234 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_1725 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  64.4 
 
 
558 aa  680    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  64.25 
 
 
553 aa  669    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  65.36 
 
 
551 aa  654    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.37 
 
 
571 aa  668    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  63.8 
 
 
566 aa  698    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  71.85 
 
 
548 aa  791    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.81 
 
 
550 aa  726    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  70.3 
 
 
552 aa  761    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  65.14 
 
 
549 aa  686    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  64.78 
 
 
552 aa  657    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  64.22 
 
 
557 aa  677    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  63.65 
 
 
556 aa  688    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  62.96 
 
 
555 aa  683    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  64.18 
 
 
551 aa  731    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.91 
 
 
557 aa  692    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  60.86 
 
 
558 aa  671    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  60.32 
 
 
558 aa  668    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  72.28 
 
 
555 aa  752    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  66.41 
 
 
549 aa  696    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  69.26 
 
 
573 aa  697    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 
551 aa  1117    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  63.65 
 
 
556 aa  688    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  64.65 
 
 
555 aa  703    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  69.51 
 
 
551 aa  716    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  63.11 
 
 
556 aa  683    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  63.92 
 
 
545 aa  696    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  68.05 
 
 
551 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  64.59 
 
 
552 aa  704    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  62.92 
 
 
559 aa  671    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  65.18 
 
 
551 aa  657    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.37 
 
 
597 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.84 
 
 
550 aa  602  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.35 
 
 
551 aa  593  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.17 
 
 
559 aa  567  1e-160  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.01 
 
 
558 aa  555  1e-156  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.94 
 
 
571 aa  533  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.9 
 
 
552 aa  352  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.35 
 
 
549 aa  343  4e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.73 
 
 
537 aa  332  1e-89  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  37.29 
 
 
541 aa  322  9.999999999999999e-87  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.73 
 
 
537 aa  319  9e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.17 
 
 
537 aa  315  1.9999999999999998e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  37.5 
 
 
533 aa  312  9e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30 
 
 
522 aa  108  2e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  69.74 
 
 
98 aa  105  2e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  25.89 
 
 
616 aa  80.5  0.00000000000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.22 
 
 
519 aa  77  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  31.22 
 
 
499 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  21.64 
 
 
597 aa  73.2  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  24.07 
 
 
637 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.74 
 
 
464 aa  68.9  0.0000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.95 
 
 
593 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  21.79 
 
 
511 aa  68.6  0.0000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  38.89 
 
 
515 aa  67.4  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.48 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.48 
 
 
587 aa  65.9  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.32 
 
 
561 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.83 
 
 
502 aa  62  0.00000003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.79 
 
 
543 aa  62  0.00000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  22.87 
 
 
519 aa  59.7  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.75 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  27.47 
 
 
517 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.18 
 
 
509 aa  58.5  0.0000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  32.39 
 
 
481 aa  58.5  0.0000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.49 
 
 
519 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  29.23 
 
 
512 aa  57.4  0.0000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.22 
 
 
509 aa  57.4  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  40.37 
 
 
484 aa  57.4  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  42.31 
 
 
521 aa  57  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  26.41 
 
 
598 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.07 
 
 
598 aa  56.2  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.5 
 
 
596 aa  56.2  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  35.88 
 
 
520 aa  55.8  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  23.25 
 
 
482 aa  55.8  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  41.79 
 
 
627 aa  55.5  0.000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  25.77 
 
 
517 aa  55.1  0.000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  24.13 
 
 
596 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  46.27 
 
 
1004 aa  55.5  0.000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  23.12 
 
 
608 aa  54.7  0.000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.29 
 
 
527 aa  55.1  0.000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  21.47 
 
 
504 aa  54.7  0.000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  24.5 
 
 
597 aa  54.3  0.000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  22.12 
 
 
505 aa  53.9  0.000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  42.19 
 
 
598 aa  53.9  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.78 
 
 
534 aa  53.9  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  29.9 
 
 
521 aa  53.9  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  44.62 
 
 
589 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.83 
 
 
498 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  35.71 
 
 
588 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  38.37 
 
 
616 aa  52.8  0.00002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  43.42 
 
 
519 aa  52.8  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  37.18 
 
 
589 aa  52.4  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  23.2 
 
 
507 aa  52.8  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  25.48 
 
 
623 aa  52  0.00003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  44.62 
 
 
591 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  23.68 
 
 
519 aa  51.6  0.00004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3826  hypothetical protein  35.9 
 
 
91 aa  51.2  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.74 
 
 
523 aa  50.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  29.26 
 
 
510 aa  50.8  0.00006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  27.54 
 
 
500 aa  50.4  0.00007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>