More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3894 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001306  ANIA_02916  hypothetical protein similar to succinate dehydrogenase flavoprotein subunit A (Broad)  66.22 
 
 
647 aa  787    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.056586 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 
591 aa  640    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  99.83 
 
 
605 aa  1254    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  53.91 
 
 
602 aa  647    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 
592 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1550  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.98 
 
 
595 aa  855    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0437  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  66 
 
 
599 aa  816    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 
592 aa  656    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 
591 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1902  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.83 
 
 
613 aa  857    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_66251  succinate dehydrogenase  64.71 
 
 
641 aa  784    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.88 
 
 
600 aa  839    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
605 aa  1256    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0595  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 
589 aa  637    Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0576  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 
589 aa  637    Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI03270  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit precursor, putative  65.56 
 
 
637 aa  790    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.164361  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.41 
 
 
601 aa  641    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2362  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.75 
 
 
595 aa  676    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  56.73 
 
 
594 aa  672    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.37 
 
 
592 aa  679    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0688  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.84 
 
 
598 aa  844    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  89.14 
 
 
608 aa  1111    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0389176  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2800  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.66 
 
 
607 aa  971    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.19 
 
 
603 aa  871    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  98.02 
 
 
605 aa  1236    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0216  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.15 
 
 
607 aa  991    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.493342  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0976  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.05 
 
 
600 aa  826    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 
592 aa  642    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  90.58 
 
 
605 aa  1161    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0088  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.89 
 
 
600 aa  820    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.61888  normal 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0380  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.41 
 
 
596 aa  858    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0344  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.08 
 
 
596 aa  858    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0230  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.28 
 
 
611 aa  1003    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.153031  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0861  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  56.68 
 
 
587 aa  647    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1204  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.35 
 
 
594 aa  862    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.431605  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.1 
 
 
591 aa  639    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2957  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.43 
 
 
613 aa  861    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0325  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.97 
 
 
607 aa  978    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1746  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.17 
 
 
604 aa  913    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.721199  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0376  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.34 
 
 
597 aa  841    Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  67.23 
 
 
598 aa  858    Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.62165  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0809  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.98 
 
 
606 aa  850    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.76713 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3978  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.06 
 
 
613 aa  872    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.490137 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 
592 aa  674    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0070  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.67 
 
 
607 aa  1007    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.563767 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  53.79 
 
 
598 aa  637    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.14 
 
 
591 aa  655    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2425  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.91 
 
 
601 aa  640    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0479  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  78.52 
 
 
607 aa  982    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.666907 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1467  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  55.33 
 
 
587 aa  643    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.38125  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3618  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.46 
 
 
607 aa  979    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.241397  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.83 
 
 
592 aa  671    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2548  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  57.1 
 
 
597 aa  654    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.393014  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3527  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.55 
 
 
602 aa  824    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3032  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.55 
 
 
604 aa  905    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 
591 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0953  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.17 
 
 
614 aa  865    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.643609  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  77.95 
 
 
595 aa  948    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3244  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.61 
 
 
611 aa  855    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1537  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.24 
 
 
596 aa  860    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1310  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.78 
 
 
595 aa  924    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.194206  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2636  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.05 
 
 
600 aa  826    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.95 
 
 
591 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2749  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.08 
 
 
612 aa  1035    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1334  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.9 
 
 
596 aa  894    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.356881  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29304  predicted protein  69.53 
 
 
633 aa  829    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 
592 aa  675    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2846  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  79.76 
 
 
595 aa  973    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 
591 aa  640    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2107  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.86 
 
 
603 aa  840    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3690  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.73 
 
 
613 aa  868    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.61 
 
 
591 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6040  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  89.8 
 
 
608 aa  1110    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.187811 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 
591 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.17 
 
 
613 aa  862    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.139134  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1435  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  81.65 
 
 
597 aa  1008    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.95 
 
 
591 aa  646    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4363  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.8 
 
 
591 aa  652    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  68.72 
 
 
600 aa  823    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508772  normal  0.102225 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  55.97 
 
 
591 aa  651    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  55.14 
 
 
596 aa  655    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  56.31 
 
 
592 aa  675    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.75 
 
 
596 aa  877    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.4 
 
 
612 aa  1020    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4135  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.43 
 
 
618 aa  858    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1965  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  80.85 
 
 
611 aa  1036    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.181761 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_41812  succinate dehydrogenase flavoprotein  66.67 
 
 
638 aa  826    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2202  succinate dehydrogenase subunit A  54.98 
 
 
602 aa  656    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.443729  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  53.41 
 
 
601 aa  641    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0090  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  69.93 
 
 
615 aa  861    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  54.27 
 
 
591 aa  639    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4352  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  53.97 
 
 
601 aa  639    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.602613  normal  0.276031 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0044  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.27 
 
 
596 aa  892    Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  53.21 
 
 
616 aa  632  1e-180  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>