184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_0883 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  65.38 
 
 		 558 aa  678    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  68.61 
 
 		 548 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 		 552 aa  1115    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  63.92 
 
 		 549 aa  681    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  66.85 
 
 		 552 aa  713    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.92 
 
 		 597 aa  641    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  65.52 
 
 		 552 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  64.22 
 
 		 557 aa  666    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  61.8 
 
 		 556 aa  658    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  63.57 
 
 		 555 aa  675    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  63.72 
 
 		 559 aa  662    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  68.42 
 
 		 551 aa  702    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  61.76 
 
 		 558 aa  671    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  67.09 
 
 		 550 aa  669    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  70.29 
 
 		 573 aa  687    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  67.25 
 
 		 549 aa  674    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  61.8 
 
 		 556 aa  658    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  65.27 
 
 		 555 aa  695    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  63.02 
 
 		 558 aa  683    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  61.62 
 
 		 556 aa  652    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  66.18 
 
 		 545 aa  704    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.25 
 
 		 571 aa  675    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  67.55 
 
 		 551 aa  704    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.07 
 
 		 557 aa  686    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  63.34 
 
 		 551 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  64.35 
 
 		 566 aa  691    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  70.3 
 
 		 551 aa  739    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  64.25 
 
 		 553 aa  671    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  68.04 
 
 		 555 aa  686    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  62.87 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  62.87 
 
 		 551 aa  632  1e-180  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.34 
 
 		 550 aa  578  1e-164  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.68 
 
 		 551 aa  581  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.41 
 
 		 558 aa  549  1e-155  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.14 
 
 		 559 aa  546  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.43 
 
 		 571 aa  523  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  38.07 
 
 		 552 aa  323  7e-87  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.36 
 
 		 537 aa  318  2e-85  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  37.09 
 
 		 549 aa  316  8e-85  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.93 
 
 		 541 aa  315  9.999999999999999e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  37.73 
 
 		 533 aa  304  3.0000000000000004e-81  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.9 
 
 		 537 aa  293  6e-78  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.06 
 
 		 537 aa  291  2e-77  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.09 
 
 		 522 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  66.67 
 
 		 98 aa  103  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.63 
 
 		 511 aa  82  0.00000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  24.42 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  31.58 
 
 		 499 aa  72  0.00000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.78 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  32.92 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.42 
 
 		 509 aa  70.1  0.0000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.08 
 
 		 608 aa  66.2  0.000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  25.94 
 
 		 589 aa  65.1  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  22.42 
 
 		 597 aa  64.7  0.000000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.62 
 
 		 476 aa  63.5  0.000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  30.57 
 
 		 517 aa  63.5  0.000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.62 
 
 		 457 aa  63.2  0.00000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.39 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  22.56 
 
 		 589 aa  62.4  0.00000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.61 
 
 		 527 aa  62  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  26.86 
 
 		 519 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  30.32 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  26.39 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  29.24 
 
 		 510 aa  57.4  0.0000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.47 
 
 		 504 aa  57.8  0.0000006  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.14 
 
 		 491 aa  57  0.0000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.3 
 
 		 519 aa  57  0.0000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.65 
 
 		 543 aa  56.6  0.000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  32.46 
 
 		 515 aa  56.6  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  26.67 
 
 		 519 aa  56.6  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  20.11 
 
 		 502 aa  55.8  0.000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  23.09 
 
 		 508 aa  55.5  0.000003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4178  flavocytochrome c flavin subunit  27.05 
 
 		 500 aa  55.5  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.630459 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  36.71 
 
 		 637 aa  54.7  0.000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.67 
 
 		 534 aa  54.7  0.000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.11 
 
 		 481 aa  54.3  0.000005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2731  putative flavoprotein subunit of a reductase  22.7 
 
 		 507 aa  54.7  0.000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.620849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  26.55 
 
 		 598 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  26.38 
 
 		 588 aa  53.9  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  30.99 
 
 		 484 aa  53.5  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  30.77 
 
 		 521 aa  53.1  0.00001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  21.54 
 
 		 600 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0639  tricarballylate dehydrogenase  25.75 
 
 		 479 aa  52.4  0.00002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  25.63 
 
 		 596 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  31.15 
 
 		 591 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20340  putative succinate dehydrogenase  33.08 
 
 		 581 aa  52.8  0.00002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.78266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  32.14 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  24.68 
 
 		 586 aa  51.6  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.02 
 
 		 523 aa  52  0.00003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  32.14 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  32.14 
 
 		 487 aa  52  0.00003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 435 aa  51.6  0.00004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03720  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  21.57 
 
 		 558 aa  50.4  0.00008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  23.65 
 
 		 561 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  28.66 
 
 		 517 aa  49.7  0.0001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  24.79 
 
 		 500 aa  49.7  0.0001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  35.29 
 
 		 582 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  38.46 
 
 		 616 aa  49.7  0.0001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  37.04 
 
 		 593 aa  49.3  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  23.93 
 
 		 469 aa  48.9  0.0002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>