228 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3775 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0670  putative FAD-binding dehydrogenase  82.53 
 
 
551 aa  856    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10800  putative FAD-binding dehydrogenase  61.17 
 
 
566 aa  643    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06450  predicted oxidoreductase  60.29 
 
 
559 aa  637    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0883  putative FAD-binding dehydrogenase  64.26 
 
 
552 aa  683    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.237453  normal  0.672197 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3745  putative FAD-binding dehydrogenase  61.47 
 
 
549 aa  659    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2248  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  64.13 
 
 
555 aa  659    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.826896  normal  0.613804 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1896  putative FAD-binding dehydrogenase  63.74 
 
 
557 aa  672    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1725  putative FAD-binding dehydrogenase  64.44 
 
 
551 aa  660    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.64226  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3775  putative FAD-binding dehydrogenase  100 
 
 
553 aa  1120    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3994  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.28 
 
 
571 aa  646    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.542255  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3668  putative FAD-binding dehydrogenase  65.15 
 
 
552 aa  715    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114123  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1140  putative FAD-binding dehydrogenase  66.09 
 
 
573 aa  653    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.196555  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6214  putative FAD-binding dehydrogenase  60.22 
 
 
551 aa  639    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1043  putative FAD-binding dehydrogenase  60.22 
 
 
558 aa  643    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2085  putative FAD-binding dehydrogenase  62.64 
 
 
558 aa  660    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.376668  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1621  putative FAD-binding dehydrogenase  59.82 
 
 
545 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2532  putative FAD-binding dehydrogenase  64.65 
 
 
551 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.608155 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0163  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  64.42 
 
 
548 aa  702    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2713  putative FAD-binding dehydrogenase  65.03 
 
 
551 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0401801  hitchhiker  0.00069854 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0628  putative FAD-binding dehydrogenase  82.16 
 
 
551 aa  850    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4560  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.23 
 
 
557 aa  663    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.935324  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0957  putative FAD-binding dehydrogenase  58.92 
 
 
558 aa  633  1e-180  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5132  putative FAD-binding dehydrogenase  59.12 
 
 
555 aa  634  1e-180  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3223  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.96 
 
 
550 aa  627  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5200  putative FAD-binding dehydrogenase  58.95 
 
 
556 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5288  putative FAD-binding dehydrogenase  58.95 
 
 
556 aa  626  1e-178  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.918325  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5580  putative FAD-binding dehydrogenase  58.59 
 
 
556 aa  625  1e-178  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.684507  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4333  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.96 
 
 
597 aa  618  1e-176  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08090  predicted oxidoreductase  60.89 
 
 
549 aa  620  1e-176  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0173464  normal  0.283602 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0675  putative FAD-binding dehydrogenase  59.62 
 
 
552 aa  611  1e-173  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.935742  normal  0.139475 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0741  putative FAD-binding dehydrogenase  57.38 
 
 
555 aa  604  1.0000000000000001e-171  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1100  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.86 
 
 
551 aa  562  1.0000000000000001e-159  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000939173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0191  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.41 
 
 
550 aa  561  1e-158  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1344  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  52.72 
 
 
559 aa  514  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.543603  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0214  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  48.9 
 
 
558 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2414  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.09 
 
 
571 aa  484  1e-135  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0440095  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2343  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  35.04 
 
 
552 aa  303  4.0000000000000003e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1445  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.1 
 
 
537 aa  303  5.000000000000001e-81  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.223151  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4675  putative fumarate reductase flavoprotein  35.52 
 
 
533 aa  291  2e-77  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572233  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0870  putative fumarate reductase flavoprotein  35.45 
 
 
549 aa  288  2e-76  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2809  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  34.44 
 
 
537 aa  286  7e-76  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3510  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein-like  32.85 
 
 
541 aa  285  2.0000000000000002e-75  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3486  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  33.83 
 
 
537 aa  277  3e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.664087  normal  0.809041 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1003  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  28.23 
 
 
522 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03960  FAD dependent oxidoreductase  60.81 
 
 
98 aa  94.7  3e-18  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.933434  normal  0.205844 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  23.1 
 
 
668 aa  77.8  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_53948  Osmotic growth protein  24.61 
 
 
659 aa  68.9  0.0000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.621591 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  20.72 
 
 
597 aa  69.3  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0795  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  23.22 
 
 
509 aa  68.6  0.0000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.820864  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  22.04 
 
 
464 aa  67  0.0000000008  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  23.37 
 
 
627 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  24.68 
 
 
589 aa  65.5  0.000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1029  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.7 
 
 
509 aa  65.1  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0945  Succinate dehydrogenase  22.53 
 
 
511 aa  64.7  0.000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13450  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  23.59 
 
 
600 aa  63.5  0.000000008  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22640  aspartate oxidase  27.39 
 
 
623 aa  62  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.73746 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  24.2 
 
 
476 aa  61.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2203  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  21.4 
 
 
519 aa  60.8  0.00000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  29.54 
 
 
499 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  23.19 
 
 
596 aa  57.4  0.0000006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  31.65 
 
 
515 aa  57  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  22.37 
 
 
591 aa  56.6  0.000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4911  putative FAD-binding dehydrogenase  23.7 
 
 
578 aa  56.6  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.855718  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  31.85 
 
 
515 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1064  tricarballylate dehydrogenase  22.08 
 
 
505 aa  56.2  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  30.19 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  41.18 
 
 
637 aa  55.8  0.000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  38.1 
 
 
515 aa  55.8  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.86 
 
 
465 aa  55.8  0.000002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  25.86 
 
 
512 aa  55.5  0.000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02520  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  21.45 
 
 
527 aa  55.8  0.000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.152988  normal  0.211132 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4550  hypothetical protein  47.62 
 
 
482 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.288577 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3846  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  44.71 
 
 
486 aa  55.1  0.000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  22.74 
 
 
588 aa  55.5  0.000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3686  hypothetical protein  36.75 
 
 
484 aa  55.1  0.000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  40.74 
 
 
616 aa  54.7  0.000005  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0777  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.23 
 
 
566 aa  54.3  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2826  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  24.58 
 
 
543 aa  53.9  0.000007  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  24.52 
 
 
583 aa  53.9  0.000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0316  hypothetical protein  45.88 
 
 
487 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.719492  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0326  hypothetical protein  45.88 
 
 
487 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.173098 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0307  hypothetical protein  45.88 
 
 
487 aa  53.5  0.000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.681233  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  39.51 
 
 
599 aa  53.5  0.000009  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  24.46 
 
 
593 aa  52.8  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  27.42 
 
 
591 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  23.9 
 
 
596 aa  53.5  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04200  succinate dehydrogenase/fumarate reductase flavoprotein subunit  29.29 
 
 
481 aa  52.4  0.00002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.906237  normal  0.517886 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2291  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  30.61 
 
 
565 aa  52.8  0.00002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  34.04 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ00140  fumarate reductase (NADH), putative  51.67 
 
 
635 aa  52.4  0.00002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0434389  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  22.18 
 
 
504 aa  52.8  0.00002  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  34.04 
 
 
517 aa  52.4  0.00002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2675  hypothetical protein  42.86 
 
 
528 aa  52.4  0.00002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0187257  normal  0.0233154 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  39.51 
 
 
596 aa  51.6  0.00003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  41.25 
 
 
605 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3515  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  53.7 
 
 
492 aa  52  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.395658  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  35.56 
 
 
521 aa  52  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  39.51 
 
 
510 aa  51.6  0.00004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  39.29 
 
 
582 aa  51.2  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  21.79 
 
 
608 aa  51.6  0.00004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>