More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0732 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  100 
 
 		 437 aa  864    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  55.43 
 
 		 455 aa  429  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  56.42 
 
 		 418 aa  410  1e-113  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  52.9 
 
 		 446 aa  400  9.999999999999999e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  56.25 
 
 		 431 aa  384  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  44.86 
 
 		 410 aa  271  1e-71  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  39.41 
 
 		 425 aa  258  1e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  38.95 
 
 		 428 aa  246  4.9999999999999997e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  40.05 
 
 		 427 aa  244  3e-63  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  36.21 
 
 		 420 aa  204  2e-51  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  32.96 
 
 		 468 aa  189  9e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  31.4 
 
 		 470 aa  179  8e-44  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  35.87 
 
 		 407 aa  167  2.9999999999999998e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  35.55 
 
 		 436 aa  164  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  31.35 
 
 		 438 aa  157  4e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  31.87 
 
 		 426 aa  150  6e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  32.65 
 
 		 451 aa  142  1.9999999999999998e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  34.73 
 
 		 414 aa  136  6.0000000000000005e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  33.48 
 
 		 423 aa  134  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  31.86 
 
 		 448 aa  134  3.9999999999999996e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  30.07 
 
 		 418 aa  133  5e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  31.9 
 
 		 413 aa  133  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  30.24 
 
 		 413 aa  127  5e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  32.43 
 
 		 415 aa  124  4e-27  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  33.18 
 
 		 394 aa  124  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  30.89 
 
 		 433 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  28.71 
 
 		 418 aa  104  3e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  28.67 
 
 		 433 aa  100  6e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  27.76 
 
 		 552 aa  72.4  0.00000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.41 
 
 		 434 aa  71.2  0.00000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  28.19 
 
 		 506 aa  67.8  0.0000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  26.65 
 
 		 413 aa  66.2  0.000000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.11 
 
 		 474 aa  65.9  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4788  carotene 7,8-desaturase  23.51 
 
 		 479 aa  62  0.00000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 		 509 aa  60.5  0.00000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0335  carotene 7,8-desaturase  24.28 
 
 		 488 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  25.75 
 
 		 501 aa  59.3  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  26.09 
 
 		 447 aa  58.9  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 354 aa  58.5  0.0000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  47.62 
 
 		 421 aa  58.5  0.0000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  24.2 
 
 		 464 aa  57.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  26.38 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 		 460 aa  58.2  0.0000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  24.2 
 
 		 462 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  39.73 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  33.2 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  22.65 
 
 		 425 aa  57  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.48 
 
 		 499 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  30.11 
 
 		 491 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  22.2 
 
 		 489 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  28.25 
 
 		 476 aa  55.8  0.000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.4 
 
 		 486 aa  56.2  0.000001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  37.84 
 
 		 645 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0200  zeta-carotene desaturase  23.9 
 
 		 479 aa  55.5  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5459  amine oxidase  49.21 
 
 		 506 aa  55.5  0.000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.723961  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3430  carotene 7,8-desaturase  23.3 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  24.58 
 
 		 477 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3176  carotene 7,8-desaturase  23.36 
 
 		 482 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5080  amine oxidase  49.21 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.984429  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5168  amine oxidase  49.21 
 
 		 506 aa  55.1  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  27.97 
 
 		 453 aa  54.7  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2686  carotene 7,8-desaturase  23.3 
 
 		 490 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  28.05 
 
 		 467 aa  54.7  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  22.52 
 
 		 488 aa  54.3  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  21.8 
 
 		 484 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 		 407 aa  53.9  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  49.02 
 
 		 436 aa  53.9  0.000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  24.95 
 
 		 599 aa  54.3  0.000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  25.5 
 
 		 436 aa  53.5  0.000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  28.31 
 
 		 489 aa  53.5  0.000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  42.65 
 
 		 519 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  39.09 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  27.02 
 
 		 547 aa  53.1  0.000009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  39.09 
 
 		 450 aa  53.1  0.000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  46.27 
 
 		 500 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  25.69 
 
 		 473 aa  52.8  0.00001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  45.61 
 
 		 486 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.17 
 
 		 465 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  45.1 
 
 		 468 aa  52.8  0.00001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01311  zeta-carotene desaturase  50.88 
 
 		 478 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.0941429  normal  0.461178 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  21.8 
 
 		 484 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  45.83 
 
 		 447 aa  52.4  0.00001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  25.53 
 
 		 412 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  40.58 
 
 		 624 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1606  phytoene desaturase  22.9 
 
 		 511 aa  52  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000200105  unclonable  6.43078e-23 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  25.45 
 
 		 639 aa  51.6  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1415  carotene 7,8-desaturase  24.32 
 
 		 453 aa  52.4  0.00002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.979127 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  36.49 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_53974  zeta-carotene desaturase  47.37 
 
 		 591 aa  52.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.246168  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0057  phytoene dehydrogenase-related protein  38.89 
 
 		 488 aa  51.6  0.00002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1151  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 338 aa  52  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.493674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  22.2 
 
 		 483 aa  52  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  43.14 
 
 		 468 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  36.49 
 
 		 647 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0374  hypothetical protein  44.78 
 
 		 500 aa  52  0.00002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.10021  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.53 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 549 aa  52  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  39.73 
 
 		 465 aa  51.2  0.00003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  22.53 
 
 		 466 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.04 
 
 		 484 aa  51.6  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>