220 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_3486 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  79.92 
 
 
533 aa  833    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  74.06 
 
 
541 aa  783    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  76.52 
 
 
552 aa  804    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  100 
 
 
537 aa  1084    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  97.02 
 
 
537 aa  1010    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  54.05 
 
 
549 aa  533  1e-150  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  47.36 
 
 
537 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  37.8 
 
 
548 aa  313  4.999999999999999e-84  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  39.08 
 
 
555 aa  312  1e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  38.86 
 
 
555 aa  311  2e-83  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  38.35 
 
 
551 aa  310  4e-83  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  37.94 
 
 
545 aa  308  1.0000000000000001e-82  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  37.5 
 
 
566 aa  303  4.0000000000000003e-81  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  36.2 
 
 
549 aa  302  1e-80  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  37.34 
 
 
556 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  37.34 
 
 
556 aa  301  2e-80  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  37.71 
 
 
551 aa  300  5e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  37.34 
 
 
556 aa  300  5e-80  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.27 
 
 
557 aa  299  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  34.92 
 
 
552 aa  293  4e-78  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.48 
 
 
551 aa  292  1e-77  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  37.11 
 
 
552 aa  290  6e-77  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  38.49 
 
 
549 aa  290  6e-77  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.13 
 
 
597 aa  289  7e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  36.15 
 
 
558 aa  288  2e-76  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  35.58 
 
 
558 aa  288  2e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.1 
 
 
559 aa  280  4e-74  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  34.91 
 
 
557 aa  278  1e-73  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  35.37 
 
 
558 aa  279  1e-73  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  37.09 
 
 
559 aa  278  2e-73  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.83 
 
 
550 aa  278  3e-73  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  33.83 
 
 
553 aa  272  1e-71  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.82 
 
 
571 aa  271  2e-71  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.7 
 
 
571 aa  271  2.9999999999999997e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.48 
 
 
555 aa  268  1e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  37.27 
 
 
552 aa  266  8.999999999999999e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  34.54 
 
 
551 aa  254  3e-66  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  34.8 
 
 
551 aa  253  4.0000000000000004e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  33.84 
 
 
551 aa  249  1e-64  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  34.23 
 
 
573 aa  246  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  33.46 
 
 
551 aa  244  1.9999999999999999e-63  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  35.5 
 
 
558 aa  243  5e-63  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.3 
 
 
550 aa  241  4e-62  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.78 
 
 
522 aa  209  8e-53  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  23.89 
 
 
511 aa  100  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.89 
 
 
476 aa  82.8  0.00000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  27.29 
 
 
484 aa  79.3  0.0000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  26.34 
 
 
470 aa  70.1  0.00000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  47.37 
 
 
98 aa  70.1  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  29.65 
 
 
519 aa  68.6  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.56 
 
 
543 aa  64.3  0.000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  23.6 
 
 
635 aa  63.5  0.000000008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  27.52 
 
 
519 aa  63.2  0.00000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.82 
 
 
509 aa  62.4  0.00000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  34.42 
 
 
519 aa  62.4  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2930  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.27 
 
 
512 aa  62.4  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.3 
 
 
464 aa  61.6  0.00000004  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2825  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.52 
 
 
498 aa  61.2  0.00000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  22.14 
 
 
627 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  31.42 
 
 
517 aa  60.8  0.00000005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  24.21 
 
 
481 aa  60.8  0.00000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  22.42 
 
 
509 aa  60.8  0.00000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  30.4 
 
 
517 aa  59.7  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0208  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.02 
 
 
534 aa  59.3  0.0000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.000177  normal  0.616185 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.37 
 
 
465 aa  60.1  0.0000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  24.15 
 
 
603 aa  59.3  0.0000002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  21.35 
 
 
457 aa  59.3  0.0000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  24.39 
 
 
589 aa  58.5  0.0000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0287  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.43 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.205707  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  30.4 
 
 
517 aa  58.5  0.0000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0297  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.43 
 
 
514 aa  58.5  0.0000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.374229 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  20.04 
 
 
502 aa  57.8  0.0000004  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  21.67 
 
 
597 aa  58.2  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  22.88 
 
 
527 aa  57.4  0.0000006  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.96 
 
 
493 aa  56.2  0.000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000784469 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  21.36 
 
 
598 aa  55.8  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0278  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  26.24 
 
 
514 aa  55.8  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.93633 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  24.01 
 
 
582 aa  55.5  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  21.93 
 
 
598 aa  54.3  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2865  3-ketosteroid-delta-1-dehydrogenase  24.27 
 
 
513 aa  54.3  0.000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.417281  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  27.52 
 
 
515 aa  53.9  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3820  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.95 
 
 
554 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0510368  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  23.66 
 
 
582 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  24.1 
 
 
591 aa  53.5  0.000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  23.66 
 
 
582 aa  53.5  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  22.48 
 
 
637 aa  53.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  22.96 
 
 
588 aa  52.8  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4077  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  25.82 
 
 
491 aa  53.1  0.00001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3358  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  28.34 
 
 
564 aa  52.8  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.367736 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  32.33 
 
 
499 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  21.65 
 
 
504 aa  52.4  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  27.67 
 
 
623 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6400  tricarballylate dehydrogenase  22.74 
 
 
502 aa  52  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.479436  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  27.02 
 
 
587 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  27.02 
 
 
587 aa  51.6  0.00003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4671  putative 3-oxosteroid 1-dehydrogenase  34.38 
 
 
577 aa  52  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2146  putative FAD-binding dehydrogenase  32.88 
 
 
570 aa  51.6  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.18708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2808  tricarballylate dehydrogenase  22.43 
 
 
503 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3243  putative FAD-binding dehydrogenase  30.94 
 
 
570 aa  51.2  0.00004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.650049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3536  flavocytochrome c  33.33 
 
 
506 aa  51.2  0.00004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>