244 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_0163 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  63.78 
 
 		 551 aa  643    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  73.87 
 
 		 550 aa  735    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  65.21 
 
 		 557 aa  691    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  68.65 
 
 		 552 aa  735    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  63 
 
 		 549 aa  675    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.29 
 
 		 571 aa  679    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  69.53 
 
 		 549 aa  697    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  74.53 
 
 		 555 aa  759    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  66.24 
 
 		 552 aa  662    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  61.1 
 
 		 557 aa  644    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 		 548 aa  1102    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.22 
 
 		 597 aa  649    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  62.09 
 
 		 556 aa  660    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  63.12 
 
 		 555 aa  660    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  62.89 
 
 		 558 aa  671    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  64.25 
 
 		 553 aa  680    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  60.57 
 
 		 558 aa  657    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  71.65 
 
 		 573 aa  717    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  70.36 
 
 		 551 aa  723    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  68.19 
 
 		 551 aa  727    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  62.09 
 
 		 556 aa  660    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  66.61 
 
 		 555 aa  709    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  63.37 
 
 		 559 aa  659    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  61.55 
 
 		 556 aa  655    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  66.48 
 
 		 566 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  67.34 
 
 		 545 aa  717    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  68.56 
 
 		 551 aa  708    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  71.69 
 
 		 551 aa  754    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  65.87 
 
 		 552 aa  706    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  63.78 
 
 		 551 aa  643    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  61.29 
 
 		 558 aa  665    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.26 
 
 		 551 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  57.82 
 
 		 559 aa  592  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.62 
 
 		 550 aa  591  1e-167  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  54.24 
 
 		 571 aa  543  1e-153  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.58 
 
 		 558 aa  536  1e-151  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.82 
 
 		 552 aa  333  3e-90  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  36.18 
 
 		 549 aa  328  1.0000000000000001e-88  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.98 
 
 		 537 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  36.2 
 
 		 541 aa  321  3e-86  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  37.41 
 
 		 533 aa  310  2.9999999999999997e-83  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.43 
 
 		 537 aa  310  4e-83  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.62 
 
 		 537 aa  306  6e-82  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.1 
 
 		 522 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  69.74 
 
 		 98 aa  101  3e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  24.68 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  22.46 
 
 		 608 aa  82  0.00000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  22.63 
 
 		 597 aa  80.5  0.00000000000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3056  tricarballylate dehydrogenase  24.67 
 
 		 482 aa  79.7  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.36 
 
 		 519 aa  75.5  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.5 
 
 		 509 aa  73.9  0.000000000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  23.3 
 
 		 464 aa  73.6  0.000000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  22.92 
 
 		 465 aa  73.2  0.00000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.04 
 
 		 589 aa  73.2  0.00000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  31.11 
 
 		 512 aa  72  0.00000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  24.2 
 
 		 505 aa  70.9  0.00000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.61 
 
 		 509 aa  70.5  0.00000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3181  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.89 
 
 		 523 aa  70.1  0.00000000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.357921  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.01 
 
 		 476 aa  69.7  0.0000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  25.23 
 
 		 637 aa  70.1  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  23.6 
 
 		 668 aa  69.3  0.0000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.68 
 
 		 504 aa  67.8  0.0000000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  24.69 
 
 		 508 aa  67.4  0.0000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.07 
 
 		 499 aa  67.4  0.0000000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.54 
 
 		 600 aa  66.6  0.000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3815  tricarballylate dehydrogenase  29.11 
 
 		 469 aa  65.9  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.990462 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.99 
 
 		 543 aa  65.1  0.000000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3252  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.85 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.556116  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  22.95 
 
 		 561 aa  65.5  0.000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3488  tricarballylate dehydrogenase  24.51 
 
 		 486 aa  64.3  0.000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_03140  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.31 
 
 		 594 aa  63.2  0.00000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  24.33 
 
 		 501 aa  62  0.00000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  23.79 
 
 		 659 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  24.69 
 
 		 519 aa  61.2  0.00000005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1643  FAD binding domain-containing protein  32.44 
 
 		 491 aa  60.8  0.00000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1218  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  25.53 
 
 		 500 aa  60.8  0.00000006  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.292447  normal  0.0459445 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  31.43 
 
 		 481 aa  60.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  23.38 
 
 		 502 aa  60.5  0.00000007  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6017  tricarballylate dehydrogenase  25.91 
 
 		 469 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.652214 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  29.54 
 
 		 588 aa  59.3  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  29.19 
 
 		 519 aa  58.9  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5148  tricarballylate dehydrogenase  25.89 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.226548  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0794  tricarballylate dehydrogenase  24.86 
 
 		 474 aa  58.5  0.0000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.89 
 
 		 484 aa  58.5  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4070  tricarballylate dehydrogenase  24.53 
 
 		 479 aa  58.5  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2086  tricarballylate dehydrogenase  27.85 
 
 		 471 aa  58.5  0.0000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.32911  normal  0.0400814 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3415  tricarballylate dehydrogenase  24.31 
 
 		 479 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  24.91 
 
 		 586 aa  58.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  24.24 
 
 		 584 aa  57.8  0.0000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5878  tricarballylate dehydrogenase  23.98 
 
 		 469 aa  57.8  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  41.25 
 
 		 515 aa  57.4  0.0000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2727  putative succinate dehydrogenase  24.23 
 
 		 569 aa  57  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.94 
 
 		 534 aa  57.4  0.0000008  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3858  tricarballylate dehydrogenase  27.59 
 
 		 474 aa  57  0.0000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000815395 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6301  tricarballylate dehydrogenase  24.8 
 
 		 468 aa  57  0.0000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  22.8 
 
 		 521 aa  56.6  0.000001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  23.02 
 
 		 591 aa  55.8  0.000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5626  tricarballylate dehydrogenase  25.07 
 
 		 469 aa  55.8  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  26.86 
 
 		 598 aa  56.2  0.000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  27.39 
 
 		 517 aa  55.8  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>