More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2890 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  86.1 
 
 		 487 aa  827    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  86.1 
 
 		 487 aa  827    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  100 
 
 		 486 aa  979    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  85.89 
 
 		 487 aa  825    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  83.09 
 
 		 482 aa  749    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.95 
 
 		 486 aa  594  1e-168  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.12 
 
 		 492 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  41.68 
 
 		 498 aa  317  3e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  42.62 
 
 		 484 aa  314  1.9999999999999998e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.59 
 
 		 491 aa  296  6e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  39.44 
 
 		 500 aa  285  9e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  40.79 
 
 		 493 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  40.79 
 
 		 493 aa  283  7.000000000000001e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  40.59 
 
 		 658 aa  280  4e-74  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.04 
 
 		 495 aa  277  3e-73  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  40.75 
 
 		 493 aa  274  2.0000000000000002e-72  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  40.33 
 
 		 487 aa  272  9e-72  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  39.01 
 
 		 525 aa  271  1e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  39.5 
 
 		 488 aa  271  2e-71  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  40.61 
 
 		 493 aa  265  2e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  34.53 
 
 		 542 aa  216  9.999999999999999e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  32.34 
 
 		 552 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  31.53 
 
 		 555 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  33.02 
 
 		 528 aa  178  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  30.27 
 
 		 530 aa  163  6e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  30.3 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  30.3 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  30.94 
 
 		 523 aa  155  2e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  29.73 
 
 		 529 aa  147  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  29.8 
 
 		 587 aa  138  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.54 
 
 		 569 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  29.07 
 
 		 609 aa  134  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.99 
 
 		 584 aa  133  6e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.1 
 
 		 597 aa  132  2.0000000000000002e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.2 
 
 		 464 aa  126  9e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.82 
 
 		 589 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  27.42 
 
 		 599 aa  125  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  30.13 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.9 
 
 		 608 aa  124  3e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  29.96 
 
 		 570 aa  124  4e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  27.2 
 
 		 510 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  29.24 
 
 		 598 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.25 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  28.05 
 
 		 481 aa  121  3e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.34 
 
 		 598 aa  120  3.9999999999999996e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.54 
 
 		 588 aa  120  3.9999999999999996e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.19 
 
 		 519 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  27.47 
 
 		 631 aa  118  1.9999999999999998e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.63 
 
 		 510 aa  118  3e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  28.11 
 
 		 650 aa  118  3e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.09 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.1 
 
 		 565 aa  117  3.9999999999999997e-25  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.68 
 
 		 517 aa  117  5e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2398  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.7 
 
 		 535 aa  116  6.9999999999999995e-25  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.29 
 
 		 519 aa  116  7.999999999999999e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  26.76 
 
 		 506 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.78 
 
 		 537 aa  116  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374366  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  27.01 
 
 		 598 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.21 
 
 		 500 aa  116  1.0000000000000001e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.84 
 
 		 596 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  28.11 
 
 		 550 aa  114  5e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.72 
 
 		 519 aa  113  8.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.51 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.9 
 
 		 502 aa  111  3e-23  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.89 
 
 		 470 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.37 
 
 		 532 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.85 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.11 
 
 		 534 aa  111  4.0000000000000004e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.29 
 
 		 517 aa  109  1e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.51 
 
 		 586 aa  108  2e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.46 
 
 		 517 aa  108  2e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3793  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.15 
 
 		 533 aa  108  2e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445361  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  28.12 
 
 		 591 aa  108  2e-22  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  27.02 
 
 		 511 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3789  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  28.15 
 
 		 533 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3862  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.15 
 
 		 533 aa  107  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  26.55 
 
 		 510 aa  107  5e-22  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  25 
 
 		 506 aa  107  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.1 
 
 		 493 aa  106  8e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6094  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.97 
 
 		 589 aa  106  8e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00173054  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.25 
 
 		 586 aa  105  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  26.04 
 
 		 500 aa  105  2e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3624  flavocytochrome c flavin subunit  26.07 
 
 		 494 aa  105  2e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.9 
 
 		 465 aa  105  2e-21  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  28.28 
 
 		 550 aa  104  3e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2230  flavocytochrome c  25.2 
 
 		 506 aa  104  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.158762 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.12 
 
 		 566 aa  103  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.29 
 
 		 529 aa  103  8e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.6 
 
 		 589 aa  103  9e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  29.73 
 
 		 616 aa  103  9e-21  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25 
 
 		 1005 aa  102  1e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  28.72 
 
 		 603 aa  102  1e-20  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.74 
 
 		 482 aa  102  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  26.3 
 
 		 925 aa  102  1e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3818  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.71 
 
 		 545 aa  102  1e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0669548  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.22 
 
 		 463 aa  102  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  27.16 
 
 		 560 aa  102  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  24.85 
 
 		 515 aa  101  3e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  26.48 
 
 		 606 aa  100  4e-20  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2153  flavocytochrome c  24.8 
 
 		 506 aa  100  5e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0615938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>