More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A2168 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.3 
 
 		 611 aa  641    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.87 
 
 		 591 aa  991    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  85.07 
 
 		 602 aa  1058    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.87 
 
 		 591 aa  997    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.89 
 
 		 596 aa  654    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.97 
 
 		 605 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.87 
 
 		 592 aa  994    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  78.86 
 
 		 592 aa  999    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.54 
 
 		 592 aa  1029    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1561  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  52.78 
 
 		 587 aa  647    Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.68 
 
 		 589 aa  679    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.68 
 
 		 589 aa  679    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.37 
 
 		 616 aa  915    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  66.55 
 
 		 594 aa  833    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.87 
 
 		 592 aa  1014    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1184  succinate dehydrogenase subunit A  59.42 
 
 		 584 aa  704    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.54 
 
 		 592 aa  1029    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2471  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  56.93 
 
 		 587 aa  684    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.926493  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  59.83 
 
 		 587 aa  724    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 592 aa  999    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.7 
 
 		 591 aa  996    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1878  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.55 
 
 		 591 aa  683    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.178355  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  79.83 
 
 		 601 aa  994    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  82.09 
 
 		 601 aa  1025    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2029  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  54.48 
 
 		 596 aa  646    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.21  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.92 
 
 		 596 aa  660    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  66.89 
 
 		 587 aa  793    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  57.5 
 
 		 594 aa  688    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.7 
 
 		 591 aa  997    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  71.28 
 
 		 597 aa  858    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.11 
 
 		 612 aa  637    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.56 
 
 		 604 aa  669    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.38 
 
 		 592 aa  1028    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.28 
 
 		 598 aa  645    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 		 606 aa  636    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1799  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  79.93 
 
 		 601 aa  1014    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2108  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.58 
 
 		 590 aa  644    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.018563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  88.07 
 
 		 598 aa  1114    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.03 
 
 		 591 aa  992    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.7 
 
 		 591 aa  997    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.45 
 
 		 596 aa  657    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1215  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.19 
 
 		 590 aa  656    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  60.64 
 
 		 595 aa  739    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.86 
 
 		 616 aa  919    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.54 
 
 		 592 aa  998    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.66 
 
 		 616 aa  896    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.61 
 
 		 604 aa  660    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.7 
 
 		 591 aa  996    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.36 
 
 		 591 aa  991    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2704  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  85.28 
 
 		 602 aa  1066    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.017234 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.9 
 
 		 603 aa  662    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  100 
 
 		 596 aa  1241    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.97 
 
 		 605 aa  654    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.78 
 
 		 587 aa  646    Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.93 
 
 		 596 aa  678    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.48 
 
 		 595 aa  637    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.87 
 
 		 591 aa  997    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  80.34 
 
 		 601 aa  1001    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.7 
 
 		 591 aa  996    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.36 
 
 		 591 aa  991    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.68 
 
 		 595 aa  657    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.54 
 
 		 592 aa  1029    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.41 
 
 		 603 aa  661    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.14 
 
 		 605 aa  655    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.7 
 
 		 591 aa  997    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2254  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.7 
 
 		 588 aa  639    Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.453422  normal  0.274072 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  79.19 
 
 		 592 aa  1004    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  82.18 
 
 		 602 aa  1024    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3034  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  86.05 
 
 		 597 aa  1075    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  80.34 
 
 		 601 aa  1001    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.64 
 
 		 605 aa  651    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.53 
 
 		 591 aa  995    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.83 
 
 		 600 aa  632  1e-180  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.97 
 
 		 596 aa  634  1e-180  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.48 
 
 		 608 aa  632  1e-180  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.59 
 
 		 596 aa  634  1e-180  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.31 
 
 		 600 aa  634  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2007  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.86 
 
 		 590 aa  628  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.82203  normal  0.426549 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44030  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.19 
 
 		 590 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3691  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.19 
 
 		 590 aa  631  1e-179  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1152  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.76 
 
 		 590 aa  631  1e-179  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.03 
 
 		 612 aa  627  1e-178  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1265  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.21 
 
 		 588 aa  626  1e-178  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.648217  normal  0.132874 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2197  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  51.86 
 
 		 590 aa  627  1e-178  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.223298  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.26 
 
 		 595 aa  627  1e-178  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.09 
 
 		 598 aa  625  1e-178  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.31 
 
 		 611 aa  625  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.81 
 
 		 608 aa  627  1e-178  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1224  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.29 
 
 		 588 aa  628  1e-178  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0959958 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.3 
 
 		 597 aa  628  1e-178  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0976  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.91 
 
 		 600 aa  624  1e-177  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3527  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.08 
 
 		 602 aa  623  1e-177  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0953  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54 
 
 		 614 aa  623  1e-177  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643609  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3690  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  51.99 
 
 		 613 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>