More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4564 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  74.09 
 
 		 534 aa  767    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  74.09 
 
 		 534 aa  767    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  100 
 
 		 523 aa  1056    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  74.02 
 
 		 529 aa  754    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  47.9 
 
 		 528 aa  368  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  47.28 
 
 		 530 aa  367  1e-100  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  38.68 
 
 		 552 aa  299  8e-80  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  40.15 
 
 		 587 aa  298  2e-79  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  39.45 
 
 		 570 aa  280  4e-74  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  36.05 
 
 		 555 aa  267  2.9999999999999995e-70  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  32.2 
 
 		 491 aa  202  1.9999999999999998e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  33.59 
 
 		 484 aa  195  1e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  32.41 
 
 		 488 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  32.65 
 
 		 500 aa  189  1e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  34.28 
 
 		 498 aa  183  6e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  31.95 
 
 		 525 aa  181  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  31.47 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  31.47 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  31.28 
 
 		 658 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  32.7 
 
 		 492 aa  163  6e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  33.46 
 
 		 493 aa  162  2e-38  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  31.7 
 
 		 487 aa  160  7e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  31.7 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  31.7 
 
 		 487 aa  159  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.56 
 
 		 495 aa  158  2e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  30.11 
 
 		 493 aa  157  5.0000000000000005e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  30.62 
 
 		 487 aa  154  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30 
 
 		 486 aa  139  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  29.31 
 
 		 482 aa  137  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  27.33 
 
 		 542 aa  133  6.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  30.19 
 
 		 486 aa  126  1e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.04 
 
 		 482 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.22 
 
 		 463 aa  114  5e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.26 
 
 		 569 aa  105  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.48 
 
 		 464 aa  102  2e-20  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.76 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.38 
 
 		 509 aa  102  2e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  27.92 
 
 		 569 aa  101  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25 
 
 		 511 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2896  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.44 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.217438  hitchhiker  0.000124211 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.79 
 
 		 484 aa  99.4  1e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  26.17 
 
 		 589 aa  98.6  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.01 
 
 		 596 aa  97.4  6e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  25.7 
 
 		 588 aa  97.1  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2125  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.41 
 
 		 587 aa  96.3  1e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.401658  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.66 
 
 		 596 aa  96.7  1e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  26.98 
 
 		 581 aa  95.1  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.66 
 
 		 597 aa  94.4  5e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.05 
 
 		 523 aa  94  6e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 596 aa  93.6  8e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  26.95 
 
 		 596 aa  93.2  1e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.38 
 
 		 523 aa  92.4  2e-17  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  26.6 
 
 		 596 aa  91.3  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2701  putative FAD-binding dehydrogenase  25.96 
 
 		 599 aa  90.1  9e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.302749  normal  0.211864 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.42 
 
 		 601 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.86 
 
 		 589 aa  87.8  4e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3768  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  25.9 
 
 		 460 aa  87.4  5e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30250  putative FAD-binding dehydrogenase  28.76 
 
 		 572 aa  87.4  6e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.03 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0124  Succinate dehydrogenase  25 
 
 		 497 aa  85.1  0.000000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  27.05 
 
 		 560 aa  84.3  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  24.53 
 
 		 925 aa  82.8  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  24.78 
 
 		 586 aa  83.2  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0850069  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  24.07 
 
 		 510 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.93 
 
 		 597 aa  82.8  0.00000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0904  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  27.68 
 
 		 603 aa  82  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000602214 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.76 
 
 		 596 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.57 
 
 		 470 aa  81.3  0.00000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.12 
 
 		 502 aa  80.9  0.00000000000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  26.18 
 
 		 591 aa  80.9  0.00000000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.96 
 
 		 569 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  24.95 
 
 		 599 aa  80.5  0.00000000000008  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.43 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.04 
 
 		 519 aa  79.3  0.0000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.43 
 
 		 593 aa  79.7  0.0000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.58 
 
 		 925 aa  79  0.0000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  26.68 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2695  putative succinate dehydrogenase  30.5 
 
 		 570 aa  79  0.0000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.313398 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  23.64 
 
 		 591 aa  79  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3320  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.04 
 
 		 564 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1519  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.4 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  25.32 
 
 		 627 aa  78.2  0.0000000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  23.33 
 
 		 517 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  26.22 
 
 		 598 aa  77.8  0.0000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  26.97 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  26.76 
 
 		 583 aa  77.4  0.0000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.83 
 
 		 457 aa  77.8  0.0000000000005  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.91 
 
 		 593 aa  77.8  0.0000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3125  putative FAD-binding dehydrogenase  26.97 
 
 		 570 aa  77.4  0.0000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.55 
 
 		 465 aa  77  0.0000000000008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  26.06 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  23.96 
 
 		 596 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  26.05 
 
 		 517 aa  76.3  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.26 
 
 		 593 aa  76.6  0.000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  26.16 
 
 		 578 aa  75.5  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  23.68 
 
 		 650 aa  75.5  0.000000000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1201  putative succinate dehydrogenase  26.94 
 
 		 567 aa  75.9  0.000000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>