 aa  104  5e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.83 
 
 
582 aa  104  5e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  25.58 
 
 
552 aa  104  5e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  30.63 
 
 
596 aa  104  5e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2884  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  29.09 
 
 
557 aa  104  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.097907  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.35 
 
 
598 aa  104  5e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  27.04 
 
 
482 aa  103  7e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.52 
 
 
582 aa  103  8e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  28.88 
 
 
596 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  27.39 
 
 
589 aa  103  1e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.11 
 
 
563 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  24.65 
 
 
510 aa  103  1e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  28.44 
 
 
582 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.11 
 
 
563 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  28.44 
 
 
582 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2676  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.43 
 
 
557 aa  102  1e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0902529  normal  0.0264921 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.53 
 
 
502 aa  102  2e-20  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  30.96 
 
 
513 aa  102  2e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.94 
 
 
563 aa  102  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  29.35 
 
 
957 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.2 
 
 
584 aa  101  3e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.01 
 
 
550 aa  101  3e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5237  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.17 
 
 
560 aa  101  3e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.466642 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  28.48 
 
 
596 aa  101  4e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  30.22 
 
 
925 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3732  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.77 
 
 
568 aa  100  5e-20  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  28.17 
 
 
583 aa  100  7e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2538  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.47 
 
 
596 aa  100  8e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  25.86 
 
 
598 aa  99.4  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  25.28 
 
 
591 aa  100  1e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.81 
 
 
609 aa  99.4  2e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2702  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.79 
 
 
489 aa  99  2e-19  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.57 
 
 
457 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.57 
 
 
464 aa  98.6  2e-19  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.08 
 
 
601 aa  99  2e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  30.32 
 
 
925 aa  98.2  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  28.26 
 
 
523 aa  98.2  4e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  32.36 
 
 
570 aa  97.8  5e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13570  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.98 
 
 
563 aa  96.3  1e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000282742 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.25 
 
 
569 aa  95.9  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  27.24 
 
 
1004 aa  95.1  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.54 
 
 
517 aa  95.5  3e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  24.12 
 
 
529 aa  95.1  3e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2690  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.69 
 
 
557 aa  94.7  4e-18  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  24.1 
 
 
534 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.52 
 
 
587 aa  94.7  4e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  23.87 
 
 
515 aa  94.7  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  24.1 
 
 
534 aa  94.7  4e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  25.46 
 
 
517 aa  94.7  4e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.9 
 
 
1005 aa  94.4  5e-18  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.74 
 
 
509 aa  94.4  5e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>