196 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A0501 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A0501  hypothetical protein  100 
 
 		 437 aa  901    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1492  hypothetical protein  41.47 
 
 		 436 aa  315  8e-85  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.0711656 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0725  hypothetical protein  41.96 
 
 		 410 aa  312  5.999999999999999e-84  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00111805  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0519  hypothetical protein  39.17 
 
 		 412 aa  295  1e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.696387  normal  0.911419 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0060  hypothetical protein  38.69 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1642  hypothetical protein  38.98 
 
 		 437 aa  294  2e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.608904  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1597  hypothetical protein  39.63 
 
 		 412 aa  288  2e-76  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0694  hypothetical protein  39.19 
 
 		 409 aa  273  5.000000000000001e-72  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.452898  normal  0.129497 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2149  hypothetical protein  33.79 
 
 		 429 aa  235  2.0000000000000002e-60  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.226037  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0082  amine oxidase  33.18 
 
 		 436 aa  215  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0179  hypothetical protein  31.05 
 
 		 448 aa  204  3e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0088  hypothetical protein  30.21 
 
 		 448 aa  202  9.999999999999999e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.220394  normal  0.164147 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0893  hypothetical protein  32.8 
 
 		 427 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0168  hypothetical protein  33.02 
 
 		 414 aa  191  2e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.386655  normal  0.68498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3170  hypothetical protein  30.59 
 
 		 439 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1552  hypothetical protein  30.41 
 
 		 435 aa  190  4e-47  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.113177  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3789  hypothetical protein  31.95 
 
 		 427 aa  190  5e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.673359 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1133  hypothetical protein  32.78 
 
 		 450 aa  190  5e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1705  hypothetical protein  30.84 
 
 		 436 aa  185  1.0000000000000001e-45  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.823957 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3973  hypothetical protein  31.2 
 
 		 450 aa  179  5.999999999999999e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0831495  normal  0.0100129 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0829  hypothetical protein  29.57 
 
 		 448 aa  172  6.999999999999999e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.476785  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4795  hypothetical protein  31.19 
 
 		 419 aa  170  5e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.173425  normal  0.558478 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2794  hypothetical protein  29.45 
 
 		 429 aa  167  2.9999999999999998e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0325  hypothetical protein  30.61 
 
 		 428 aa  164  3e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0140  hypothetical protein  29.91 
 
 		 432 aa  163  7e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.63632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0059  hypothetical protein  29.84 
 
 		 453 aa  163  7e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1155  hypothetical protein  28.47 
 
 		 423 aa  154  2.9999999999999998e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1302  hypothetical protein  28.17 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1319  hypothetical protein  28.17 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.150757 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1338  hypothetical protein  28.17 
 
 		 445 aa  136  6.0000000000000005e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.601176 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3309  amine oxidase  24.47 
 
 		 484 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4465  amine oxidase  23.7 
 
 		 480 aa  82  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0045  hypothetical protein  23.87 
 
 		 472 aa  80.1  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00889429  hitchhiker  0.00142526 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0984  amine oxidase  23.4 
 
 		 520 aa  78.6  0.0000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.01 
 
 		 482 aa  72  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1747  carotene 7,8-desaturase  21.75 
 
 		 481 aa  68.9  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.969616 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2305  glycosyl transferase family 2  25.47 
 
 		 722 aa  68.9  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0138852  normal  0.273361 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0893  amine oxidase  25.63 
 
 		 431 aa  67.8  0.0000000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373233 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  22.5 
 
 		 460 aa  66.6  0.0000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0036  UDP-galactopyranose mutase  22.39 
 
 		 647 aa  66.2  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.404508  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3095  hypothetical protein  22.43 
 
 		 500 aa  64.7  0.000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1637  hypothetical protein  22.67 
 
 		 516 aa  64.7  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.252141 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0902  hypothetical protein  22.65 
 
 		 465 aa  64.3  0.000000004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.787196  normal  0.0359011 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1706  hypothetical protein  23.28 
 
 		 465 aa  63.9  0.000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.186838  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0966  UDP-galactopyranose mutase  24.31 
 
 		 447 aa  62.4  0.00000001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0308  phytoene desaturase  24.15 
 
 		 475 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.105357  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2550  hypothetical protein  23.49 
 
 		 436 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01331  zeta-carotene desaturase  22.11 
 
 		 484 aa  61.6  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3497  amine oxidase  23.08 
 
 		 507 aa  61.6  0.00000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.281636  normal  0.0813869 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0308  phytoene desaturase  24.15 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8013  hypothetical protein  22.27 
 
 		 524 aa  60.8  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01321  zeta-carotene desaturase  22.07 
 
 		 484 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  24.4 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  24.4 
 
 		 466 aa  61.2  0.00000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1875  Rieske (2Fe-2S) domain protein  26.36 
 
 		 639 aa  60.8  0.00000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0135993 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0884  Carotene 7,8-desaturase  25.7 
 
 		 460 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000776733  normal  0.0521549 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  24.62 
 
 		 449 aa  60.1  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2036  amine oxidase, flavin-containing  24.31 
 
 		 459 aa  60.1  0.00000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4795  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  25.78 
 
 		 479 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000234203  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2284  hypothetical protein  23.27 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2453  hypothetical protein  23.27 
 
 		 436 aa  58.5  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.871456  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0862  UDP-galactopyranose mutase  22.54 
 
 		 424 aa  58.5  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.804118  normal  0.0706079 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2236  hypothetical protein  22.95 
 
 		 500 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0391032 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_55102  phytoene desaturase  23.09 
 
 		 589 aa  58.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.989776  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4188  phytoene desaturase  23.74 
 
 		 477 aa  58.2  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.422832  normal  0.265876 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01291  zeta-carotene desaturase  22.75 
 
 		 484 aa  58.2  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1983  zeta-carotene desaturase / three-step phytoene desaturase  23.55 
 
 		 474 aa  57.4  0.0000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.490957  normal  0.280593 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0065  protoporphyrinogen oxidase  23.96 
 
 		 459 aa  57.4  0.0000005  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2471  hypothetical protein  23.67 
 
 		 436 aa  57  0.0000006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3374  amine oxidase  19.55 
 
 		 512 aa  57  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0118  zeta-carotene desaturase  22.59 
 
 		 499 aa  56.6  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0534  amine oxidase  25.19 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.666818  normal  0.352078 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2921  hypothetical protein  23.27 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0819317 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0517  amine oxidase  25.19 
 
 		 647 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  25.81 
 
 		 421 aa  56.2  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2262  amine oxidase  23.36 
 
 		 436 aa  56.2  0.000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0239134  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  26.3 
 
 		 548 aa  55.1  0.000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4868  amine oxidase  23.23 
 
 		 645 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26651  phytoene desaturase  23.33 
 
 		 472 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3736  amine oxidase  22.1 
 
 		 520 aa  54.7  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.595542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3577  UDP-galactopyranose mutase  22.63 
 
 		 648 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0482479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1157  phytoene desaturase  26.17 
 
 		 471 aa  53.9  0.000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0682  Putrescine oxidase  24.71 
 
 		 512 aa  53.9  0.000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.016891  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4898  hypothetical protein  24.02 
 
 		 494 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.00550747  normal  0.0440629 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  24.79 
 
 		 470 aa  53.9  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2205  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.63 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4196  amine oxidase  20.09 
 
 		 496 aa  53.5  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.956515 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01591  phytoene desaturase  22.55 
 
 		 472 aa  53.5  0.000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2649  hypothetical protein  22.62 
 
 		 498 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0340038  normal  0.0581443 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2247  phytoene dehydrogenase related enzyme  23.45 
 
 		 436 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0299983  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1698  Rieske (2Fe-2S) domain protein  25.1 
 
 		 640 aa  52.8  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2820  phytoene desaturase  25.18 
 
 		 498 aa  53.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2410  hypothetical protein  22.6 
 
 		 436 aa  53.1  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2888  UDP-galactopyranose mutase  25.94 
 
 		 364 aa  53.1  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.656694  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2468  amine oxidase, flavin-containing  37.66 
 
 		 422 aa  53.1  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2861  hypothetical protein  24.81 
 
 		 511 aa  53.1  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.245537 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0368  amine oxidase  25.36 
 
 		 503 aa  52  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3041  Carotene 7,8-desaturase  24.69 
 
 		 463 aa  52  0.00002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000261003 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01631  phytoene desaturase  21.6 
 
 		 466 aa  52  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2540  FAD dependent oxidoreductase  23.38 
 
 		 397 aa  52.4  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>