More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_0316 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  985    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  100 
 
 		 487 aa  985    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  86.23 
 
 		 486 aa  794    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  99.79 
 
 		 487 aa  983    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  85.8 
 
 		 482 aa  773    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.21 
 
 		 486 aa  595  1e-169  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.95 
 
 		 492 aa  380  1e-104  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  41.26 
 
 		 498 aa  320  3e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  39.67 
 
 		 491 aa  313  4.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  41.46 
 
 		 484 aa  308  2.0000000000000002e-82  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  41.47 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  41.47 
 
 		 493 aa  294  2e-78  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  41.47 
 
 		 658 aa  293  4e-78  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  41 
 
 		 495 aa  288  2e-76  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  39.84 
 
 		 500 aa  288  2e-76  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  40.66 
 
 		 525 aa  286  8e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  41.59 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  40.53 
 
 		 493 aa  281  2e-74  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  39.92 
 
 		 487 aa  278  1e-73  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  39.54 
 
 		 488 aa  274  2.0000000000000002e-72  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  33.93 
 
 		 542 aa  218  2e-55  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  32.59 
 
 		 555 aa  201  3e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  32.46 
 
 		 552 aa  198  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  34.46 
 
 		 528 aa  192  9e-48  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  31.42 
 
 		 530 aa  176  8e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  30.75 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  30.75 
 
 		 534 aa  172  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  29.73 
 
 		 529 aa  164  3e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  31.7 
 
 		 523 aa  162  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  29.35 
 
 		 587 aa  142  9.999999999999999e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  28.24 
 
 		 597 aa  140  4.999999999999999e-32  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2398  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.91 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.72 
 
 		 569 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  24.9 
 
 		 608 aa  133  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.78 
 
 		 537 aa  133  9e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.374366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  30.34 
 
 		 570 aa  131  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  28.5 
 
 		 650 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28 
 
 		 598 aa  127  3e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.89 
 
 		 588 aa  127  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  26.75 
 
 		 609 aa  128  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1851  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.86 
 
 		 532 aa  127  5e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  25.1 
 
 		 464 aa  127  5e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.57 
 
 		 534 aa  126  1e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  25.99 
 
 		 584 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.62 
 
 		 589 aa  125  2e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.75 
 
 		 591 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  27.45 
 
 		 510 aa  124  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.34 
 
 		 598 aa  124  4e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  26.55 
 
 		 596 aa  124  5e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.2 
 
 		 519 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.39 
 
 		 598 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3818  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.09 
 
 		 545 aa  123  8e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0669548  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.48 
 
 		 502 aa  123  9e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0687  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.24 
 
 		 503 aa  122  9.999999999999999e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.34 
 
 		 519 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.39 
 
 		 493 aa  121  3e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3789  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like protein  28.39 
 
 		 533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.270006  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3862  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.39 
 
 		 533 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0314999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3793  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.2 
 
 		 533 aa  119  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.445361  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.08 
 
 		 517 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  24.58 
 
 		 599 aa  119  9.999999999999999e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.34 
 
 		 519 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.29 
 
 		 517 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  27.07 
 
 		 560 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.02 
 
 		 481 aa  116  1.0000000000000001e-24  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.01 
 
 		 500 aa  114  3e-24  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1580  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  26.74 
 
 		 550 aa  115  3e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.25 
 
 		 589 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4662  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.63 
 
 		 563 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4750  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.63 
 
 		 563 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.309954  normal  0.275452 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.06 
 
 		 463 aa  112  1.0000000000000001e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  24.5 
 
 		 517 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.31 
 
 		 517 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  26.98 
 
 		 510 aa  112  2.0000000000000002e-23  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5045  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.26 
 
 		 563 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.972653 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6094  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.27 
 
 		 589 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00173054  normal  0.263538 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  27.5 
 
 		 591 aa  110  7.000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  29.12 
 
 		 603 aa  109  9.000000000000001e-23  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.75 
 
 		 465 aa  109  1e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.67 
 
 		 593 aa  109  1e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.05 
 
 		 596 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.79 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.89 
 
 		 457 aa  107  3e-22  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5094  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.45 
 
 		 586 aa  108  3e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0693824  normal  0.136582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0325  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.7 
 
 		 550 aa  108  3e-22  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.681292  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  25.63 
 
 		 1005 aa  107  6e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  27.29 
 
 		 517 aa  107  7e-22  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.92 
 
 		 510 aa  107  7e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.82 
 
 		 596 aa  106  8e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.42 
 
 		 566 aa  106  1e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.85 
 
 		 511 aa  106  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  27.2 
 
 		 597 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  27.59 
 
 		 596 aa  105  2e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  24.5 
 
 		 506 aa  105  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2894  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.38 
 
 		 529 aa  103  5e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0165292  hitchhiker  0.000448653 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25 
 
 		 565 aa  103  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  25.05 
 
 		 586 aa  103  6e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>