245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5132 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  62.89 
 
 
551 aa  658    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  79.78 
 
 
566 aa  848    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  65.18 
 
 
552 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.45 
 
 
571 aa  636    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  64.62 
 
 
551 aa  670    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  61.55 
 
 
556 aa  643    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  62.94 
 
 
552 aa  676    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  66.48 
 
 
548 aa  709    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  65.62 
 
 
549 aa  637    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  61.55 
 
 
556 aa  643    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 
555 aa  1113    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.59 
 
 
557 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  61.91 
 
 
556 aa  645    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  65.69 
 
 
551 aa  654    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  95.21 
 
 
545 aa  1006    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  68.91 
 
 
555 aa  671    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  64.2 
 
 
551 aa  652    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  62.32 
 
 
558 aa  651    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  66.79 
 
 
550 aa  672    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  65.5 
 
 
573 aa  631  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  61.13 
 
 
559 aa  624  1e-177  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  59.82 
 
 
549 aa  620  1e-176  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  61.06 
 
 
555 aa  615  1e-175  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  60.66 
 
 
557 aa  612  9.999999999999999e-175  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  58.11 
 
 
558 aa  614  9.999999999999999e-175  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  58.96 
 
 
553 aa  611  9.999999999999999e-175  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  56.65 
 
 
558 aa  605  9.999999999999999e-173  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.63 
 
 
597 aa  598  1e-170  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  62.89 
 
 
552 aa  601  1e-170  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  59.85 
 
 
551 aa  596  1e-169  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  59.85 
 
 
551 aa  596  1e-169  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.04 
 
 
550 aa  584  1.0000000000000001e-165  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.07 
 
 
551 aa  575  1.0000000000000001e-162  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.97 
 
 
558 aa  543  1e-153  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.54 
 
 
559 aa  536  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.61 
 
 
571 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  40 
 
 
552 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  40 
 
 
533 aa  324  2e-87  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  38.22 
 
 
541 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  38.42 
 
 
549 aa  320  5e-86  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.59 
 
 
537 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.7 
 
 
537 aa  313  7.999999999999999e-84  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.55 
 
 
537 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  31.07 
 
 
522 aa  182  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  60.92 
 
 
98 aa  100  5e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.28 
 
 
608 aa  100  9e-20  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.82 
 
 
511 aa  83.2  0.00000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  24.69 
 
 
561 aa  82.8  0.00000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  24.05 
 
 
504 aa  81.6  0.00000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  23.95 
 
 
597 aa  80.5  0.00000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  24.64 
 
 
508 aa  79.3  0.0000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  25 
 
 
598 aa  79  0.0000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  25.77 
 
 
616 aa  78.2  0.0000000000004  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.89 
 
 
476 aa  77.4  0.0000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.63 
 
 
509 aa  76.6  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.45 
 
 
509 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.55 
 
 
527 aa  75.5  0.000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.41 
 
 
589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  23.83 
 
 
519 aa  72  0.00000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  24.78 
 
 
511 aa  71.6  0.00000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  25.59 
 
 
627 aa  70.9  0.00000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.43 
 
 
523 aa  69.3  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  23.57 
 
 
637 aa  69.3  0.0000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1095  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.91 
 
 
482 aa  68.6  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  27.47 
 
 
499 aa  67.8  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.52 
 
 
523 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  21.78 
 
 
502 aa  67.8  0.0000000006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  22.71 
 
 
591 aa  66.6  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  26.74 
 
 
586 aa  66.6  0.000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  26.43 
 
 
623 aa  65.9  0.000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  24.5 
 
 
609 aa  63.9  0.000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  23.8 
 
 
588 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  26.87 
 
 
586 aa  62.4  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  28.7 
 
 
512 aa  62  0.00000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.96 
 
 
543 aa  61.6  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  31.58 
 
 
521 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.63 
 
 
519 aa  60.5  0.00000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  22.28 
 
 
668 aa  57.4  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1037  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.44 
 
 
463 aa  57.8  0.0000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.192722  normal  0.0849595 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.69 
 
 
481 aa  57  0.0000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  25.52 
 
 
570 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.06 
 
 
484 aa  55.5  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  27.78 
 
 
500 aa  55.5  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  23.19 
 
 
659 aa  55.8  0.000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.58 
 
 
589 aa  54.7  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  24.62 
 
 
570 aa  55.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  23.12 
 
 
596 aa  55.1  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  36.25 
 
 
515 aa  54.7  0.000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.91 
 
 
593 aa  53.9  0.000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  21.93 
 
 
507 aa  53.9  0.000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  23.04 
 
 
569 aa  53.5  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.65 
 
 
598 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_21320  fumarate reductase/succinate dehyfrogenase, flavoprotein subunit  25.74 
 
 
514 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.22533  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  20.48 
 
 
464 aa  53.1  0.00001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  21.63 
 
 
644 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1005  hypothetical protein  47.13 
 
 
555 aa  53.5  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0143655 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  27.24 
 
 
491 aa  52.4  0.00002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  37.08 
 
 
582 aa  52.8  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  40.28 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2827  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.74 
 
 
511 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>