More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3826 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_3826  hypothetical protein  100 
 
 		 91 aa  183  8e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0810  flavocytochrome c  88.76 
 
 		 589 aa  164  4e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2586  flavocytochrome c  75.86 
 
 		 588 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.110511  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3299  flavocytochrome c  62.65 
 
 		 597 aa  117  4.9999999999999996e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0905  flavocytochrome c  62.22 
 
 		 597 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.604755  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3318  flavocytochrome c  61.36 
 
 		 596 aa  115  3e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.5959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0611  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  60.23 
 
 		 593 aa  114  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.755689 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3215  flavocytochrome c  60.23 
 
 		 596 aa  114  5e-25  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.57421 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3628  flavocytochrome c  63.64 
 
 		 596 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3505  flavocytochrome c  63.64 
 
 		 596 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3433  flavocytochrome c  63.64 
 
 		 596 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0859  flavocytochrome c  63.64 
 
 		 596 aa  114  6e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4127  flavocytochrome c  54.44 
 
 		 598 aa  113  8.999999999999998e-25  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.431024 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4036  flavocytochrome c  55.56 
 
 		 598 aa  113  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0970  fumarate reductase flavoprotein subunit precursor  60.67 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0808  flavocytochrome c  59.09 
 
 		 596 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.587828  normal  0.0624147 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0138  flavocytochrome c  60.67 
 
 		 608 aa  110  5e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000254788  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3112  flavocytochrome c  57.65 
 
 		 596 aa  110  6e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541974 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0722  flavocytochrome c  55.29 
 
 		 596 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3690  flavocytochrome c  56.47 
 
 		 583 aa  109  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4309  flavocytochrome c  58.62 
 
 		 598 aa  109  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000651715  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2466  flavocytochrome c  57.5 
 
 		 599 aa  109  1.0000000000000001e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3597  flavocytochrome c  58.54 
 
 		 591 aa  107  5e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1421  fumarate reductase flavoprotein subunit  65.75 
 
 		 589 aa  107  6e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1861  flavocytochrome c  60.76 
 
 		 515 aa  107  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1782  flavocytochrome c  60.76 
 
 		 515 aa  106  8.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.283775  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3625  flavocytochrome c  55.95 
 
 		 596 aa  106  9.000000000000001e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2096  flavocytochrome c  59.49 
 
 		 515 aa  106  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.148795  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3776  flavocytochrome c  52.94 
 
 		 596 aa  106  1e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00235124 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3126  flavocytochrome c  57.65 
 
 		 925 aa  106  1e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3877  succinate dehydrogenase  52.94 
 
 		 596 aa  104  4e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000270258  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3495  flavocytochrome c  55.95 
 
 		 925 aa  103  8e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2381  NADH:flavin oxidoreductase/fumarate reductase, flavoprotein subunit, putative  57.32 
 
 		 1005 aa  103  1e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13430  flavocytochrome c  55.42 
 
 		 616 aa  102  1e-21  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2625  flavocytochrome c  65.71 
 
 		 957 aa  102  2e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.809387  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3795  flavocytochrome c  57.5 
 
 		 582 aa  102  2e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.343394  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0378  flavocytochrome c  52.87 
 
 		 591 aa  102  2e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00000382997  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3541  flavocytochrome c  52.44 
 
 		 589 aa  102  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000144139  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0270  flavocytochrome c flavin subunit  59.74 
 
 		 511 aa  101  3e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4620  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  56.25 
 
 		 582 aa  100  5e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1226  fumarate reductase flavoprotein subunit  61.84 
 
 		 502 aa  100  5e-21  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  unclonable  0.00121043  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4193  flavocytochrome c  57.5 
 
 		 582 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2741  flavocytochrome c  50 
 
 		 637 aa  100  6e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4325  flavocytochrome c  57.5 
 
 		 582 aa  100  6e-21  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0098  fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.09 
 
 		 465 aa  99.8  1e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4004  flavocytochrome c  56.25 
 
 		 582 aa  99.8  1e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0694  fumarate reductase, flavoprotein subunit precursor  60 
 
 		 584 aa  97.8  5e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05539  oxidoreductase  58.23 
 
 		 1004 aa  97.8  5e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3885  flavocytochrome c  58.11 
 
 		 609 aa  97.1  7e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000688641  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0511  flavocytochrome c  57.5 
 
 		 510 aa  96.7  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0943  flavocytochrome c  56.25 
 
 		 517 aa  95.5  2e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_13640  flavocytochrome c  53.75 
 
 		 650 aa  95.9  2e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2558  flavocytochrome c  51.76 
 
 		 926 aa  95.5  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0327685 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3912  flavocytochrome c  53.09 
 
 		 586 aa  94.7  3e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0136  flavocytochrome c flavin subunit  50.55 
 
 		 517 aa  94.4  5e-19  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.584631  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3574  flavocytochrome c  55.7 
 
 		 586 aa  94  6e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0049  fumarate reductase flavoprotein subunit  54.88 
 
 		 616 aa  93.6  7e-19  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00375543  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3301  flavocytochrome c flavin subunit  55.26 
 
 		 499 aa  91.7  3e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_10064  predicted protein  54.93 
 
 		 561 aa  91.3  4e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.14351 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3768  flavocytochrome c  49.37 
 
 		 515 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.226332  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1530  flavocytochrome c  50 
 
 		 464 aa  90.9  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000593943  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0340  flavocytochrome c  53.85 
 
 		 500 aa  90.9  6e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0848  fumarate reductase, flavoprotein subunit  51.28 
 
 		 457 aa  90.5  8e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000988882  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2084  flavocytochrome c  53.09 
 
 		 520 aa  89.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2653  flavocytochrome c  51.19 
 
 		 631 aa  88.2  3e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.123058 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2089  flavocytochrome c  59.72 
 
 		 519 aa  88.2  4e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.455233  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2933  flavocytochrome c  45.98 
 
 		 521 aa  88.2  4e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0344  flavocytochrome c flavin subunit, putative  50 
 
 		 519 aa  87  8e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.892888 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0139  radical SAM domain-containing protein  51.32 
 
 		 511 aa  86.7  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0913  flavocytochrome c  50.65 
 
 		 483 aa  86.7  1e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.387235  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2281  flavocytochrome c  48.86 
 
 		 519 aa  85.5  2e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10160  flavocytochrome c  50 
 
 		 603 aa  85.5  2e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.23612  normal  0.0211586 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3058  flavocytochrome c flavin subunit, putative  51.28 
 
 		 517 aa  85.1  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2432  flavocytochrome c  50 
 
 		 517 aa  84.7  3e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.77876  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1489  flavocytochrome c  51.28 
 
 		 517 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.803318 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0002  flavocytochrome c flavin subunit  51.28 
 
 		 518 aa  83.6  9e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00000401985  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11650  flavocytochrome c  54.41 
 
 		 504 aa  83.6  0.000000000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3368  flavocytochrome c  45.88 
 
 		 519 aa  82.4  0.000000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_52061  predicted protein  46.15 
 
 		 587 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27122  predicted protein  46.15 
 
 		 587 aa  82.4  0.000000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0188056 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.22 
 
 		 539 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0107  flavocytochrome c  49.35 
 
 		 605 aa  81.3  0.000000000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.71 
 
 		 552 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.22 
 
 		 539 aa  81.3  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1803  FAD binding domain-containing protein  55.07 
 
 		 521 aa  80.9  0.000000000000006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.000300511  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01543  hypothetical fumarate reductase (Eurofung)  39.33 
 
 		 627 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000554356  normal  1 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10296  FAD dependent oxidoreductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G05070)  46.34 
 
 		 484 aa  80.1  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0003  flavocytochrome c flavin subunit  49.35 
 
 		 508 aa  79.7  0.00000000000001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000666036  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50 
 
 		 539 aa  79.7  0.00000000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.39 
 
 		 546 aa  79.3  0.00000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  50.7 
 
 		 641 aa  79  0.00000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_51720  fumarate reductase flavoprotein  49.32 
 
 		 668 aa  78.2  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.744935  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1444  flavocytochrome c  44.87 
 
 		 512 aa  77.8  0.00000000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0488  flavocytochrome c  47.22 
 
 		 606 aa  77.8  0.00000000000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.203471 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1548  flavocytochrome c flavin subunit  48 
 
 		 501 aa  77  0.00000000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00203617  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  50 
 
 		 598 aa  75.9  0.0000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  46.34 
 
 		 570 aa  75.9  0.0000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.69 
 
 		 543 aa  75.9  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.25 
 
 		 540 aa  75.1  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  47.56 
 
 		 584 aa  75.5  0.0000000000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>