More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_2362 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.51 
 
 		 611 aa  677    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00683  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.32 
 
 		 588 aa  667    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2912  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  58.32 
 
 		 588 aa  667    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.303768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1653  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.12 
 
 		 588 aa  662    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00109405  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.53 
 
 		 611 aa  672    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4191  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.18 
 
 		 590 aa  675    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0771  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.32 
 
 		 588 aa  667    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0437  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.59 
 
 		 599 aa  640    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.54 
 
 		 592 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2217  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.46 
 
 		 588 aa  677    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.66 
 
 		 588 aa  683    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_004310  BR1902  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.59 
 
 		 613 aa  645    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1928  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.63 
 
 		 588 aa  664    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  60.72 
 
 		 590 aa  726    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.97 
 
 		 589 aa  745    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.97 
 
 		 589 aa  745    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01353  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.49 
 
 		 588 aa  685    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.72 
 
 		 590 aa  724    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.57 
 
 		 616 aa  714    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  62.01 
 
 		 594 aa  758    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.54 
 
 		 592 aa  775    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.91 
 
 		 598 aa  662    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  67.01 
 
 		 584 aa  798    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.44 
 
 		 607 aa  672    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.76 
 
 		 613 aa  649    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139134  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  63.99 
 
 		 587 aa  771    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1612  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.69 
 
 		 590 aa  700    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.244863 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2816  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.78 
 
 		 588 aa  668    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0572429  normal  0.870607 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.58 
 
 		 592 aa  763    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.49 
 
 		 603 aa  697    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1786  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.46 
 
 		 588 aa  660    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00696319  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2505  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.83 
 
 		 590 aa  675    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.402685 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  58.27 
 
 		 596 aa  702    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2271  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.46 
 
 		 588 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0457279  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  67.92 
 
 		 587 aa  820    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.41 
 
 		 594 aa  675    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.9 
 
 		 591 aa  753    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2630  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.12 
 
 		 588 aa  655    Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0015925  normal  0.0726397 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.78 
 
 		 607 aa  666    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.91 
 
 		 604 aa  656    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.88 
 
 		 597 aa  655    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.09 
 
 		 598 aa  682    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.12 
 
 		 606 aa  649    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.41 
 
 		 601 aa  715    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.22 
 
 		 590 aa  734    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.44 
 
 		 607 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  59.03 
 
 		 598 aa  739    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.44 
 
 		 591 aa  764    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2185  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.29 
 
 		 588 aa  650    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00800222  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.27 
 
 		 607 aa  664    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  61.05 
 
 		 590 aa  744    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.74 
 
 		 607 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.07 
 
 		 616 aa  717    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  62.39 
 
 		 592 aa  776    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2802  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.35 
 
 		 590 aa  684    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.35465  normal  0.79012 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  59.13 
 
 		 601 aa  739    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.46 
 
 		 604 aa  663    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.75 
 
 		 591 aa  764    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.35 
 
 		 597 aa  659    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1797  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.98 
 
 		 589 aa  655    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000334447  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.03 
 
 		 611 aa  647    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0953  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.38 
 
 		 614 aa  643    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643609  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.07 
 
 		 595 aa  667    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1633  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.46 
 
 		 588 aa  662    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00339414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.63 
 
 		 588 aa  663    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.563088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.74 
 
 		 596 aa  650    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2345  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.6 
 
 		 588 aa  643    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00170465  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.29 
 
 		 595 aa  656    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.58 
 
 		 591 aa  761    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.35 
 
 		 590 aa  713    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.57 
 
 		 616 aa  706    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.75 
 
 		 591 aa  764    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1663  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.18 
 
 		 590 aa  675    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1675  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.89 
 
 		 588 aa  680    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.506283  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  60.64 
 
 		 596 aa  759    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1708  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.46 
 
 		 588 aa  662    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0194037  normal  0.398143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.98 
 
 		 588 aa  677    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.95 
 
 		 600 aa  635    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1425  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.66 
 
 		 588 aa  682    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00837732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58 
 
 		 587 aa  685    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.32 
 
 		 588 aa  667    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2883  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.23 
 
 		 588 aa  682    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0212451  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.09 
 
 		 588 aa  677    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  59.25 
 
 		 592 aa  749    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2510  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.12 
 
 		 588 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000247676  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.52 
 
 		 590 aa  694    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  58.89 
 
 		 602 aa  742    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  59.36 
 
 		 597 aa  744    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  58.29 
 
 		 601 aa  733    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.73 
 
 		 591 aa  751    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  60.23 
 
 		 601 aa  744    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2517  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.12 
 
 		 588 aa  656    Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000102318  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  58.16 
 
 		 596 aa  655    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.35 
 
 		 590 aa  713    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>