More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3034 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.46 
 
 		 587 aa  642    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  79.9 
 
 		 601 aa  998    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.05 
 
 		 592 aa  956    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.59 
 
 		 596 aa  642    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  59.36 
 
 		 595 aa  724    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.05 
 
 		 592 aa  979    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.22 
 
 		 590 aa  642    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.81 
 
 		 589 aa  681    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.81 
 
 		 589 aa  681    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.99 
 
 		 590 aa  645    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.2 
 
 		 616 aa  917    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  67.06 
 
 		 594 aa  825    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.72 
 
 		 592 aa  974    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  972    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  58.64 
 
 		 584 aa  689    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.96 
 
 		 592 aa  976    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.73 
 
 		 603 aa  645    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  58.28 
 
 		 587 aa  686    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.49 
 
 		 590 aa  648    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 592 aa  970    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.26 
 
 		 596 aa  639    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.78 
 
 		 596 aa  652    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.63 
 
 		 601 aa  985    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  65.37 
 
 		 587 aa  761    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.24 
 
 		 594 aa  665    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.28 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.61 
 
 		 591 aa  964    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.9 
 
 		 604 aa  655    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.61 
 
 		 591 aa  964    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.85 
 
 		 591 aa  961    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  80.03 
 
 		 601 aa  1006    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.28 
 
 		 590 aa  651    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  83.72 
 
 		 602 aa  1041    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  91.97 
 
 		 598 aa  1146    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.52 
 
 		 591 aa  965    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.46 
 
 		 587 aa  642    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.2 
 
 		 590 aa  664    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.7 
 
 		 616 aa  920    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.22 
 
 		 592 aa  959    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.17 
 
 		 616 aa  899    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.43 
 
 		 596 aa  661    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.18 
 
 		 604 aa  647    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  972    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  68.63 
 
 		 597 aa  824    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.28 
 
 		 591 aa  969    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.57 
 
 		 595 aa  637    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.72 
 
 		 588 aa  636    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  59.42 
 
 		 587 aa  703    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.05 
 
 		 592 aa  979    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.96 
 
 		 591 aa  675    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.63 
 
 		 601 aa  992    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  86.05 
 
 		 596 aa  1075    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.89 
 
 		 592 aa  978    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.28 
 
 		 591 aa  969    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.39 
 
 		 590 aa  644    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  972    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.05 
 
 		 592 aa  979    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.92 
 
 		 596 aa  655    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.39 
 
 		 590 aa  644    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.38 
 
 		 603 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  83.39 
 
 		 602 aa  1044    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.45 
 
 		 591 aa  974    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.65 
 
 		 588 aa  659    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  77.96 
 
 		 592 aa  970    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.79 
 
 		 591 aa  965    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  80.74 
 
 		 602 aa  1010    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  100 
 
 		 597 aa  1245    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  79.9 
 
 		 601 aa  998    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.79 
 
 		 591 aa  965    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.13 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.45 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1234  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.99 
 
 		 588 aa  633  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.96 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.96 
 
 		 605 aa  633  1e-180  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1142  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.37 
 
 		 589 aa  629  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.881943  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.28 
 
 		 588 aa  630  1e-179  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.39 
 
 		 588 aa  628  1e-179  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.44 
 
 		 598 aa  630  1e-179  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3102  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.65 
 
 		 588 aa  629  1e-179  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.7 
 
 		 588 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2916  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.54 
 
 		 588 aa  628  1e-179  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.7 
 
 		 588 aa  630  1e-179  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0844  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.67 
 
 		 589 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.7 
 
 		 588 aa  630  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 590 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.19 
 
 		 590 aa  627  1e-178  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.03 
 
 		 590 aa  626  1e-178  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004114  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.05 
 
 		 588 aa  626  1e-178  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.81 
 
 		 588 aa  627  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.88 
 
 		 588 aa  625  1e-178  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0793  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.78 
 
 		 588 aa  624  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.83395  normal  0.0589165 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.69 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.44 
 
 		 588 aa  621  1e-177  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.69 
 
 		 590 aa  624  1e-177  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>