215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4675 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  74.3 
 
 
541 aa  804    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  80.31 
 
 
537 aa  830    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  74.67 
 
 
552 aa  806    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  80 
 
 
537 aa  825    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  100 
 
 
533 aa  1085    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  54.44 
 
 
549 aa  545  1e-154  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.47 
 
 
537 aa  397  1e-109  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  40 
 
 
555 aa  324  2e-87  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  39.31 
 
 
545 aa  320  3e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  37.77 
 
 
556 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  37.77 
 
 
556 aa  319  1e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  37.77 
 
 
556 aa  317  2e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  38.24 
 
 
551 aa  317  5e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  35.15 
 
 
552 aa  311  2e-83  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.41 
 
 
548 aa  311  2.9999999999999997e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  37.45 
 
 
549 aa  308  2.0000000000000002e-82  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  38 
 
 
555 aa  307  4.0000000000000004e-82  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  38.09 
 
 
566 aa  307  4.0000000000000004e-82  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  36.18 
 
 
558 aa  306  5.0000000000000004e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  37.18 
 
 
558 aa  305  2.0000000000000002e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  39.73 
 
 
549 aa  304  3.0000000000000004e-81  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  37.64 
 
 
552 aa  301  3e-80  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.92 
 
 
557 aa  299  8e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.18 
 
 
559 aa  296  5e-79  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.31 
 
 
551 aa  293  6e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  35.96 
 
 
558 aa  293  6e-78  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  36.85 
 
 
551 aa  291  1e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.87 
 
 
550 aa  292  1e-77  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.63 
 
 
597 aa  290  3e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  35.22 
 
 
557 aa  284  2.0000000000000002e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.52 
 
 
571 aa  285  2.0000000000000002e-75  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  36.18 
 
 
559 aa  283  6.000000000000001e-75  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  35.36 
 
 
553 aa  282  1e-74  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  38.1 
 
 
552 aa  275  1.0000000000000001e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.22 
 
 
555 aa  275  1.0000000000000001e-72  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.98 
 
 
550 aa  268  2e-70  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  34.67 
 
 
551 aa  261  3e-68  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  35.06 
 
 
551 aa  260  5.0000000000000005e-68  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  34.68 
 
 
573 aa  259  9e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  34.62 
 
 
551 aa  254  2.0000000000000002e-66  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  34.23 
 
 
551 aa  253  5.000000000000001e-66  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.89 
 
 
558 aa  247  4e-64  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.67 
 
 
571 aa  228  3e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.78 
 
 
522 aa  210  7e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  25.18 
 
 
511 aa  100  7e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.16 
 
 
476 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.51 
 
 
509 aa  73.2  0.00000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  47.44 
 
 
98 aa  72  0.00000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.68 
 
 
509 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  23 
 
 
505 aa  65.1  0.000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  24.7 
 
 
605 aa  65.5  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.53 
 
 
519 aa  63.2  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.61 
 
 
534 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  30.52 
 
 
519 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.93 
 
 
523 aa  62.4  0.00000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.41 
 
 
484 aa  60.8  0.00000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.58 
 
 
597 aa  59.7  0.0000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.29 
 
 
523 aa  59.7  0.0000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.2 
 
 
481 aa  59.3  0.0000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  23.37 
 
 
637 aa  58.5  0.0000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.75 
 
 
491 aa  58.2  0.0000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.15 
 
 
589 aa  57.8  0.0000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  31.58 
 
 
507 aa  56.2  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  30.8 
 
 
517 aa  55.8  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  25.18 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  30.92 
 
 
519 aa  55.8  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  31.34 
 
 
517 aa  56.2  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.8 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  33.62 
 
 
519 aa  55.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  20.78 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  30.05 
 
 
493 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  23.16 
 
 
635 aa  54.3  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3358  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.98 
 
 
564 aa  53.5  0.000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.54 
 
 
577 aa  53.5  0.000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13800  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.09 
 
 
547 aa  53.5  0.000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.290223  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.99 
 
 
470 aa  53.5  0.000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.57 
 
 
565 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.61 
 
 
546 aa  53.5  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.02 
 
 
527 aa  52.8  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0264  Tat pathway signal sequence domain-containing protein  36.36 
 
 
174 aa  52  0.00002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0855  L-aspartate oxidase  30.56 
 
 
538 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.0000253959  normal  0.0344943 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0999  L-aspartate oxidase  30.56 
 
 
538 aa  52  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000540636  normal  0.1199 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  30.71 
 
 
510 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35590  putative FAD-binding dehydrogenase  32.48 
 
 
577 aa  52.8  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000596962 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3501  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  45.31 
 
 
510 aa  52.4  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.83 
 
 
512 aa  52.4  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5210  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  23.94 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.247495 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1839  3-oxosteroid 1-dehydrogenase  33.33 
 
 
564 aa  52  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.121411  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2827  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.94 
 
 
511 aa  51.6  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.33 
 
 
623 aa  52  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  34.38 
 
 
570 aa  51.6  0.00003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0801  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.11 
 
 
598 aa  50.8  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  22.57 
 
 
582 aa  50.8  0.00007  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2046  L-aspartate oxidase  27.78 
 
 
550 aa  50.4  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2600  putative FAD-binding dehydrogenase  32.81 
 
 
570 aa  49.7  0.0001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.742686  normal  0.0811196 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7441  putative FAD-binding dehydrogenase  34.58 
 
 
598 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.590013  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0596  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.56 
 
 
588 aa  50.1  0.0001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.126395  normal  0.721596 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07260  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.97 
 
 
472 aa  49.7  0.0001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  30.65 
 
 
520 aa  49.7  0.0001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  31.86 
 
 
518 aa  50.1  0.0001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>