More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_2254 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1336  carotene isomerase  82.31 
 
 		 512 aa  886    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0735245  hitchhiker  0.00100943 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0636  putative carotenoid isomerase  62.57 
 
 		 520 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12221  putative carotenoid isomerase  62.28 
 
 		 514 aa  671    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2254  carotene isomerase  100 
 
 		 506 aa  1053    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000347702 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3112  FAD dependent oxidoreductase  74.11 
 
 		 506 aa  808    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.270711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1423  carotenoid isomerase  66.34 
 
 		 518 aa  728    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_05841  putative carotenoid isomerase  66.4 
 
 		 516 aa  712    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.515676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1681  carotenoid isomerase  66.14 
 
 		 518 aa  729    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.157771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1126  putative carotenoid isomerase  61.58 
 
 		 514 aa  667    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.777729  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1246  carotene isomerase  76.17 
 
 		 504 aa  797    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176287  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1308  carotene isomerase  82.5 
 
 		 512 aa  887    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2330  carotene isomerase  69.38 
 
 		 508 aa  753    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2192  FAD dependent oxidoreductase  75.6 
 
 		 532 aa  824    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.285502 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12211  putative carotenoid isomerase  62.28 
 
 		 514 aa  672    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12061  putative carotenoid isomerase  62.7 
 
 		 514 aa  674    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.809432  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_14681  putative carotenoid isomerase  62.96 
 
 		 520 aa  699    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.314761  normal  0.880307 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_10011  putative carotenoid isomerase  66.4 
 
 		 520 aa  723    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.243247 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  44.44 
 
 		 507 aa  454  1.0000000000000001e-126  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2151  amine oxidase  45.76 
 
 		 508 aa  454  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0760  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 503 aa  449  1e-125  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.522072 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0874  amine oxidase  44.89 
 
 		 503 aa  444  1e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1701  amine oxidase  43.29 
 
 		 503 aa  434  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00066646 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0766  amine oxidase  44.29 
 
 		 522 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  43.65 
 
 		 505 aa  427  1e-118  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  36.03 
 
 		 502 aa  298  2e-79  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3632  FAD dependent oxidoreductase  36.06 
 
 		 506 aa  290  3e-77  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2672  amine oxidase  35.14 
 
 		 513 aa  280  4e-74  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  35.02 
 
 		 515 aa  273  4.0000000000000004e-72  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2512  FAD dependent oxidoreductase  34.02 
 
 		 497 aa  270  4e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.224928  normal  0.507466 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3602  FAD dependent oxidoreductase  34.23 
 
 		 497 aa  270  5.9999999999999995e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03731  hypothetical protein  30.96 
 
 		 938 aa  254  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.968761 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0871  amine oxidase  35.03 
 
 		 512 aa  251  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.598168  normal  0.0715769 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1841  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 512 aa  245  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013160  Cyan8802_4578  FAD dependent oxidoreductase  34.64 
 
 		 512 aa  242  1e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_12111  hypothetical protein  33.53 
 
 		 509 aa  241  2e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0489  hypothetical protein  33.27 
 
 		 509 aa  239  1e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32217  predicted protein  31.76 
 
 		 504 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.340213  normal  0.0518556 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43564  predicted protein  31.29 
 
 		 554 aa  219  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.079373  normal  0.0235879 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_03711  phytoene dehydrogenase  31.15 
 
 		 509 aa  216  5.9999999999999996e-55  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1898  hypothetical protein  32.26 
 
 		 511 aa  212  1e-53  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.405447  normal  0.754346 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0345  phytoene dehydrogenase  30.56 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_03701  phytoene dehydrogenase  30.59 
 
 		 509 aa  209  7e-53  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0640229  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_03741  phytoene dehydrogenase  30.27 
 
 		 509 aa  206  6e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_45243  carotenoid isomerase  30.56 
 
 		 598 aa  204  2e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0755538  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1723  carotene isomerase  32.81 
 
 		 516 aa  200  3.9999999999999996e-50  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_54842  carotenoid isomerase  29.64 
 
 		 595 aa  199  7e-50  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0761  hypothetical protein  32.45 
 
 		 510 aa  198  2.0000000000000003e-49  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1711  FAD dependent oxidoreductase  30.51 
 
 		 501 aa  194  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000831031  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39472  predicted protein  30.34 
 
 		 645 aa  185  1.0000000000000001e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000845209  normal  0.555705 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_9210  CRTISO5 carotenoid isomerase 5,phytoene dehydrogenase-related protein  31.08 
 
 		 530 aa  184  5.0000000000000004e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_51868  carotenoid isomerase  30.64 
 
 		 633 aa  171  4e-41  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2342  amine oxidase  29.33 
 
 		 505 aa  166  1.0000000000000001e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4273  C-3',4' desaturase CrtD  29.13 
 
 		 499 aa  162  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.938391 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1027  C-3',4' desaturase CrtD  27.7 
 
 		 504 aa  156  9e-37  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0706  FAD dependent oxidoreductase  29.48 
 
 		 717 aa  154  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3374  C-3',4' desaturase CrtD  27.66 
 
 		 499 aa  151  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2737  C-3',4' desaturase CrtD  27.66 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000928862  unclonable  0.00000000408673 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  27.17 
 
 		 518 aa  148  2.0000000000000003e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0319  amine oxidase  26.2 
 
 		 489 aa  149  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.354274 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4343  amine oxidase  27.69 
 
 		 517 aa  146  7.0000000000000006e-34  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0970  phytoene dehydrogenase-like  28.29 
 
 		 523 aa  145  1e-33  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.354104  normal  0.67541 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3330  C-3',4' desaturase CrtD  27.71 
 
 		 510 aa  144  4e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  27.93 
 
 		 547 aa  144  5e-33  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0577  All-trans-retinol 13,14-reductase  27.72 
 
 		 542 aa  143  7e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7528  putative phytoene dehydrogenase and related proteins  26.54 
 
 		 708 aa  140  3.9999999999999997e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0318  FAD dependent oxidoreductase  29.09 
 
 		 547 aa  140  4.999999999999999e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  28.17 
 
 		 554 aa  138  2e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0493  phytoene desaturase  28.4 
 
 		 507 aa  138  2e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.145536  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0096  FAD dependent oxidoreductase  28.57 
 
 		 722 aa  138  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.490674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1069  FAD dependent oxidoreductase  24.4 
 
 		 496 aa  136  8e-31  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.302171  hitchhiker  0.00376489 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0405  amine oxidase  27.56 
 
 		 711 aa  134  5e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0201487  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1578  phytoene dehydrogenase-related protein  24.76 
 
 		 504 aa  131  3e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0475016 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0845  oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding domain protein  25.29 
 
 		 740 aa  130  8.000000000000001e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  26.45 
 
 		 507 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0346  amine oxidase  25.51 
 
 		 494 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  24.77 
 
 		 564 aa  128  2.0000000000000002e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1053  all-trans-retinol 13,14-reductase  26.58 
 
 		 501 aa  127  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0671242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1161  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 500 aa  127  4.0000000000000003e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0155951  normal  0.294938 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  25.7 
 
 		 511 aa  127  6e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2970  phytoene desaturase  24.41 
 
 		 493 aa  127  6e-28  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000576965 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1261  amine oxidase  26.24 
 
 		 511 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0418037 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1598  phytoene desaturase  27.13 
 
 		 505 aa  126  8.000000000000001e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3185  zeta-phytoene desaturase  25.94 
 
 		 492 aa  125  1e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00134863  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3734  phytoene desaturase  27.74 
 
 		 508 aa  125  2e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.964384  normal  0.0984598 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  25 
 
 		 556 aa  124  3e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0386  phytoene dehydrogenase related enzyme  29.25 
 
 		 500 aa  124  3e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.5 
 
 		 511 aa  124  3e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  25.61 
 
 		 561 aa  124  5e-27  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  26.97 
 
 		 508 aa  124  5e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2742  phytoene desaturase  27.01 
 
 		 553 aa  123  7e-27  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0933  phytoene dehydrogenase and related proteins-like  24.64 
 
 		 474 aa  123  9e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1914  phytoene dehydrogenase-related protein  25.89 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.603026 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  25.89 
 
 		 518 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  24.8 
 
 		 511 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  25.76 
 
 		 544 aa  122  9.999999999999999e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_54826  carotenoid isomerase  26.65 
 
 		 635 aa  121  1.9999999999999998e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0698106  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0143  amine oxidase  25.94 
 
 		 519 aa  121  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6445  phytoene dehydrogenase (phytoene desaturase)  26.19 
 
 		 512 aa  121  3e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.691802 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0305  amine oxidase  26.22 
 
 		 492 aa  121  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  24.72 
 
 		 563 aa  120  7e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>