144 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0584 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  100 
 
 
400 aa  802    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  97.74 
 
 
401 aa  761    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  97.74 
 
 
401 aa  761    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0629  amine oxidase  70.57 
 
 
405 aa  545  1e-154  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  42.25 
 
 
399 aa  306  4.0000000000000004e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0201  FAD dependent oxidoreductase  42.61 
 
 
399 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000357906 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  40.9 
 
 
400 aa  300  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2137  amine oxidase  39.15 
 
 
396 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0697348 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1934  amine oxidase  37.41 
 
 
396 aa  283  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2115  FAD dependent oxidoreductase  39.65 
 
 
397 aa  278  2e-73  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0248  protoporphyrinogen oxidase, putative  37.31 
 
 
398 aa  271  2e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  38.9 
 
 
412 aa  266  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  36.66 
 
 
397 aa  261  1e-68  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2269  FAD dependent oxidoreductase  37.41 
 
 
399 aa  259  5.0000000000000005e-68  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.85 
 
 
467 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  23.47 
 
 
488 aa  63.5  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  27.63 
 
 
447 aa  60.5  0.00000005  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  24.52 
 
 
469 aa  60.1  0.00000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  23.19 
 
 
472 aa  59.7  0.00000008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  25.33 
 
 
477 aa  59.7  0.00000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2771  protoporphyrinogen oxidase  28.22 
 
 
491 aa  57.8  0.0000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0700296  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  30.26 
 
 
469 aa  56.2  0.0000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  22.35 
 
 
463 aa  56.2  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  24.74 
 
 
490 aa  53.9  0.000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  22.86 
 
 
469 aa  53.5  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3017  hypothetical protein  50 
 
 
484 aa  53.1  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.191221  normal  0.019056 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.76 
 
 
421 aa  53.1  0.000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  23.97 
 
 
470 aa  52.8  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  23.17 
 
 
495 aa  52.4  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3185  hypothetical protein  44.64 
 
 
245 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.29229  hitchhiker  0.00171019 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2893  amine oxidase  42.42 
 
 
456 aa  51.6  0.00002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.400001  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4135  carotene 7,8-desaturase  41.1 
 
 
451 aa  51.2  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.792405 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  27.08 
 
 
465 aa  50.8  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20 
 
 
441 aa  50.8  0.00004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26240  monoamine oxidase  28.05 
 
 
418 aa  50.8  0.00004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.67782  normal  0.0649912 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  20.82 
 
 
471 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  22.02 
 
 
476 aa  50.4  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  25.17 
 
 
475 aa  50.1  0.00008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2794  amine oxidase  40.62 
 
 
431 aa  49.7  0.00008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.304953  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  47.27 
 
 
346 aa  49.7  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  26.99 
 
 
471 aa  49.3  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  27.93 
 
 
482 aa  49.3  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0389  amine oxidase  28.73 
 
 
449 aa  49.3  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.22597  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3148  amine oxidase  45.45 
 
 
527 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0719859  normal  0.0908383 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  49.12 
 
 
545 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0073  amine oxidase  45.83 
 
 
474 aa  49.3  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  25.19 
 
 
436 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09643  hypothetical protein  41.38 
 
 
535 aa  48.1  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0783431  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0544  amine oxidase  44.07 
 
 
525 aa  48.1  0.0002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00189501  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  25.61 
 
 
470 aa  48.5  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  24.35 
 
 
476 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  27.06 
 
 
460 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1906  amine oxidase (flavin-containing)  60.98 
 
 
487 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.46762  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0204  amine oxidase  25.25 
 
 
435 aa  47.8  0.0003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.420312  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  31.2 
 
 
436 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  32 
 
 
479 aa  47.8  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  31.2 
 
 
436 aa  47.4  0.0004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1684  phytoene desaturase  42.65 
 
 
506 aa  47.4  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.127101  normal  0.929667 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2043  amine oxidase  44.64 
 
 
476 aa  47.4  0.0004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0112057  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  31.2 
 
 
436 aa  47.8  0.0004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  23.17 
 
 
439 aa  47.4  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4081  amine oxidase  49.09 
 
 
571 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.39239 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1116  hypothetical protein  50 
 
 
492 aa  47  0.0006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.993784 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  23.53 
 
 
473 aa  47  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  20.43 
 
 
447 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  35.38 
 
 
599 aa  46.6  0.0007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2058  NAD/FAD-binding protein-like protein  20.15 
 
 
408 aa  46.6  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00023874  normal  0.0560685 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3011  All-trans-retinol 13,14-reductase  36.08 
 
 
544 aa  46.6  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  25.76 
 
 
488 aa  47  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  29.94 
 
 
433 aa  46.6  0.0008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  21.59 
 
 
435 aa  46.2  0.0009  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1785  amine oxidase flavin-containing  42.59 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.162076  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  39.06 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  40.3 
 
 
461 aa  46.2  0.001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1888  carotenoid isomerase, putative  44.83 
 
 
505 aa  45.8  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1924  amine oxidase, flavin-containing  42.59 
 
 
478 aa  46.2  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00199174  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  36.51 
 
 
523 aa  46.2  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2583  squalene synthase  38.18 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.063443  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2637  squalene synthase  38.18 
 
 
502 aa  46.2  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.359925  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1146  hypothetical protein  42.86 
 
 
468 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  27.52 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  20.62 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  39.06 
 
 
436 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  43.1 
 
 
436 aa  46.2  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  25.09 
 
 
482 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1285  FAD dependent oxidoreductase  40.7 
 
 
371 aa  46.2  0.001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  20.56 
 
 
473 aa  45.8  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0626  carotenoid isomerase, putative  46.55 
 
 
507 aa  45.4  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1779  amine oxidase  29 
 
 
420 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0331909  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1995  All-trans-retinol 13,14-reductase  37.5 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4075  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  51.28 
 
 
484 aa  45.1  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  36.46 
 
 
556 aa  45.4  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1529  hypothetical protein  42.86 
 
 
468 aa  45.1  0.002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2074  amine oxidase  42.62 
 
 
479 aa  45.4  0.002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  39.29 
 
 
434 aa  45.1  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  23.75 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2875  phytoene desaturase  35.38 
 
 
479 aa  45.4  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.202948  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  47.54 
 
 
503 aa  44.7  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4061  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain-containing protein  53.85 
 
 
476 aa  44.7  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3115  FAD-dependent oxidoreductase of HI0933-like family protein  59.46 
 
 
400 aa  44.3  0.003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>