185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_0753 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  100 
 
 		 410 aa  800    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  50.12 
 
 		 425 aa  359  4e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  49.4 
 
 		 428 aa  350  3e-95  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  48.42 
 
 		 427 aa  333  3e-90  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  45.05 
 
 		 455 aa  284  2.0000000000000002e-75  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  45.39 
 
 		 420 aa  272  6e-72  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  44.86 
 
 		 437 aa  271  1e-71  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  43.68 
 
 		 446 aa  259  6e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  40.98 
 
 		 431 aa  244  9.999999999999999e-64  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  40.99 
 
 		 418 aa  229  9e-59  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  37.13 
 
 		 470 aa  229  1e-58  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  34.69 
 
 		 468 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  41.58 
 
 		 436 aa  210  4e-53  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  39.56 
 
 		 407 aa  209  6e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  35.38 
 
 		 438 aa  193  5e-48  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.66 
 
 		 426 aa  163  6e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  33.74 
 
 		 433 aa  156  5.0000000000000005e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  35.24 
 
 		 448 aa  156  8e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  34.3 
 
 		 418 aa  148  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  34.05 
 
 		 423 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  32.52 
 
 		 413 aa  143  6e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  32.75 
 
 		 413 aa  140  6e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  35.27 
 
 		 394 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  32.62 
 
 		 451 aa  136  9e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  32.23 
 
 		 433 aa  131  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  33.82 
 
 		 414 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  41.2 
 
 		 415 aa  120  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  32.81 
 
 		 418 aa  117  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  27.62 
 
 		 467 aa  67  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  27.53 
 
 		 451 aa  65.5  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  22.9 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  44.32 
 
 		 413 aa  62.4  0.00000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  28.8 
 
 		 419 aa  61.2  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  22.69 
 
 		 462 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23100  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.97 
 
 		 439 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.620646  normal  0.191871 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  25.05 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 		 469 aa  58.9  0.0000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  52.54 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3414  phytoene dehydrogenase family protein  23.6 
 
 		 425 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.893725 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1826  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.82 
 
 		 437 aa  55.5  0.000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0679  carotene 7,8-desaturase  23.82 
 
 		 489 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  35.29 
 
 		 501 aa  53.9  0.000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  31.69 
 
 		 456 aa  53.5  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1068  amine oxidase  31.61 
 
 		 415 aa  53.9  0.000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01816  hypothetical protein  26.26 
 
 		 436 aa  53.5  0.000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  53.7 
 
 		 383 aa  53.5  0.000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.11 
 
 		 463 aa  53.5  0.000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  27.46 
 
 		 464 aa  53.1  0.000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  26.3 
 
 		 456 aa  52.4  0.00001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05025  flavin containing amine oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12150)  52.08 
 
 		 657 aa  51.6  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.513705  normal  0.713848 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  24.02 
 
 		 479 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  44.83 
 
 		 599 aa  52  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1155  hypothetical protein  20.99 
 
 		 495 aa  51.6  0.00003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_45735  phytoene dehydrogenase  25.89 
 
 		 624 aa  51.2  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 358 aa  51.2  0.00003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003863  amine oxidase flavin-containing  26.69 
 
 		 436 aa  51.2  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.210369  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  22.73 
 
 		 463 aa  51.6  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  24.16 
 
 		 453 aa  50.8  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  32.32 
 
 		 484 aa  50.8  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2020  amine oxidase, flavin-containing  23.04 
 
 		 487 aa  50.8  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1312  amine oxidase  26.06 
 
 		 416 aa  50.4  0.00006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1880  amine oxidase  25.7 
 
 		 490 aa  50.4  0.00006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.277928  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  46.88 
 
 		 330 aa  50.4  0.00006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2053  amine oxidase, flavin-containing  22.54 
 
 		 487 aa  50.1  0.00007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1876  amine oxidase flavin-containing  22.54 
 
 		 482 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2018  amine oxidase, flavin-containing  22.54 
 
 		 482 aa  50.1  0.00007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  28.24 
 
 		 465 aa  50.1  0.00008  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3208  amine oxidase  26.06 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.884279 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1830  amine oxidase, flavin-containing  23.04 
 
 		 482 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  32.32 
 
 		 499 aa  49.7  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2098  amine oxidase  29.47 
 
 		 415 aa  49.7  0.00009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2098  amine oxidase, flavin-containing  25.14 
 
 		 490 aa  48.9  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3051  amine oxidase  26.06 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  45.45 
 
 		 328 aa  49.3  0.0001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3065  amine oxidase  26.06 
 
 		 416 aa  49.3  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  38.67 
 
 		 470 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  24.71 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  24.71 
 
 		 478 aa  48.1  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5179  amine oxidase  26.24 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3954  zeta-carotene desaturase  25.15 
 
 		 483 aa  48.9  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.134571  normal  0.596487 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4555  squalene-associated FAD-dependent desaturase  27.06 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.160695 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4952  amine oxidase  26.23 
 
 		 417 aa  48.5  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.15769  normal  0.0932773 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5680  amine oxidase  26.24 
 
 		 417 aa  48.9  0.0002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.799558  hitchhiker  0.00195148 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 		 473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  50 
 
 		 368 aa  48.9  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  31.71 
 
 		 484 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  23.4 
 
 		 552 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1846  amine oxidase, flavin-containing  22.13 
 
 		 485 aa  48.1  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.921085  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  28.93 
 
 		 471 aa  47.8  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  22.88 
 
 		 473 aa  47.4  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3289  amine oxidase, flavin-containing  25.14 
 
 		 487 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  29.59 
 
 		 472 aa  47  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  41.38 
 
 		 472 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  47.92 
 
 		 436 aa  47.4  0.0005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  34.74 
 
 		 347 aa  47.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1160  hypothetical protein  20.99 
 
 		 495 aa  47  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  39.51 
 
 		 548 aa  47  0.0006  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  28.14 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2131  amine oxidase, flavin-containing  24.58 
 
 		 490 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.764398  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  26.87 
 
 		 459 aa  47  0.0006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>