More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1865 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.44 
 
 
637 aa  835    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68 
 
 
646 aa  853    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  77.01 
 
 
598 aa  889    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.71 
 
 
638 aa  879    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  70.73 
 
 
643 aa  836    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.67 
 
 
644 aa  821    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.94 
 
 
637 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.33 
 
 
644 aa  818    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.88 
 
 
648 aa  858    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  69.67 
 
 
630 aa  804    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  71.53 
 
 
646 aa  827    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.12 
 
 
608 aa  763    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.65 
 
 
648 aa  857    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.57 
 
 
623 aa  847    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  63.52 
 
 
680 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  72.98 
 
 
633 aa  833    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
598 aa  1231    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.88 
 
 
646 aa  813    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.13 
 
 
621 aa  924    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.65 
 
 
648 aa  857    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  63.73 
 
 
609 aa  721    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.56 
 
 
681 aa  784    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.18 
 
 
627 aa  808    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  68.74 
 
 
641 aa  825    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.35 
 
 
589 aa  594  1e-168  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  42.02 
 
 
576 aa  416  9.999999999999999e-116  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  38.71 
 
 
584 aa  406  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.31 
 
 
570 aa  399  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  40.03 
 
 
576 aa  384  1e-105  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  43.04 
 
 
542 aa  376  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.1 
 
 
626 aa  377  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.89 
 
 
542 aa  374  1e-102  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  36.73 
 
 
582 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  39.52 
 
 
575 aa  372  1e-101  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.36 
 
 
566 aa  365  1e-99  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.36 
 
 
540 aa  360  4e-98  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.18 
 
 
562 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  39.57 
 
 
598 aa  357  3.9999999999999996e-97  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.67 
 
 
566 aa  355  1e-96  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.83 
 
 
543 aa  355  1e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.8 
 
 
546 aa  355  1e-96  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.9 
 
 
595 aa  350  4e-95  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.82 
 
 
578 aa  349  7e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  37.32 
 
 
596 aa  347  4e-94  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.32 
 
 
575 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.04 
 
 
539 aa  346  8e-94  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.05 
 
 
552 aa  345  1e-93  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.67 
 
 
539 aa  344  2e-93  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  38.85 
 
 
594 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  35.6 
 
 
598 aa  343  5.999999999999999e-93  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.15 
 
 
575 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.61 
 
 
595 aa  342  1e-92  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.44 
 
 
575 aa  339  9e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.29 
 
 
539 aa  338  9.999999999999999e-92  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.11 
 
 
584 aa  339  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2952  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.55 
 
 
600 aa  339  9.999999999999999e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.090106  decreased coverage  0.000187391 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.54 
 
 
577 aa  338  1.9999999999999998e-91  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  37.85 
 
 
601 aa  337  2.9999999999999997e-91  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  36.83 
 
 
602 aa  335  1e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.13 
 
 
583 aa  335  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.24 
 
 
601 aa  334  2e-90  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  36.24 
 
 
601 aa  334  2e-90  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  36.68 
 
 
596 aa  334  3e-90  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.51 
 
 
583 aa  333  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.18 
 
 
592 aa  333  5e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.23 
 
 
599 aa  333  5e-90  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.21 
 
 
579 aa  333  7.000000000000001e-90  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.63 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.8 
 
 
591 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.11 
 
 
575 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1882  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.11 
 
 
575 aa  331  2e-89  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.764609  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.79 
 
 
597 aa  330  4e-89  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.6 
 
 
592 aa  330  5.0000000000000004e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.43 
 
 
601 aa  330  7e-89  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3954  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.67 
 
 
610 aa  329  1.0000000000000001e-88  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0196 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.95 
 
 
599 aa  328  1.0000000000000001e-88  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  36.63 
 
 
602 aa  329  1.0000000000000001e-88  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.2 
 
 
584 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.7 
 
 
592 aa  328  2.0000000000000001e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  38.76 
 
 
591 aa  328  2.0000000000000001e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
592 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
592 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
592 aa  327  5e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.99 
 
 
592 aa  326  6e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.02 
 
 
591 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.02 
 
 
591 aa  325  2e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21330  succinate dehydrogenase subunit A  39.29 
 
 
591 aa  325  2e-87  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.52 
 
 
601 aa  325  2e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0965  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.47 
 
 
583 aa  324  2e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.297334  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.04 
 
 
592 aa  325  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.95 
 
 
602 aa  324  4e-87  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 
591 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 
591 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.97 
 
 
591 aa  324  4e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>