93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3587 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011886  Achl_3587  amine oxidase  100 
 
 
461 aa  934    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2837  amine oxidase  30 
 
 
448 aa  169  1e-40  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  hitchhiker  0.00868437  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0806  amine oxidase  24.84 
 
 
726 aa  75.9  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1178  amine oxidase  27.62 
 
 
454 aa  62.4  0.00000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0392628  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2710  twin-arginine translocation pathway signal  22.88 
 
 
469 aa  62.8  0.00000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  25.3 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3715  twin-arginine translocation pathway signal  25 
 
 
550 aa  62  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.697054  normal  0.0792167 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  25.14 
 
 
469 aa  60.1  0.00000008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  24.53 
 
 
469 aa  55.1  0.000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  20.73 
 
 
441 aa  55.1  0.000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  23.48 
 
 
469 aa  53.1  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0811  phytoene dehydrogenase  37.36 
 
 
523 aa  52.4  0.00002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0324739  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1310  putative protoporphyrinogen oxidase  24.83 
 
 
432 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.643053  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1724  putative oxidoreductase  24.83 
 
 
432 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0447228  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1808  putative oxidoreductase  24.83 
 
 
432 aa  52  0.00002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0286  putative protoporphyrinogen oxidase  24.83 
 
 
432 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0469337  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1008  putative protoporphyrinogen oxidase  24.83 
 
 
432 aa  52  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.961775  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  38.96 
 
 
424 aa  51.6  0.00003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  26.16 
 
 
421 aa  51.6  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  23.92 
 
 
435 aa  51.6  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01611  phytoene desaturase  21.8 
 
 
466 aa  50.8  0.00005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1802  amine oxidase  24.43 
 
 
439 aa  50.8  0.00005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.0000252839  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  22.24 
 
 
473 aa  50.4  0.00007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  22.24 
 
 
473 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_715  FAD dependent oxidoreductase  31.62 
 
 
500 aa  50.1  0.00009  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  26.77 
 
 
495 aa  49.3  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  24.5 
 
 
479 aa  49.7  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_40191  amine oxidase  34.91 
 
 
468 aa  49.3  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.389508  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  24.1 
 
 
467 aa  48.5  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1366  amine oxidase  21.73 
 
 
523 aa  49.3  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  decreased coverage  0.00171854  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  23.8 
 
 
473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  25.97 
 
 
484 aa  48.5  0.0002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  22.24 
 
 
473 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4331  Amine oxidase (flavin-containing)  26.9 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0789189 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4441  Amine oxidase (flavin-containing)  26.9 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.358617 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1827  amine oxidase  37.63 
 
 
433 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1188  phytoene desaturase  43.04 
 
 
461 aa  47.8  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.045363  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0619  amine oxidase  41.79 
 
 
401 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1113  putative amine oxidase  23.79 
 
 
503 aa  47.4  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0611  amine oxidase  41.79 
 
 
401 aa  47.8  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0737484  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  21.76 
 
 
473 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  23.68 
 
 
509 aa  47.4  0.0006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  26.02 
 
 
467 aa  47.4  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1869  amine oxidase  23.25 
 
 
462 aa  47.4  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.773785 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  22.15 
 
 
397 aa  47  0.0006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  23.89 
 
 
482 aa  47  0.0007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0731  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  34.07 
 
 
500 aa  47  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.444322  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0283  putative oxidoreductase  24.83 
 
 
1309 aa  47  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  22.07 
 
 
473 aa  47  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  22.07 
 
 
473 aa  47  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  22.07 
 
 
473 aa  47  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  22.07 
 
 
473 aa  47  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  33.62 
 
 
453 aa  46.6  0.001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.15 
 
 
459 aa  45.8  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0146  three-step phytoene desaturase / zeta-carotene desaturase  21.17 
 
 
465 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0584  UDP-galactopyranose mutase  40.3 
 
 
400 aa  45.8  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.17 
 
 
466 aa  46.6  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  25.97 
 
 
499 aa  45.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  33.33 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  23.15 
 
 
459 aa  45.8  0.002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0732  amine oxidase  40.79 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.328082 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2742  twin-arginine translocation pathway signal  26.54 
 
 
490 aa  45.4  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00724146  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  29.73 
 
 
466 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  29.73 
 
 
466 aa  45.4  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1418  polyamine oxidase  46.15 
 
 
436 aa  45.4  0.002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.103525  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  35.35 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  40.26 
 
 
454 aa  45.1  0.003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  35.35 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  22.48 
 
 
447 aa  45.1  0.003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  28.97 
 
 
496 aa  45.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  22.24 
 
 
490 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  35.35 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  21.84 
 
 
488 aa  45.1  0.003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0956  amine oxidase  37.33 
 
 
434 aa  45.1  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.618507  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  35.35 
 
 
436 aa  45.1  0.003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  22.05 
 
 
431 aa  43.9  0.005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  36.84 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  36.84 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  36.84 
 
 
451 aa  43.9  0.006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  38.36 
 
 
460 aa  43.9  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_38345  predicted protein  36.49 
 
 
599 aa  43.9  0.007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.526893  normal  0.29017 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3831  amine oxidase  26.69 
 
 
438 aa  43.9  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  35.51 
 
 
436 aa  43.5  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  22.06 
 
 
471 aa  43.5  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  25.45 
 
 
472 aa  43.5  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  41.07 
 
 
722 aa  43.5  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1556  amine oxidase (flavin-containing)  25.38 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1580  amine oxidase (flavin-containing)  25.38 
 
 
450 aa  43.5  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  32.54 
 
 
436 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  22.76 
 
 
437 aa  43.1  0.009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0291  protoporphyrinogen oxidase, putative  25.9 
 
 
412 aa  43.5  0.009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.695837  normal  0.0192055 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3835  amine oxidase  33.66 
 
 
573 aa  43.1  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.888346  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0148  amine oxidase  22.57 
 
 
531 aa  43.1  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.688575 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>