293 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2794 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  100 
 
 
431 aa  850    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2885  amine oxidase  60 
 
 
418 aa  459  9.999999999999999e-129  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.748132  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2574  amine oxidase  54.34 
 
 
455 aa  420  1e-116  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.278816  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  56.25 
 
 
437 aa  421  1e-116  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1312  amine oxidase  54.85 
 
 
446 aa  411  1e-113  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  41.18 
 
 
420 aa  260  4e-68  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0753  amine oxidase  40.98 
 
 
410 aa  253  4.0000000000000004e-66  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2442  amine oxidase  39.62 
 
 
427 aa  247  2e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0137  amine oxidase  37.5 
 
 
425 aa  235  1.0000000000000001e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0394  amine oxidase  37.73 
 
 
428 aa  227  4e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0586189 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1724  amine oxidase  33.93 
 
 
470 aa  195  1e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  33.72 
 
 
468 aa  192  1e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0654  amine oxidase  33.64 
 
 
438 aa  183  6e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.239854 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1137  amine oxidase  33.97 
 
 
436 aa  157  5.0000000000000005e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.858264  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1605  amine oxidase  34.18 
 
 
426 aa  153  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5634  amine oxidase, flavin-containing  34.09 
 
 
407 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0493824  normal  0.227831 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0339  amine oxidase  34.02 
 
 
423 aa  137  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.39474  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  31.84 
 
 
418 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3364  amine oxidase  34.13 
 
 
414 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.154637  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3390  amine oxidase  31.77 
 
 
448 aa  131  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3282  amine oxidase  31.59 
 
 
451 aa  128  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.13115  normal  0.103215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23230  Flavin containing amine oxidoreductase  31.85 
 
 
415 aa  127  4.0000000000000003e-28  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.807494  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5169  amine oxidase  31.13 
 
 
433 aa  120  4.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5071  amine oxidase  35.89 
 
 
394 aa  114  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.717355  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3795  amine oxidase  32.32 
 
 
413 aa  112  1.0000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0121102 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3418  amine oxidase  32.46 
 
 
413 aa  112  2.0000000000000002e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  28.25 
 
 
433 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4664  amine oxidase  28.04 
 
 
418 aa  83.2  0.000000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.636911  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0581  amine oxidase  32.82 
 
 
413 aa  76.3  0.0000000000009  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.327293  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  26.06 
 
 
434 aa  67.8  0.0000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  24.89 
 
 
589 aa  65.5  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  25.79 
 
 
474 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  23.4 
 
 
465 aa  65.1  0.000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01721  phytoene desaturase  24.42 
 
 
473 aa  63.5  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.69255  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.84 
 
 
460 aa  61.2  0.00000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  22.66 
 
 
466 aa  60.1  0.00000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3827  phytoene desaturase  30.14 
 
 
489 aa  58.9  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.47122  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2122  amine oxidase  31.48 
 
 
465 aa  58.5  0.0000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000160745 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_47627  Amine oxidase  25.41 
 
 
552 aa  58.5  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599395 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2159  squalene-associated FAD-dependent desaturase  26.18 
 
 
441 aa  58.2  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23220  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  24.94 
 
 
464 aa  57  0.0000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8148  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 
557 aa  57  0.0000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  23.79 
 
 
463 aa  56.6  0.0000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  33.06 
 
 
468 aa  55.1  0.000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0804  hypothetical protein  32.23 
 
 
468 aa  54.7  0.000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.230959  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  37.04 
 
 
502 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  37.04 
 
 
502 aa  53.5  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  38.89 
 
 
466 aa  53.1  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2373  phytoene desaturase  50.98 
 
 
519 aa  53.5  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.145608  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1510  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  40.28 
 
 
464 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  26.6 
 
 
468 aa  53.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  40.91 
 
 
354 aa  53.1  0.000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02161  phytoene desaturase  40.28 
 
 
462 aa  53.1  0.000009  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  25.71 
 
 
460 aa  53.1  0.00001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  32.69 
 
 
469 aa  53.1  0.00001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  34.72 
 
 
472 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  35.16 
 
 
436 aa  52.4  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00915  CrtI1  42 
 
 
488 aa  51.6  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  25.26 
 
 
492 aa  52  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  26.86 
 
 
419 aa  52  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  30.73 
 
 
476 aa  51.2  0.00003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2030  phytoene desaturase  24.81 
 
 
501 aa  51.2  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  41.89 
 
 
456 aa  51.6  0.00003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  29.17 
 
 
465 aa  51.2  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05910  amine oxidase, putative  40.3 
 
 
537 aa  51.2  0.00004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0298175  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4269  amine oxidase  29.09 
 
 
445 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2082  amine oxidase  41.12 
 
 
382 aa  51.2  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.255698  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4000  amine oxidase (flavin-containing)  60.47 
 
 
499 aa  50.4  0.00005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.812077  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0838  Putrescine oxidase  49.09 
 
 
463 aa  50.8  0.00005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.272774  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01891  zeta-carotene desaturase  22.7 
 
 
486 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.905208  normal  0.646889 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  27.27 
 
 
441 aa  50.4  0.00006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  26.05 
 
 
472 aa  50.4  0.00006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4155  amine oxidase (flavin-containing)  41.89 
 
 
465 aa  50.4  0.00006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.326684  normal  0.0591967 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.87 
 
 
477 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04430  phytoene desaturase  39.76 
 
 
548 aa  50.1  0.00008  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
530 aa  50.1  0.00008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5205  amine oxidase  45.33 
 
 
565 aa  49.7  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30 
 
 
469 aa  49.7  0.00009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  40.62 
 
 
400 aa  50.1  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
530 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 
530 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4699  amine oxidase  50 
 
 
445 aa  49.7  0.00009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0922876  normal  0.472473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  23.75 
 
 
647 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21220  phytoene desaturase  36.07 
 
 
566 aa  49.7  0.0001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  30.1 
 
 
467 aa  49.7  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0435  gamma-carotene desaturase  25.95 
 
 
639 aa  49.3  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0298  carotene 7,8-desaturase  38.89 
 
 
472 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  53.66 
 
 
487 aa  49.3  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.5 
 
 
474 aa  49.7  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  38.89 
 
 
479 aa  49.3  0.0001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2008  amine oxidase, flavin-containing  44.19 
 
 
478 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  39.06 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  39.06 
 
 
401 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  34.38 
 
 
396 aa  48.9  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1484  zeta-carotene desaturase  22.27 
 
 
486 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.22429  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1454  amine oxidase  40.51 
 
 
456 aa  48.9  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.162575  normal  0.372865 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2395  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  37.5 
 
 
472 aa  48.5  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4976  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
515 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  42.11 
 
 
314 aa  48.9  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1602  UDP-galactopyranose mutase  32.99 
 
 
369 aa  48.5  0.0002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0347601  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>