More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbis_3050 on replicon NC_014165
Organism: Thermobispora bispora DSM 43833



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_3926  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  69.1 
 
 
680 aa  848    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5518  Succinate dehydrogenase  73.62 
 
 
641 aa  917    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4150  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  75.24 
 
 
637 aa  930    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.052342  normal  0.010572 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27750  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.29 
 
 
638 aa  956    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.0951337 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1116  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  78.02 
 
 
643 aa  964    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8464  Succinate dehydrogenase  84.05 
 
 
630 aa  1021    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3050  succinate dehydrogenase  100 
 
 
633 aa  1303    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.145782  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3565  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.47 
 
 
644 aa  884    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.606678  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1384  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  59.93 
 
 
608 aa  701    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0637899 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1426  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  76.13 
 
 
623 aa  951    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0253  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.27 
 
 
648 aa  927    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.128459  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0394  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.52 
 
 
644 aa  945    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.134767  normal  0.884636 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3768  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.96 
 
 
637 aa  926    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0873813 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0243  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.27 
 
 
648 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1797  Succinate dehydrogenase  70.84 
 
 
598 aa  801    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.315032  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1865  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.74 
 
 
598 aa  855    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.710471 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3548  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  70.59 
 
 
621 aa  826    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.364565  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0263  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.27 
 
 
648 aa  927    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.115771 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2214  Succinate dehydrogenase  71.14 
 
 
646 aa  894    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0284  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  72.67 
 
 
627 aa  939    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10251  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  73.67 
 
 
646 aa  949    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.177698 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4026  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  71.99 
 
 
646 aa  906    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.941346  normal  0.159045 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2530  Succinate dehydrogenase (ubiquinone)  60.16 
 
 
609 aa  685    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.279488 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  74.84 
 
 
681 aa  909    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.533277  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0011  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  52.62 
 
 
589 aa  570  1e-161  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3453  succinate dehydrogenase  40.5 
 
 
576 aa  403  1e-111  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12591  succinate dehydrogenase  39.12 
 
 
584 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0949259  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0924  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  40.82 
 
 
626 aa  380  1e-104  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0402  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.78 
 
 
562 aa  376  1e-103  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.309781 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12651  succinate dehydrogenase/fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.49 
 
 
570 aa  379  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0086  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.15 
 
 
542 aa  370  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.970646  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0140  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  42.27 
 
 
542 aa  370  1e-101  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0677  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.96 
 
 
566 aa  367  1e-100  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0486405  hitchhiker  0.0000605931 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3053  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  41.84 
 
 
540 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0245  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.19 
 
 
552 aa  365  1e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0588  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.25 
 
 
546 aa  359  9.999999999999999e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0315  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.24 
 
 
539 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1354  succinate dehydrogenase  37.04 
 
 
582 aa  357  5e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0715068  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0221  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  40.84 
 
 
543 aa  352  8.999999999999999e-96  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.143686  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2093  Succinate dehydrogenase  38.53 
 
 
576 aa  352  2e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0522  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.83 
 
 
539 aa  348  2e-94  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0170  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.77 
 
 
566 aa  347  3e-94  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1397  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.6 
 
 
539 aa  347  3e-94  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0401599  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1440  Succinate dehydrogenase  38.28 
 
 
598 aa  341  2e-92  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4578  Succinate dehydrogenase  38.39 
 
 
575 aa  339  9.999999999999999e-92  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.89 
 
 
578 aa  338  1.9999999999999998e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2474  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.21 
 
 
575 aa  333  6e-90  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00000557801  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1569  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.27 
 
 
575 aa  332  1e-89  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.272912  hitchhiker  0.000112727 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1206  succinate dehydrogenase or fumarate reductase flavoprotein subunit  36.1 
 
 
596 aa  330  4e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2484  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.61 
 
 
592 aa  327  4.0000000000000003e-88  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.076646 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2863  succinate dehydrogenase subunit A  35.75 
 
 
594 aa  325  2e-87  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0760  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.18 
 
 
592 aa  325  2e-87  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04830  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.8 
 
 
595 aa  323  5e-87  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_05360  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.79 
 
 
595 aa  323  5e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0259373  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0248  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.28 
 
 
568 aa  323  6e-87  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0430  succinate dehydrogenase subunit A  34.95 
 
 
568 aa  323  9.000000000000001e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2323  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 
592 aa  322  9.999999999999999e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1309  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  38.74 
 
 
583 aa  320  3.9999999999999996e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0985993  normal  0.361254 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0210  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.16 
 
 
579 aa  320  3.9999999999999996e-86  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_21330  succinate dehydrogenase subunit A  40 
 
 
591 aa  320  5e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1129  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.29 
 
 
599 aa  320  5e-86  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4491  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.39 
 
 
592 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00238917 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2149  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.39 
 
 
592 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.44337  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4358  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.39 
 
 
592 aa  320  7e-86  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1061  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.83 
 
 
592 aa  319  7.999999999999999e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.760541  normal  0.0367901 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1825  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.73 
 
 
592 aa  319  9e-86  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.231317  normal  0.587479 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0679  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  39.21 
 
 
584 aa  319  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00348299  normal  0.0897043 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3602  succinate dehydrogenase subunit A  35.54 
 
 
598 aa  319  1e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1994  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  36.06 
 
 
592 aa  318  2e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.398561  normal  0.821237 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1687  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.03 
 
 
575 aa  318  2e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0263858 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1202  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  38.79 
 
 
599 aa  318  2e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000072111 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0662  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.78 
 
 
591 aa  317  3e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.536777  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2514  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  36.56 
 
 
585 aa  318  3e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.136164  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4646  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.67 
 
 
591 aa  317  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.303055  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5838  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.67 
 
 
591 aa  317  5e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1437  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  37.86 
 
 
577 aa  317  5e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.217137  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3563  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.86 
 
 
612 aa  317  6e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2285  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  34.74 
 
 
601 aa  316  8e-85  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2795  succinate dehydrogenase subunit A  34.74 
 
 
601 aa  316  8e-85  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0609564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2168  succinate dehydrogenase subunit A  35.38 
 
 
596 aa  316  9.999999999999999e-85  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.274751 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2893  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.33 
 
 
591 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3592  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.11 
 
 
591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.322313  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0100  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.4 
 
 
616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.576611  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25820  succinate dehydrogenase subunit A  38.94 
 
 
612 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.722118  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0109  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.8 
 
 
616 aa  315  1.9999999999999998e-84  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.461726  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4431  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.11 
 
 
591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3936  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.11 
 
 
591 aa  315  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.373287  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1428  succinate dehydrogenase or fumarate reductase, flavoprotein subunit  35.2 
 
 
602 aa  315  1.9999999999999998e-84  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1831  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.385612  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1747  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2255  succinate dehydrogenase, flavoprotein subunit  35.26 
 
 
584 aa  314  2.9999999999999996e-84  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.794625  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0791  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.127831  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2470  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.328563  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2332  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.790132  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0501  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.426579  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6854  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.17 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.232059 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1623  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.88 
 
 
591 aa  314  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.829702  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1881  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  35.94 
 
 
603 aa  313  3.9999999999999997e-84  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1856  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  34.55 
 
 
575 aa  313  4.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6464  succinate dehydrogenase flavoprotein subunit  37.68 
 
 
583 aa  313  4.999999999999999e-84  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.723061  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>