More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_3053 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.69 
 
 
542 aa  711    Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  63.4 
 
 
543 aa  688    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  64.87 
 
 
562 aa  718    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  100 
 
 
540 aa  1106    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  60.26 
 
 
542 aa  678    Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  48.59 
 
 
539 aa  474  1e-132  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.99 
 
 
539 aa  471  1.0000000000000001e-131  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.57 
 
 
539 aa  463  1e-129  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.44 
 
 
552 aa  447  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  45.22 
 
 
546 aa  442  1e-123  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  47.18 
 
 
589 aa  405  1.0000000000000001e-112  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  46.11 
 
 
576 aa  396  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  42.78 
 
 
609 aa  382  1e-105  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.98 
 
 
644 aa  376  1e-103  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.98 
 
 
638 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  41.43 
 
 
584 aa  373  1e-102  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.19 
 
 
627 aa  372  1e-102  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  41.46 
 
 
582 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.11 
 
 
608 aa  363  4e-99  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.1 
 
 
648 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.1 
 
 
648 aa  363  4e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.78 
 
 
570 aa  363  5.0000000000000005e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.28 
 
 
648 aa  362  9e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  41.97 
 
 
646 aa  353  2.9999999999999997e-96  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.5 
 
 
623 aa  352  1e-95  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.75 
 
 
646 aa  352  1e-95  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  43.09 
 
 
598 aa  343  4e-93  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  43.78 
 
 
626 aa  342  7e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  41.63 
 
 
576 aa  342  7e-93  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.98 
 
 
644 aa  341  2e-92  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.11 
 
 
646 aa  340  5e-92  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  37.86 
 
 
568 aa  337  1.9999999999999998e-91  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  40.64 
 
 
641 aa  332  9e-90  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.92 
 
 
637 aa  330  3e-89  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  39.93 
 
 
643 aa  330  3e-89  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.1 
 
 
598 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.68 
 
 
621 aa  328  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.84 
 
 
566 aa  328  2.0000000000000001e-88  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.74 
 
 
637 aa  327  3e-88  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  41.01 
 
 
575 aa  323  5e-87  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.81 
 
 
681 aa  322  8e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5984  L-aspartate oxidase  38.48 
 
 
574 aa  322  8e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.937659 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0174  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  42.63 
 
 
542 aa  322  8e-87  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0476634  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  38.64 
 
 
680 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  40.76 
 
 
598 aa  318  1e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1995  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.6 
 
 
567 aa  318  2e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  40.85 
 
 
633 aa  317  3e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.81 
 
 
566 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0177  succinate dehydrogenase subunit A  39.47 
 
 
567 aa  313  2.9999999999999996e-84  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2512  succinate dehydrogenase  38.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.069415  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8670  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  37.25 
 
 
579 aa  311  2e-83  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40 
 
 
567 aa  311  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1306  L-aspartate oxidase  38.85 
 
 
533 aa  310  5e-83  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.821759  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  40.07 
 
 
630 aa  310  5.9999999999999995e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  40.35 
 
 
568 aa  309  6.999999999999999e-83  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1869  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
598 aa  307  4.0000000000000004e-82  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.462567  normal  0.466053 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5615  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  36.6 
 
 
579 aa  304  3.0000000000000004e-81  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  36.87 
 
 
594 aa  302  1e-80  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2344  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.68 
 
 
567 aa  300  3e-80  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0127  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  39.63 
 
 
567 aa  300  6e-80  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.864238  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.4 
 
 
592 aa  300  6e-80  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1030  succinate dehydrogenase/fumarate reductase subunit A  39.67 
 
 
570 aa  299  7e-80  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.144954  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.6 
 
 
592 aa  296  7e-79  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1164  aspartate oxidase  37.52 
 
 
515 aa  296  7e-79  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000105405  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1193  L-aspartate oxidase  36.94 
 
 
515 aa  296  9e-79  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00735813  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.79 
 
 
592 aa  295  1e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.72 
 
 
592 aa  293  4e-78  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4278  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.61 
 
 
605 aa  293  4e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.73 
 
 
592 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.73 
 
 
592 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.73 
 
 
592 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.73 
 
 
592 aa  293  6e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.74 
 
 
592 aa  293  7e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.93 
 
 
575 aa  293  8e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2717  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.55 
 
 
567 aa  293  8e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.5 
 
 
563 aa  292  8e-78  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.17 
 
 
591 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.17 
 
 
591 aa  291  1e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37 
 
 
591 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2250  L-aspartate oxidase  38.75 
 
 
522 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37 
 
 
591 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0459  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 
605 aa  291  2e-77  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414111  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37 
 
 
591 aa  291  2e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.7 
 
 
575 aa  290  4e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3894  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.21 
 
 
605 aa  290  5.0000000000000004e-77  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.197251  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0284  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.1 
 
 
567 aa  290  7e-77  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.947176 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3602  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.21 
 
 
605 aa  289  7e-77  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.609874  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.83 
 
 
575 aa  289  7e-77  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3479  L-aspartate oxidase  37.69 
 
 
534 aa  289  8e-77  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  36.03 
 
 
596 aa  288  1e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.85 
 
 
591 aa  288  1e-76  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3829  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.81 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.726427  normal  0.325233 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3313  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.81 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.775913 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.04 
 
 
591 aa  289  1e-76  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>