More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene lpp0595 on replicon NC_006368
Organism: Legionella pneumophila str. Paris



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_0736  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
588 aa  784    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00683  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
588 aa  784    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  69.04 
 
 
588 aa  784    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
588 aa  784    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.7 
 
 
590 aa  727    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.24 
 
 
588 aa  787    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 
605 aa  656    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.33 
 
 
592 aa  720    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.12 
 
 
588 aa  773    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3762  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.3 
 
 
590 aa  725    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.12 
 
 
588 aa  761    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.14 
 
 
588 aa  763    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  66.67 
 
 
590 aa  773    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
589 aa  1226    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
589 aa  1226    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
588 aa  783    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.5 
 
 
590 aa  771    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
616 aa  681    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  56.55 
 
 
594 aa  679    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.97 
 
 
592 aa  725    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.82 
 
 
598 aa  646    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  64.33 
 
 
584 aa  758    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.33 
 
 
607 aa  644    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.97 
 
 
588 aa  760    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  58.81 
 
 
587 aa  709    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.98 
 
 
590 aa  743    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.8 
 
 
588 aa  758    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.56 
 
 
592 aa  714    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.97 
 
 
588 aa  792    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.96 
 
 
590 aa  724    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.61 
 
 
595 aa  643    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  57.54 
 
 
596 aa  679    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.87 
 
 
588 aa  796    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  60.85 
 
 
587 aa  725    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 
594 aa  654    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.65 
 
 
591 aa  719    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.63 
 
 
588 aa  753    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
607 aa  637    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.93 
 
 
605 aa  654    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.89 
 
 
598 aa  665    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.48 
 
 
591 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.52 
 
 
601 aa  696    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.44 
 
 
590 aa  764    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.63 
 
 
607 aa  635    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  56.81 
 
 
598 aa  700    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.77 
 
 
591 aa  724    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.61 
 
 
588 aa  740    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.3 
 
 
608 aa  641    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.15 
 
 
590 aa  785    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.5 
 
 
607 aa  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.79 
 
 
616 aa  680    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.77 
 
 
592 aa  719    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.2 
 
 
590 aa  743    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.91 
 
 
588 aa  788    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.02 
 
 
604 aa  637    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.48 
 
 
591 aa  717    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.61 
 
 
597 aa  652    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1797  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.23 
 
 
589 aa  769    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000334447  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2932  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.04 
 
 
588 aa  784    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.606648  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.84 
 
 
595 aa  640    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2970  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.19 
 
 
588 aa  776    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.431118  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.8 
 
 
588 aa  758    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.63 
 
 
588 aa  756    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.8 
 
 
588 aa  755    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3514  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.7 
 
 
590 aa  726    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.22318  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.97 
 
 
588 aa  758    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.44 
 
 
588 aa  739    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.25 
 
 
595 aa  645    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.31 
 
 
591 aa  714    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.81 
 
 
590 aa  773    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.45 
 
 
616 aa  667    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.48 
 
 
591 aa  717    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.81 
 
 
590 aa  773    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  65.7 
 
 
590 aa  727    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.81 
 
 
611 aa  641    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.05 
 
 
587 aa  755    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.8 
 
 
588 aa  758    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  56.68 
 
 
596 aa  699    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1835  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.29 
 
 
588 aa  746    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0132672  normal  0.110124 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.02 
 
 
601 aa  696    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.31 
 
 
588 aa  770    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  57.56 
 
 
592 aa  721    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.19 
 
 
588 aa  776    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66.22 
 
 
588 aa  781    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.97 
 
 
588 aa  758    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.48 
 
 
591 aa  719    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.79 
 
 
590 aa  728    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  55.59 
 
 
602 aa  693    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.81 
 
 
597 aa  701    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  54.01 
 
 
601 aa  683    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  63.22 
 
 
587 aa  757    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.82 
 
 
591 aa  719    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.28 
 
 
601 aa  698    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1382  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.19 
 
 
588 aa  776    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.332477  normal  0.921061 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>