174 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_0214 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 558 aa  1098    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  53.64 
 
 		 552 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  53.97 
 
 		 555 aa  545  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  52.88 
 
 		 566 aa  540  9.999999999999999e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  52.48 
 
 		 548 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  53.12 
 
 		 545 aa  533  1e-150  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  52.23 
 
 		 551 aa  531  1e-149  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.54 
 
 		 557 aa  522  1e-147  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.56 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  53.6 
 
 		 551 aa  522  1e-147  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  51.38 
 
 		 551 aa  517  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  50.74 
 
 		 552 aa  518  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  52.95 
 
 		 551 aa  513  1e-144  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  51.47 
 
 		 558 aa  510  1e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  50.83 
 
 		 549 aa  506  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  50.36 
 
 		 557 aa  506  9.999999999999999e-143  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.66 
 
 		 550 aa  508  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  51.64 
 
 		 559 aa  501  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  52.37 
 
 		 555 aa  495  9.999999999999999e-139  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  48.91 
 
 		 558 aa  494  9.999999999999999e-139  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  53.31 
 
 		 573 aa  493  9.999999999999999e-139  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  49.19 
 
 		 558 aa  492  9.999999999999999e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.35 
 
 		 555 aa  494  9.999999999999999e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  48.82 
 
 		 556 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  48.82 
 
 		 556 aa  488  1e-137  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  51.56 
 
 		 549 aa  491  1e-137  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  48.97 
 
 		 553 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  49.81 
 
 		 551 aa  485  1e-135  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.8 
 
 		 597 aa  483  1e-135  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  48.64 
 
 		 556 aa  484  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  49.61 
 
 		 551 aa  484  1e-135  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.73 
 
 		 551 aa  461  9.999999999999999e-129  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  50 
 
 		 552 aa  456  1e-127  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.1 
 
 		 550 aa  458  1e-127  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.93 
 
 		 559 aa  443  1e-123  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.88 
 
 		 571 aa  421  1e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  34.61 
 
 		 549 aa  295  1e-78  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.18 
 
 		 537 aa  287  2.9999999999999996e-76  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  34.54 
 
 		 552 aa  278  2e-73  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  33.89 
 
 		 533 aa  248  2e-64  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.5 
 
 		 537 aa  248  3e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  33.57 
 
 		 541 aa  246  6e-64  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.5 
 
 		 537 aa  243  6e-63  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.29 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  67.11 
 
 		 98 aa  95.5  2e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  25.59 
 
 		 519 aa  86.7  0.000000000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.72 
 
 		 637 aa  83.6  0.00000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.62 
 
 		 519 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  25.59 
 
 		 668 aa  82  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  23.22 
 
 		 608 aa  79.7  0.0000000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  24.04 
 
 		 464 aa  75.9  0.000000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  22.92 
 
 		 511 aa  74.3  0.000000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  25.09 
 
 		 519 aa  72  0.00000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  24.49 
 
 		 504 aa  70.1  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.68 
 
 		 593 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  26.34 
 
 		 517 aa  69.7  0.0000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.33 
 
 		 519 aa  69.3  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  24.77 
 
 		 616 aa  68.6  0.0000000003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  23.19 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  23.02 
 
 		 589 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.26 
 
 		 509 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.11 
 
 		 527 aa  67.8  0.0000000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.09 
 
 		 517 aa  66.6  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  25.45 
 
 		 517 aa  66.2  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.46 
 
 		 509 aa  65.5  0.000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  24.64 
 
 		 598 aa  65.1  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  24.18 
 
 		 598 aa  64.3  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  22.31 
 
 		 507 aa  63.5  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  23.75 
 
 		 957 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  21.95 
 
 		 508 aa  62.4  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.41 
 
 		 588 aa  61.6  0.00000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.89 
 
 		 623 aa  61.2  0.00000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.92 
 
 		 498 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  24.5 
 
 		 589 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  28.28 
 
 		 499 aa  58.9  0.0000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  24.3 
 
 		 583 aa  58.9  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.99 
 
 		 523 aa  59.3  0.0000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  23.38 
 
 		 561 aa  59.3  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  19.82 
 
 		 600 aa  57.8  0.0000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  31.85 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.81 
 
 		 476 aa  57.8  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2511  flavocytochrome c  29.79 
 
 		 507 aa  57.8  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.842513  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  25 
 
 		 597 aa  57.8  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  24.53 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.77 
 
 		 523 aa  57  0.0000009  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  29.92 
 
 		 591 aa  57  0.0000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  23.71 
 
 		 925 aa  57  0.0000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.03 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_26410  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  26.92 
 
 		 546 aa  56.2  0.000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.991458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  26.33 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  26.33 
 
 		 587 aa  56.6  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  28.62 
 
 		 596 aa  55.5  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  24.95 
 
 		 596 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.23 
 
 		 493 aa  55.1  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  27.43 
 
 		 511 aa  55.5  0.000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  28.62 
 
 		 596 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  28.48 
 
 		 596 aa  54.7  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  27.83 
 
 		 512 aa  54.7  0.000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  23.58 
 
 		 521 aa  55.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  27.53 
 
 		 596 aa  54.7  0.000005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>