252 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0191 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  100 
 
 		 550 aa  1081    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  61.31 
 
 		 548 aa  637    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  65.88 
 
 		 551 aa  686    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.49 
 
 		 550 aa  631  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  61.06 
 
 		 555 aa  630  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  60.88 
 
 		 545 aa  627  1e-178  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  63.3 
 
 		 555 aa  621  1e-177  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  61.15 
 
 		 551 aa  620  1e-176  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  60.19 
 
 		 552 aa  617  1e-175  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  58.95 
 
 		 552 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  60 
 
 		 566 aa  608  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  59.64 
 
 		 559 aa  601  1.0000000000000001e-171  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  62.18 
 
 		 549 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  59.42 
 
 		 557 aa  596  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  58.35 
 
 		 558 aa  594  1e-168  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  62.04 
 
 		 551 aa  589  1e-167  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.06 
 
 		 551 aa  588  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.78 
 
 		 555 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  58.67 
 
 		 553 aa  582  1.0000000000000001e-165  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  60.72 
 
 		 551 aa  582  1.0000000000000001e-165  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  60.14 
 
 		 552 aa  576  1.0000000000000001e-163  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  56.04 
 
 		 556 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  55.8 
 
 		 558 aa  575  1.0000000000000001e-163  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  56.04 
 
 		 556 aa  576  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  55.86 
 
 		 556 aa  577  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  54.87 
 
 		 558 aa  574  1.0000000000000001e-162  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.88 
 
 		 559 aa  573  1.0000000000000001e-162  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.65 
 
 		 571 aa  561  1.0000000000000001e-159  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  60.58 
 
 		 573 aa  559  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  55.66 
 
 		 549 aa  556  1e-157  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.19 
 
 		 571 aa  552  1e-156  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.37 
 
 		 597 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  56.38 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  56.31 
 
 		 557 aa  551  1e-155  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  56.38 
 
 		 551 aa  550  1e-155  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  51.1 
 
 		 558 aa  491  1e-137  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  35.4 
 
 		 549 aa  307  3e-82  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.18 
 
 		 552 aa  298  1e-79  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.45 
 
 		 537 aa  296  6e-79  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  36.63 
 
 		 533 aa  293  4e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  35.28 
 
 		 541 aa  280  4e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.07 
 
 		 537 aa  264  3e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.33 
 
 		 537 aa  264  4e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.81 
 
 		 522 aa  144  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  67.53 
 
 		 98 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.39 
 
 		 511 aa  89.7  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  24.5 
 
 		 597 aa  87  9e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.42 
 
 		 509 aa  83.6  0.000000000000009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  26.76 
 
 		 593 aa  80.9  0.00000000000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.37 
 
 		 534 aa  75.5  0.000000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  24.42 
 
 		 659 aa  74.3  0.000000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  23.84 
 
 		 627 aa  73.9  0.000000000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  25.81 
 
 		 608 aa  73.2  0.00000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.23 
 
 		 637 aa  73.6  0.00000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  23.78 
 
 		 583 aa  71.2  0.00000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  23.2 
 
 		 504 aa  70.9  0.00000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  23.45 
 
 		 587 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  23.45 
 
 		 587 aa  70.1  0.00000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.36 
 
 		 476 aa  69.3  0.0000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.2 
 
 		 527 aa  67  0.0000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  26.57 
 
 		 482 aa  65.9  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  22.91 
 
 		 589 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  30.13 
 
 		 499 aa  65.1  0.000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0508  putative dehydrogenase flavoprotein  25.42 
 
 		 560 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  24.5 
 
 		 596 aa  65.1  0.000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.8 
 
 		 523 aa  64.7  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  22.91 
 
 		 589 aa  64.3  0.000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  22.96 
 
 		 505 aa  64.3  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.48 
 
 		 509 aa  63.9  0.000000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  41.05 
 
 		 521 aa  63.9  0.000000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16630  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  25.12 
 
 		 600 aa  63.5  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.770903  normal  0.816981 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  22.26 
 
 		 668 aa  63.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.78 
 
 		 543 aa  63.2  0.00000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  28.37 
 
 		 598 aa  62.4  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  24.32 
 
 		 596 aa  62.4  0.00000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  30.29 
 
 		 510 aa  62.8  0.00000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  26.18 
 
 		 623 aa  62.4  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  25.18 
 
 		 596 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  25.18 
 
 		 596 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  25.18 
 
 		 596 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  25.18 
 
 		 596 aa  62  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.35 
 
 		 519 aa  61.6  0.00000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  29.95 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.32 
 
 		 596 aa  60.8  0.00000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  30.11 
 
 		 512 aa  61.2  0.00000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  22.79 
 
 		 561 aa  61.2  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3960  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.95 
 
 		 577 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000052594  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  26.05 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000007  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  25.63 
 
 		 502 aa  59.7  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.71 
 
 		 465 aa  59.7  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  23.96 
 
 		 597 aa  60.1  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0405  FMN-binding domain protein  24.16 
 
 		 626 aa  59.7  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.07228 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  22.57 
 
 		 596 aa  59.7  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  22.76 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  24.14 
 
 		 596 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  28.47 
 
 		 598 aa  59.3  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  45 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  27.82 
 
 		 596 aa  58.2  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6873  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  23.42 
 
 		 569 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.901911  normal  0.6243 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  22.06 
 
 		 596 aa  57.4  0.0000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>