More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B1518 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007347  Reut_A1659  hypothetical protein  75.77 
 
 
493 aa  709    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.224804  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1518  hypothetical protein  100 
 
 
498 aa  1013    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0214659  normal  0.354799 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3339  hypothetical protein  58.66 
 
 
488 aa  514  1e-144  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.196154 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  52.58 
 
 
484 aa  462  1e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3488  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  42.33 
 
 
491 aa  367  1e-100  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3411  hypothetical protein  41.51 
 
 
500 aa  356  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0735026  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3165  hypothetical protein  41.13 
 
 
525 aa  342  1e-92  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0565388  normal  0.0860599 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.53 
 
 
486 aa  332  6e-90  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2856  hypothetical protein  42.77 
 
 
493 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2900  hypothetical protein  42.77 
 
 
493 aa  330  4e-89  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2887  hypothetical protein  42.36 
 
 
658 aa  328  1.0000000000000001e-88  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0296  hypothetical protein  43.01 
 
 
493 aa  327  3e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  41.46 
 
 
487 aa  320  3e-86  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  41.26 
 
 
487 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  41.26 
 
 
487 aa  319  7.999999999999999e-86  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.44 
 
 
492 aa  315  1.9999999999999998e-84  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11847  hypothetical protein  42.5 
 
 
487 aa  314  2.9999999999999996e-84  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  9.81807e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4545  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.26 
 
 
495 aa  309  8e-83  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  41.39 
 
 
482 aa  293  6e-78  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2890  hypothetical protein  41.1 
 
 
486 aa  288  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.995147  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  31.97 
 
 
555 aa  202  8e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0302  hypothetical protein  34.22 
 
 
534 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.947471  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0312  hypothetical protein  34.22 
 
 
534 aa  199  7e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0293  hypothetical protein  33.91 
 
 
529 aa  192  1e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.467949  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1860  hypothetical protein  31.16 
 
 
552 aa  187  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.903101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4564  hypothetical protein  34.66 
 
 
523 aa  187  3e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00360175  normal  0.224392 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  35.39 
 
 
528 aa  184  3e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0773  hypothetical protein  33.33 
 
 
542 aa  183  6e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000153715  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2883  hypothetical protein  32.25 
 
 
530 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0393135  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3721  hypothetical protein  29.26 
 
 
587 aa  163  7e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  27.89 
 
 
464 aa  155  2e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.62 
 
 
596 aa  150  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.24 
 
 
598 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  27.67 
 
 
598 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  28.36 
 
 
591 aa  146  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.2 
 
 
517 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  28.11 
 
 
589 aa  144  4e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3335  hypothetical protein  29.96 
 
 
570 aa  137  4e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0248225 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  26.15 
 
 
502 aa  136  8e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.71 
 
 
588 aa  136  9e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  27.72 
 
 
582 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.9 
 
 
481 aa  135  9.999999999999999e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  29.07 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1298  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.02 
 
 
569 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.306259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  29.07 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  29.07 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  29.07 
 
 
596 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.93 
 
 
596 aa  134  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  27.5 
 
 
586 aa  134  3e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  27.71 
 
 
589 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.36 
 
 
596 aa  133  6e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  27.16 
 
 
584 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  27.22 
 
 
609 aa  132  1.0000000000000001e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.31 
 
 
596 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  25.79 
 
 
599 aa  131  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  28.45 
 
 
597 aa  131  3e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  27.45 
 
 
586 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  25.7 
 
 
521 aa  130  5.0000000000000004e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  28.16 
 
 
598 aa  130  5.0000000000000004e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4243  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.76 
 
 
601 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  26.51 
 
 
596 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  26.94 
 
 
583 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  26.47 
 
 
597 aa  129  1.0000000000000001e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  27.95 
 
 
596 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  29.52 
 
 
515 aa  128  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  25.56 
 
 
465 aa  128  3e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  26.45 
 
 
596 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  26.9 
 
 
582 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  29.32 
 
 
515 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2778  Succinate dehydrogenase  27.63 
 
 
510 aa  125  2e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.961247  normal  0.792272 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  26.64 
 
 
605 aa  124  5e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  26.62 
 
 
925 aa  124  5e-27  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3784  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.61 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  26.08 
 
 
596 aa  122  9.999999999999999e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3857  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.61 
 
 
593 aa  122  9.999999999999999e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.89705  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.51 
 
 
493 aa  121  1.9999999999999998e-26  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  27.39 
 
 
593 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  27.52 
 
 
582 aa  121  3e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0528  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.64 
 
 
550 aa  120  3.9999999999999996e-26  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.603019  normal  0.637418 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.89 
 
 
589 aa  120  4.9999999999999996e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3788  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  25.09 
 
 
593 aa  120  4.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.31 
 
 
519 aa  120  6e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  28.97 
 
 
515 aa  119  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  25.43 
 
 
596 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  27.25 
 
 
582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.9 
 
 
608 aa  117  3.9999999999999997e-25  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  27.25 
 
 
582 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  24.4 
 
 
457 aa  117  6e-25  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0273  flavocytochrome c  25.54 
 
 
506 aa  117  6e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000188956 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.95 
 
 
519 aa  116  1.0000000000000001e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0482  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  27.5 
 
 
491 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  28.37 
 
 
603 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.39 
 
 
482 aa  115  2.0000000000000002e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0256  flavocytochrome c  25.4 
 
 
506 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  24.56 
 
 
515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  25.14 
 
 
521 aa  114  3e-24  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.98 
 
 
510 aa  114  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  24.27 
 
 
517 aa  114  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  29.52 
 
 
470 aa  114  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  25.35 
 
 
506 aa  113  7.000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>